基于转录组测序筛选山羊卵泡发育相关上调基因

发布时间：2023-03-11 18:18

　　本研究旨在通过转录组测序筛选并研究与卵泡发育相关的上调表达基因。以3只健康的1岁龄贵州白山羊为供试对象,在其发情3 d后,屠宰并采集卵巢中的优势卵泡与从属卵泡,分离颗粒细胞,转录组测序。通过生物信息学分析,并对其中的上调表达基因进行GO、KEGG信号通路分析,经实时荧光定量PCR对筛选出的上调表达基因进行验证。结果显示:GO分析共分为三大类别44组,其中参与生物学过程(BP)的基因占72.7%,参与细胞组分(CC)的基因占13.6%,参与分子功能(MF)的基因占13.6;KEGG信号通路分析发现20条通路,其中参与核糖体通路基因富集最为显著。共筛选出4个可能促进山羊卵泡发育的基因(CALM2、TUT7、LUM和PDLIM3)。荧光定量PCR结果表明,TUT7和CALM2在优势卵泡颗粒细胞中的表达量显著高于从属卵泡。本研究推测获得的2个上调表达基因可能会促进卵泡的发育,从而导致优势卵泡被选择。

【文章页数】：6 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 实验动物及样品采集
    1.2 总RNA提取、文库构建及测序
    1.3 数据处理及分析
    1.4 反转录及引物合成
    1.5 荧光定量PCR鉴定
    1.6 统计分析
2 结果
    2.1 贵州白山羊卵泡颗粒细胞中上调表达基因的筛
    2.2 山羊卵泡颗粒细胞中上调基因GO功能富集
    2.3 山羊卵泡颗粒细胞中上调基因KEGG信号通路分析
    2.4 山羊卵泡颗粒细胞中上调基因验证结果分析
3 讨论
4 结论



本文编号：3760007