H9N2禽流感病毒分子进化和致病性研究
发布时间:2023-04-12 02:35
H9N2亚型禽流感(AI)持续在我国鸡群中广泛流行,不仅可以感染禽类,还可以感染哺乳动物以及人类,为了明确山东及周边养殖场H9N2亚型禽流感病毒(AIV)的分子进化情况及其致病性,本研究在2016年2019年间从山东及周边养殖场病鸡、病鸭等分离鉴定出37株H9N2 AIV,经病毒纯化后,将病毒各基因片段进行RT-PCR扩增和克隆测序,获得各分离株全基因组序列,并进行遗传演化和重要的氨基酸位点的变异分析。结果显示:37株H9N2 AIV 8个基因片段均属于欧亚谱系,但8个基因片段的分子进化关系呈现出基因多样性:37株HA和NA基因来自Y280-like;HA基因之间的核苷酸同源性为92.2%99.9%,NA基因之间的核苷酸同源性为90.6%99.9%;M、NS基因来自G1-like;PA、NP、PB1基因来自F98-like;PB2基因来自G9-like。HA蛋白的受体结合位点149、198、234和235位点变异最多,37株分离株HA第234位氨基酸(相当于H3第226位氨基酸)全部由Q突变为L,235位点全部突变为M,...
【文章页数】:96 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
中文摘要
Abstract
符号说明
第一部分 文献综述
1 禽流感病毒概述
1.1 流感病毒特点与分类
1.2 流感病毒的流行史
1.3 主要蛋白
2 流感病毒受体
3 H9N2 AIV突变及致病性
4 分子模拟技术在流感病毒突变研究中的应用
5 研究目的和意义
第二部分 试验研究
第一章 H9N2 亚型AIV的全基因组测序、遗传进化与抗原变异分析
1 材料与方法
1.1 材料
1.2 引物设计
1.3 H9N2 亚型AIV的鉴定
1.4 病毒的纯化
1.5 提取病毒RNA
1.6 PCR产物胶回收
1.7 连接与转化
1.8 菌液PCR鉴定
1.9 序列分析
1.10 H9N2 AIV抗原性分析
2 结果与分析
2.1 病毒的分离与鉴定
2.2 序列测序结果
2.3 抗原性分析结果
3 讨论
4 小结
第二章 H9N2 亚型AIV的致病性分析
1 材料与方法
1.1 试验材料
1.2 H9N2 AIV的生物学测定
1.3 H9N2 AIV感染SPF鸡的研究
1.4 H9N2 AIV感染BALB/c雌鼠的研究
2 结果与分析
2.1 鸡胚半数感染量(EID50)测定结果
2.2 组织半数感染量(TCID50)测定
2.3 H9N2 AIV感染SPF鸡的研究
2.4 H9N2 AIV感染BALB/c雌鼠的研究
3 讨论
4 小结
第三章 HA关键突变位点预测与HA差异互作宿主蛋白筛选
1 材料与方法
1.1 材料
1.2 受体结合位点关键氨基酸突变位点预测
1.3 突变质粒的构建
1.4 突变病毒的拯救及鉴定
1.5 突变毒株TCID50测定
1.6 突变毒株复制动力学
1.7 H9N2 AIV变异HA蛋白差异互作宿主蛋白筛选
2 结果与分析
2.1 HA受体结合位点关键氨基酸突变位点预测结果
2.2 突变毒株拯救结果
2.3 突变毒株TCID50测定结果
2.4 突变株CK/SD/903(N218Q)复制动力学
2.5 H9N2 AIV变异HA蛋白互作宿主差异蛋白鉴定结果
3 讨论
4 小结
结论
参考文献
致谢
攻读学位期间发表的学术论著
附录
参与课题情况
本文编号:3790251
【文章页数】:96 页
【学位级别】:硕士
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中文摘要
Abstract
符号说明
第一部分 文献综述
1 禽流感病毒概述
1.1 流感病毒特点与分类
1.2 流感病毒的流行史
1.3 主要蛋白
2 流感病毒受体
3 H9N2 AIV突变及致病性
4 分子模拟技术在流感病毒突变研究中的应用
5 研究目的和意义
第二部分 试验研究
第一章 H9N2 亚型AIV的全基因组测序、遗传进化与抗原变异分析
1 材料与方法
1.1 材料
1.2 引物设计
1.3 H9N2 亚型AIV的鉴定
1.4 病毒的纯化
1.5 提取病毒RNA
1.6 PCR产物胶回收
1.7 连接与转化
1.8 菌液PCR鉴定
1.9 序列分析
1.10 H9N2 AIV抗原性分析
2 结果与分析
2.1 病毒的分离与鉴定
2.2 序列测序结果
2.3 抗原性分析结果
3 讨论
4 小结
第二章 H9N2 亚型AIV的致病性分析
1 材料与方法
1.1 试验材料
1.2 H9N2 AIV的生物学测定
1.3 H9N2 AIV感染SPF鸡的研究
1.4 H9N2 AIV感染BALB/c雌鼠的研究
2 结果与分析
2.1 鸡胚半数感染量(EID50)测定结果
2.2 组织半数感染量(TCID50)测定
2.3 H9N2 AIV感染SPF鸡的研究
2.4 H9N2 AIV感染BALB/c雌鼠的研究
3 讨论
4 小结
第三章 HA关键突变位点预测与HA差异互作宿主蛋白筛选
1 材料与方法
1.1 材料
1.2 受体结合位点关键氨基酸突变位点预测
1.3 突变质粒的构建
1.4 突变病毒的拯救及鉴定
1.5 突变毒株TCID50测定
1.6 突变毒株复制动力学
1.7 H9N2 AIV变异HA蛋白差异互作宿主蛋白筛选
2 结果与分析
2.1 HA受体结合位点关键氨基酸突变位点预测结果
2.2 突变毒株拯救结果
2.3 突变毒株TCID50测定结果
2.4 突变株CK/SD/903(N218Q)复制动力学
2.5 H9N2 AIV变异HA蛋白互作宿主差异蛋白鉴定结果
3 讨论
4 小结
结论
参考文献
致谢
攻读学位期间发表的学术论著
附录
参与课题情况
本文编号:3790251
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