基于转录组测序分析西门塔尔牛和安格斯牛脂肪沉积相关基因的差异表达

发布时间：2023-05-07 03:47

　　肌内脂肪(intramuscular fat, IMF)的含量和分布是形成牛大理石花纹肉的物质基础。西门塔尔牛(Bos taurus)和安格斯牛(B. taurus)的脂肪沉积能力不同,安格斯牛IMF含量显著高于西门塔尔牛。本研究采用高通量测序技术筛选背膘脂肪沉积相关基因,旨在为西门塔尔牛和安格斯牛脂肪沉积机制研究提供参考依据。以西门塔尔牛和安格斯牛15月龄公牛各3头进行育肥屠宰实验,对屠宰后的胴体进行肉质性状测定。取两个品种牛背膘脂肪组织进行转录组测序和生物信息学分析。结果显示,2个品种牛在粗脂肪、滴水损失、眼肌面积和pH方面差异不显著,西门塔尔牛剪切力显著高于安格斯牛(P<0.01)。转录组数据分析结果表明,2个品种的牛在背膘脂肪组织存在1 296个差异表达基因,主要富集在代谢、生长、发育等55个功能条目和脂质代谢、碳水化合物代谢、能量代谢等44条代谢通路;根据通路和功能分析,选择丙酮酸脱氢酶激酶4 (pyruvate dehydrogenase kinase 4, PDK4)、核受体第4亚族A组成员1 (nuclear receptor subfamily 4 group ...

【文章页数】：9 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 屠宰实验性状测定
    1.2 转录组测序
    1.3 测序数据处理与注释
    1.4 脂肪沉积差异表达基因筛选及分析
    1.5 实时荧光定量PCR分析
2 结果与分析
    2.1 肉质性状比较
    2.2 测序数据分析
    2.3 脂肪沉积相关的差异表达基因筛选及分析
    2.4 差异表达基因的实时荧光定量PCR验证
3 讨论
4 结论



本文编号：3810216