我国绵羊痒螨（兔亚种）线粒体12S、16S和ATP6基因全序列的遗传多样性分析

发布时间：2023-05-03 19:30

　　兔的痒螨病是由绵羊痒螨(兔亚种)寄生于外耳道皮肤的表面,引起兔消瘦,耳内充满纸卷样痂皮为典型特征的一种慢性接触性皮肤传染病,给养兔业造成巨大的经济损失。线粒体基因因进化速度快,遗传稳定性好等特点常被用做分子标记,可以进行物种的分子鉴定和种群遗传等研究。目前有关绵羊痒螨的线粒体基因种群遗传的研究较少。因此,本研究采用PCR技术扩增我国五个地区(华东、华中、华北、西北、西南)不同品种兔(獭兔和肉兔)痒螨虫株的线粒体12S、16S、ATP6基因全序列,并比较分析种群遗传变异情况,以揭示我国绵羊痒螨(兔亚种)虫株的遗传结构特征,评估痒螨种群对环境的适应能力。主要研究结果如下:1.基于线粒体12S和16S基因全序列对我国绵羊痒螨(兔亚种)种群遗传多样性的研究为了解我国痒螨种群的遗传多样性特点,本研究采用PCR技术对我国5个地区(华东、华中、华北、西北、西南)的绵羊痒螨(兔亚种)单个虫体的线粒体12S和16S基因全序列进行扩增、测序,并基于12S、16S和联合12S+16S基因序列分析痒螨种群的遗传多样性。共得到89条12S序列(657bp),83条16S序列(1025bp)和63条12S+16S...

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摘要
ABSTRACT
第一部分 文献综述
    1 线粒体基因在动物寄生性蜱螨中的研究进展
        1.1 线粒体基因的组成及特点
        1.2 线粒体基因在动物寄生性蜱螨中的应用
            1.2.1 线粒体16SrRNA、12SrRNA基因及应用
            1.2.2 线粒体COI、COII基因及应用
            1.2.3 线粒体Cytb基因及应用
            1.2.4 线粒体其他基因
    2 研究目的与意义
第二部分 研究内容
    第一章 基于线粒体基因12S和16S基因全序列分析绵羊痒螨(兔亚种)的遗传多样性
        1 试验材料和方法
            1.1 试验材料
                1.1.1 样品来源
                1.1.2 试验试剂
                1.1.3 培养基和缓冲液的配制
                1.1.4 主要仪器设备
            1.2 试验方法
                1.2.1 痒螨的处理
                1.2.2 单个螨虫基因组DNA的提取
                1.2.3 引物设计
                1.2.5 T-载体克隆与鉴定
                1.2.6 数据的处理与分析
        2 试验结果
            2.1 序列组成和单倍型分布
            2.2 种群遗传多样性
            2.3 种群遗传距离与核苷酸分歧度
            2.4 种群分化和遗传结构
            2.5 种群历史动态分析
            2.6 系统发育树与单倍型网络图分析
        3 讨论
    第二章 基于线粒体ATP6基因全序列对绵羊痒螨(兔亚种)种群遗传多样性的研究
        1 试验材料和方法
            1.1 试验材料
                1.1.1 样品来源
                1.1.2 试验试剂
                1.1.3 培养基和常用溶液的配制
                1.1.4 主要仪器设备
            1.2 试验方法
                1.2.1 痒螨的处理
                1.2.2 单个螨虫基因组DNA的提取
                1.2.3 引物设计
                1.2.4 PCR扩增与产物纯化回收
                1.2.5 T-载体克隆与鉴定
        2 试验结果
            2.1 序列组成和单倍型分布
            2.2 种群遗传多样性
            2.3 种群遗传距离与核苷酸分歧度
            2.4 种群分化和遗传结构
            2.5 种群历史动态分析
            2.6 系统发育树与单倍型网络图分析
        3 讨论
第三部分 结论与创新点
    1.结论
    2.创新点
参考文献
致谢
作者简历



本文编号：3807145