一例PPRV阳性羊鼻拭子样本N、P、M、F、H基因的序列测定和遗传进化分析

发布时间：2023-04-02 12:24

　　为对采集自昆明某大型牲畜交易市场的一例PPRV阳性鼻拭子样本进行追根溯源,设计引物采用RT-PCR方法进行PPRV病毒基因组关键基因N、P、M、F、H核苷酸序列扩增,并进行序列测定和遗传进化分析。结果显示:N、P、M、F、H基因均有预期片段扩增,其读码框(ORF)长度分别为1 578、1 531、1 008、1 641及1 830 nt;N、P、M、F及H构建的遗传进化树均显示所测毒株为基因Ⅳ型,同2013年在新疆伊犁山羊中检测到的毒株(KM091959)同源性最高,N、P、M、F、H核苷酸同源性分别为99.2%、99.0%、99.4%、99.6%和99.3%,推断氨基酸同源性分别为98.7%、98.4%、100.0%、99.8%和99.3%。研究表明,检测到的毒株仍为2013～2014年我国PPRV流行期的基因Ⅳ型毒株,变异较小;所测毒株的N、P、M、F、H 5个关键基因中,M基因最保守、其次是F/H基因,而N、P基因略有变异。

【文章页数】：6 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 试验材料
        1.1.1 试验样本
        1.1.2 试剂及仪器
        1.1.3 引物及探针
    1.2 试验方法
        1.2.1 病毒基因组RNA提取
        1.2.2 反应体系及反应程序
        1.2.3 RT-PCR扩增片段的纯化回收、克隆及序列测定
2 结果与分析
    2.1 PPRV阳性32号鼻拭子样本N、P、M、F、H基因的RT-PCR扩增结果（见图1)
    2.2 PPRV阳性32号鼻拭子样本N基因遗传进化分析（见图2，表2～表4)
    2.3 PPRV阳性32号鼻拭子样本P基因遗传进化分析（见图3、表3、表4)
    2.4 PPRV阳性32号鼻拭子样本M基因遗传进化分析（见图4、表3、表4)
    2.5 PPRV阳性32号鼻拭子样本F基因遗传进化分析（见图5、表3、表4)
    2.6 PPRV阳性32号鼻拭子样本H基因遗传进化分析（见图6、表3、表4)
3 讨论
4 结论



本文编号：3779220