牦牛GDF-10、IHH、MC4R基因的多态与生长性状的相关性研究
发布时间：2023-03-05 09:42
本研究选取了3个地方牦牛品种(甘肃甘南牦牛、甘肃天祝牦牛、西藏帕里牦牛)和1个培育品种(青海大通牦牛)为研究对象，应用分子生物技术对牦牛GDF-10基因、IHH基因、MC4R基因多态性与生长性状的相关性进行研究，同时应用实时荧光定量PCR技术，对GDF-10基因、IHH基因、MC4R基因在牦牛不同组织中的表达规律进行分析。筛选与牦牛生长发育有关的遗传标记，为牦牛分子育种提供理论基础。主要研究结果如下： 1.GDF-10基因、IHH基因和MC4R基因在牦牛组织中的表达谱 GDF-10基因、IHH基因和MC4R基因在牦牛的心脏、肝脏、胰腺、肌肉、肺和卵巢等所研究的8个部位都有表达，其中GDF-10基因主要在牦牛脾脏和卵巢组织中高度表达，IHH基因主要在心脏、脾脏和肌肉组织中高度表达，MC4R基因主要在肾脏、胰脏和肌肉组织中高度表达。 2.GDF-10基因的多态性及其与牦牛生产性状的关联性分析 检测到牦牛GDF-10基因外显子区域3个多态位点12116（G/A）、12152（C/T）、和13041（T/C），3个多态位点均表现为低度多态（PIC<0.25），三个多态位点之间存在弱连锁平...
【文章页数】：85 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
Summary
缩略词对照表
第一章 绪论
1.1 牦牛概况
1.1.1 牦牛种质资源概述
1.1.2 牦牛分子育种研究概述
1.1.2.1 牦牛分子育种研究背景
1.1.2.2 牦牛分子育种研究的必要性
1.1.2.3 牦牛分子育种研究进展
1.2 SNP 分子标记的研究进展
1.2.1 分子标记的研究进展
1.2.2 SNP 的特点和检测
1.3 基因分型技术研究进展
1.4 实时荧光定量 PCR
1.5 GDF-10 基因的研究进展
1.5.1 GDF-10 家族简介
1.5.2 GDF-10 基因的结构和功能
1.5.3 GDF-10 基因的表达
1.6 IHH 基因的研究进展
1.6.1 IHH 基因的家族简介
1.6.2 IHH 基因的结构和功能
1.6.3 IHH 基因的表达研究
1.7 MC4R 基因的研究进展
1.7.1 MC4R 基因家族简介
1.7.2 MC4R 基因结构和功能
1.7.3 MC4R 基因表达
1.8 实验的目的和意义
1.9 实验的技术路线
第二章 材料与方法
2.1 材料
2.1.1 实验所用牦牛血样及组织样
2.1.2 生产性状指标
2.2 主要仪器设备与试剂
2.3 试验方法
2.3.1 基因组 DNA 的提取和检测
2.3.2 混合 DNA 池的构建
2.3.3 RNA 的提取和质量测定
2.3.4 引物设计和稀释
2.3.4.1 GDF-10 基因引物设计
2.3.4.2 IHH 基因引物设计
2.3.4.3 MC4R 基因引物设计
2.3.5 实时定量 PCR 扩增
2.3.6 DNA 扩增和产物纯化
2.3.7 HRM 小片段法基因分型和测序
2.4 数据统计
第三章 结果与分析
3.1 基因组 DNA 的提取和扩增结果
3.2 RNA 的提取结果
3.3 牦牛候选基因组织表达谱分析
3.3.1 牦牛 GDF-10 基因的组织表达谱分析
3.3.2 牦牛 IHH 基因的组织表达谱分析
3.3.3 牦牛 MC4R 基因的组织表达谱分析
3.4 牦牛 GDF-10 基因外显子区域多态位点的统计分析
3.4.1 牦牛 GDF-10 基因 HRM 方法的分型
3.4.2 牦牛 GDF-10 基因多态位点遗传多态性的分析
3.4.2.1 牦牛 GDF-10 基因的基因型频率、基因频率
3.4.2.2 牦牛 GDF-10 基因群体遗传特性
3.4.2.3 牦牛 GDF-10 基因的单倍型分析
3.4.2.4 牦牛 GDF-10 基因基因型及单倍型与体尺性状的关联性分析
3.5 牦牛 IHH 基因外显子区域多态位点的统计分析
3.5.1 牦牛 IHH 基因 HRM 方法的分型
3.5.2 牦牛 IHH 基因多态位点遗传多态性的分析
3.5.2.1 牦牛 IHH 基因的基因型频率、基因频率
3.5.2.2 牦牛 IHH 基因群体遗传特性
3.5.2.3 牦牛 IHH 基因的单倍型分析
3.5.2.4 牦牛 IHH 基因基因型及基因型组合与体尺性状的关联性分析
3.6 牦牛 MC4R 基因基因型及单倍型与体尺性状的关联性分析
3.6.1 牦牛 MC4R 基因 HRM 方法的分型
3.6.2 牦牛 MC4R 基因多态位点遗传多态性的分析
3.6.2.1 牦牛 MC4R 基因的基因型频率、基因频率
3.6.2.2 牦牛 MC4R 基因群体遗传特性
3.6.2.3 牦牛 MC4R 基因基因型与体尺性状的关联性分析
第四章 讨论
4.1 采样及实验方法的分析
4.1.1 牦牛血样的采集及 DNA 的提取
4.1.2 SNP 筛查
4.1.3 影响基因分型的因素
4.2 牦牛候选基因的组织表达谱分析
4.3 牦牛 GDF-10 基因遗传分析
4.4 牦牛 IHH 基因遗传分析
4.5 牦牛 MC4R 基因遗传分析
第五章 结论
参考文献
致谢
个人简介
导师简介
附录
本文编号：3755960
【文章页数】：85 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
Summary
缩略词对照表
第一章 绪论
1.1 牦牛概况
1.1.1 牦牛种质资源概述
1.1.2 牦牛分子育种研究概述
1.1.2.1 牦牛分子育种研究背景
1.1.2.2 牦牛分子育种研究的必要性
1.1.2.3 牦牛分子育种研究进展
1.2 SNP 分子标记的研究进展
1.2.1 分子标记的研究进展
1.2.2 SNP 的特点和检测
1.3 基因分型技术研究进展
1.4 实时荧光定量 PCR
1.5 GDF-10 基因的研究进展
1.5.1 GDF-10 家族简介
1.5.2 GDF-10 基因的结构和功能
1.5.3 GDF-10 基因的表达
1.6 IHH 基因的研究进展
1.6.1 IHH 基因的家族简介
1.6.2 IHH 基因的结构和功能
1.6.3 IHH 基因的表达研究
1.7 MC4R 基因的研究进展
1.7.1 MC4R 基因家族简介
1.7.2 MC4R 基因结构和功能
1.7.3 MC4R 基因表达
1.8 实验的目的和意义
1.9 实验的技术路线
第二章 材料与方法
2.1 材料
2.1.1 实验所用牦牛血样及组织样
2.1.2 生产性状指标
2.2 主要仪器设备与试剂
2.3 试验方法
2.3.1 基因组 DNA 的提取和检测
2.3.2 混合 DNA 池的构建
2.3.3 RNA 的提取和质量测定
2.3.4 引物设计和稀释
2.3.4.1 GDF-10 基因引物设计
2.3.4.2 IHH 基因引物设计
2.3.4.3 MC4R 基因引物设计
2.3.5 实时定量 PCR 扩增
2.3.6 DNA 扩增和产物纯化
2.3.7 HRM 小片段法基因分型和测序
2.4 数据统计
第三章 结果与分析
3.1 基因组 DNA 的提取和扩增结果
3.2 RNA 的提取结果
3.3 牦牛候选基因组织表达谱分析
3.3.1 牦牛 GDF-10 基因的组织表达谱分析
3.3.2 牦牛 IHH 基因的组织表达谱分析
3.3.3 牦牛 MC4R 基因的组织表达谱分析
3.4 牦牛 GDF-10 基因外显子区域多态位点的统计分析
3.4.1 牦牛 GDF-10 基因 HRM 方法的分型
3.4.2 牦牛 GDF-10 基因多态位点遗传多态性的分析
3.4.2.1 牦牛 GDF-10 基因的基因型频率、基因频率
3.4.2.2 牦牛 GDF-10 基因群体遗传特性
3.4.2.3 牦牛 GDF-10 基因的单倍型分析
3.4.2.4 牦牛 GDF-10 基因基因型及单倍型与体尺性状的关联性分析
3.5 牦牛 IHH 基因外显子区域多态位点的统计分析
3.5.1 牦牛 IHH 基因 HRM 方法的分型
3.5.2 牦牛 IHH 基因多态位点遗传多态性的分析
3.5.2.1 牦牛 IHH 基因的基因型频率、基因频率
3.5.2.2 牦牛 IHH 基因群体遗传特性
3.5.2.3 牦牛 IHH 基因的单倍型分析
3.5.2.4 牦牛 IHH 基因基因型及基因型组合与体尺性状的关联性分析
3.6 牦牛 MC4R 基因基因型及单倍型与体尺性状的关联性分析
3.6.1 牦牛 MC4R 基因 HRM 方法的分型
3.6.2 牦牛 MC4R 基因多态位点遗传多态性的分析
3.6.2.1 牦牛 MC4R 基因的基因型频率、基因频率
3.6.2.2 牦牛 MC4R 基因群体遗传特性
3.6.2.3 牦牛 MC4R 基因基因型与体尺性状的关联性分析
第四章 讨论
4.1 采样及实验方法的分析
4.1.1 牦牛血样的采集及 DNA 的提取
4.1.2 SNP 筛查
4.1.3 影响基因分型的因素
4.2 牦牛候选基因的组织表达谱分析
4.3 牦牛 GDF-10 基因遗传分析
4.4 牦牛 IHH 基因遗传分析
4.5 牦牛 MC4R 基因遗传分析
第五章 结论
参考文献
致谢
个人简介
导师简介
附录
本文编号：3755960
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