秦川牛SIX1和SIX4基因SNPs检测及其与体尺和肉质性状的关联分析

发布时间：2023-04-23 15:47

　　SIX1和SIX4基因是一类进化上比较保守的转录因子，它们属于SIX家族。SIX1和SIX4是肌肉发生、分化时重要的关键转录因子在动物胚胎及骨骼肌发育期间，SIX1和SIX4基因协同作用，它们可直接或通过生肌决定因子家族调控肌肉发育相关基因。 因此，本研究以487头秦川牛为实验材料，通过DNA测序、PCR-RFLP和PCR-SSCP等技术手段分析研究了在肌肉发育中起关键作用的SIX1和SIX4基因在487头秦川牛群体中的遗传变异情况，统计了各个基因型的频率和遗传多样性，并研究了这些遗传变异与秦川牛体尺和肉质数据的关联性。通过研究这些遗传变异的遗传效应，希望发现显著影响秦川牛经济性状的DNA标记，为分子育种提高秦川牛的生产和肉质性能提供理论基础。 本研究取得了如下结果： 1. SIX1和SIX4基因的遗传变异分析 根据NCBI数据库显示SIX1基因（GeneID:511371）包含有3个外显子。在对SIX1基因设计了4对引物，经PCR扩增、DNA测序后，发现SIX1基因的3个外显子区域并不存在SNP。 根据NCBI数据库显示SIX4基因（GeneID:526104）包含有3个外显子。在对...

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【学位级别】：硕士

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摘要
ABSTRACT
文献综述
    第一章 研究背景
        1.1 秦川牛情况简介
        1.2 分子标记技术简介
            1.2.1 限制性片断长度多态性（RFLP）
            1.2.2 单链构象多态性(SSCP)
            1.2.3 单核苷酸多态性(SNP)
            1.2.4 随机扩增多态性 DNA (RAPD)
            1.2.5 微卫星 DNA 标记
        1.3 SIX1 和 SIX4 基因概况
            1.3.1 肌肉细胞分化、生长调控的功能基因及其调控机理
            1.3.2 SIX 同源框基因家族的研究概况
        1.4 本研究的目的和意义
实验研究
    第二章 秦川牛 SIX1 和 SIX4 基因的遗传多态性及其与体尺和肉质性状的关联分析
        2.1 试验材料
            2.1.1 试验 DNA 样品
            2.1.2 生产性状资料
            2.1.3 主要仪器设备及试剂
        2.2 试验方法
            2.2.1 基因组 DNA 的提取
            2.2.2 PCR 扩增体系
            2.2.3 PCR-RFLP 分析
            2.2.4 PCR-SSCP 分析
            2.2.5 统计分析
        2.3 结果与分析
            2.3.1 秦川牛血液基因组 DNA 样品的检测
            2.3.2 SIX1 和 SIX4 基因 PCR 电泳检测结果
            2.3.3 SIX1 和 SIX4 基因 PCR 扩增后的测序结果
            2.3.4 SIX4 基因的扩增产物 RFLP 分析
            2.3.5 SIX4 基因扩增产物的 SSCP 分析
            2.3.6 秦川牛 SIX1 和 SIX4 多态位点的遗传学分析
            2.3.7 秦川牛 SIX4 基因多态位点间的单倍型分析
            2.3.8 SIX4 基因多态性与秦川牛体尺和肉质性状的关联分析
        2.4 讨论
            2.4.1 秦川牛 SIX1 和 SIX4 基因遗传突变位点的分析
        2.5 结论与创新点
            结论
            创新点
参考文献
附录
致谢
作者简介



本文编号：3800001