五指山猪肌肉和脂肪组织miRNA的鉴定与分析

发布时间：2023-03-19 22:46

　　为了鉴定和分析五指山猪不同部位肌肉和脂肪组织中差异表达的微小RNA (miRNA),采用高通量测序和生物信息学方法对五指山猪肌肉和脂肪组织中的miRNA进行分析筛选,运用DESeq分别鉴定背最长肌和半腱肌、背部和腹部皮下脂肪组织间差异表达的miRNA,并对miRNA进行靶基因预测分析。结果:在五指山猪肌肉组织中共鉴定出344个miRNA,其中已知miRNA 256个、新预测miRNA 88个,肌肉组织中预测到靶基因9 712个;在五指山猪皮下脂肪组织中共鉴定出447个miRNA,其中已知miRNA 279个、新预测miRNA 168个,脂肪组织中预测到靶基因11 510个;五指山猪背最长肌与半腱肌间存在41个差异表达的miRNA,腹部皮下脂肪与背部皮下脂肪间存在83个差异表达的miRNA。本试验为进一步研究miRNA调控猪骨骼肌和皮下脂肪发育的分子机制提供科学依据。

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【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 样品采集
    1.2 主要试剂
    1.3 肌肉和脂肪组织总RNA提取
    1.4 miRNA文库构建与测序数据分析
    1.5 miRNA的鉴定
    1.6 miRNA的差异表达分析
    1.7 miRNA靶基因的预测分析
2 结果与分析
    2.1 五指山猪肌肉和脂肪组织miRNA测序数据质量分析
    2.2 五指山猪肌肉和脂肪组织miRNA鉴定分析
    2.3 五指山猪肌肉和脂肪组织miRNA差异表达分析
    2.4 miRNA靶基因的预测分析
3 讨论
4 结论



本文编号：3766138