江西不同地方品种鸡apoA-Ⅰ、apoB基因多态性与其脂肪代谢的关联性分析

发布时间：2023-05-13 02:03

　　本试验以崇仁麻鸡、余干黑鸡、海蓝褐蛋鸡、绿壳蛋鸡、宁都三黄鸡、安义瓦灰鸡和泰和乌骨鸡各50羽作为试验材料，根据已公布鸡的apoA-Ⅰ、apoB基因序列设计引物，利用PCR-DNA直接测序技术检测apoA-Ⅰ、apoB基因SNPs和基因型分析，探讨apoA-Ⅰ、apoB基因的多态性及其与脂肪代谢的关系。结果如下： 1、在apoA-Ⅰ基因序列起始密码子ATG上游163bp处存在一个A/T突变，该突变产生AA、AB、BB基因型。基因型分析结果表明，余干黑鸡以AB基因型为主导基因型，绿壳蛋鸡、安义瓦灰鸡和宁都三黄鸡以BB基因型为主导基因型；余干黑鸡和泰和乌骨鸡以A基因为主要等位基因，绿壳蛋鸡、安义瓦灰鸡和宁都三黄鸡以B基因为主要等位基因；不同品种鸡apoA-Ⅰ基因的突变位点为中度多态位点。 2、在apoB基因序列的第26个外显子123bp处产生T/G突变，并产生TT、TG、GG基因型。其中崇仁麻鸡和泰和乌骨鸡以TT基因型为主导基因型，余干黑鸡、绿壳蛋鸡、安义瓦灰鸡和宁都三黄鸡的TG基因型为主导基因型；不同品种鸡均以T基因为主要等位基因；不同品种鸡apoA-B基因的突变位点为中度多态位点。 3、...

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【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
Abstract
第一部分 研究综述
    1 分子标记技术
    2 新一代分子标记技术—单核苷酸多态性(SNPs)
        2.1 单核苷酸多态性(SNPs)
        2.2 SNPs 的检测方法
            2.2.1 PCR-RFLP
            2.2.2 PCR-SSCP
            2.2.3 变性高效液相色谱技术(DHPLC)
            2.2.4 DNA 芯片技术(DNA chip)
            2.2.5 PCR-DNA 直接测序
    3 apoA-Ⅰ基因的研究进展
        3.1 apoA-Ⅰ的结构特点
        3.2 apoA-Ⅰ的分布特点
        3.3 apoA-Ⅰ的功能特点
    4 apoB 基因的研究进展
        4.1 apoB 的结构特点
        4.2 apoB 的功能特点
    5 江西地方鸡种概述
        5.1 崇仁麻鸡
        5.2 余干黑鸡
        5.3 海蓝褐蛋鸡
        5.4 绿壳蛋鸡
        5.5 安义瓦灰鸡
        5.6 宁都三黄鸡
        5.7 泰和乌骨鸡
    6 研究对不同品种鸡的选育的原因
    7 本研究目的和意义
第二部分 试验研究
    1 试验材料和方法
        1.1 试验材料
            1.1.0 材料来源
            1.1.1 试验方法
            1.1.2 饲养管理
            1.1.3 试验仪器
            1.1.4 试验试剂
            1.1.5 常用试剂的配制
            1.1.6 主要分子生物学软件
        1.2 试验流程
            1.2.1 血液 DNA 的提取
            1.2.2 DNA 浓度测定
            1.2.3 引物的设计、合成和稀释
            1.2.4 PCR 扩增
            1.2.5 PCR 扩增产物鉴定
            1.2.6 测序
        1.3 遗传学统计分析
    2 结果与分析
        2.1 PCR 扩增产物
        2.2 apoA-Ⅰ基因测序结果分析
            2.2.1 崇仁麻鸡 apoA-Ⅰ基因测序图谱
            2.2.2 余干黑鸡 apoA-Ⅰ基因测序图谱
            2.2.3 海蓝褐蛋鸡 apoA-Ⅰ基因测序图谱
            2.2.4 绿壳蛋鸡 apoA-Ⅰ基因测序图谱
            2.2.5 安义瓦灰鸡 apoA-Ⅰ基因测序图谱
            2.2.6 宁都三黄鸡 apoA-Ⅰ基因测序图谱
            2.2.7 泰和乌骨鸡 apoA-Ⅰ基因测序图谱
        2.3 apoB 基因测序结果分析
            2.3.1 崇仁麻鸡 apoB 基因测序图谱
            2.3.2 余干黑鸡 apoB 基因测序图谱
            2.3.3 海蓝褐蛋鸡 apoB 基因测序图谱
            2.3.4 绿壳蛋鸡 apoB 基因测序图谱
            2.3.5 安义瓦灰鸡 apoB 基因测序图谱
            2.3.6 宁都三黄鸡 apoB 基因测序图谱
            2.3.7 泰和乌骨鸡 apoB 基因测序图谱
        2.4 apoA-Ⅰ基因的群体遗传学分析
            2.4.1 apoA-Ⅰ的不同基因型在不同品种鸡群中的分布
            2.4.2 apoA-Ⅰ基因的基因型频率和等位基因频率的分析
            2.4.3 apoA-Ⅰ基因的多态性分析
            2.4.4 apoA-Ⅰ基因的 Hardy-Weinberg 平衡检验
        2.5 apoB 基因的群体遗传学分析
            2.5.0 apoB 的 3 种基因型在不同品种鸡群中的分布
            2.5.1 apoB 基因的基因型频率和等位基因频率分析
            2.5.2 apoB 基因的多态性分析
            2.5.3 apoB 基因的 Hardy-Weinberg 平衡检验
        2.6 apoA-Ⅰ基因不同基因型与四个品种鸡的肝重、肝脂率、腹脂重、腹脂比率的关联性分析
            2.6.1 apoA-Ⅰ基因不同基因型与四个品种鸡的肝重的关联性分析
            2.6.2 apoA-Ⅰ基因不同基因型与四个品种鸡的肝脂率的关联性分析
            2.6.3 apoA-Ⅰ基因不同基因型与四个品种鸡的腹脂重的关联性分析
            2.6.4 apoA-Ⅰ基因不同基因型与四个品种鸡的腹脂比率的关联性分析
        2.7 apoB 基因不同基因型与四个品种鸡的肝重、肝脂率、腹脂重、腹脂率的关联性分析
            2.7.1 ApoB 不同基因型与四个品种鸡的肝重的关联性分析
            2.7.2 ApoB 不同基因型与四个品种鸡的肝脂率的关联性分析
            2.7.3 ApoB 不同基因型与四个品种鸡的腹脂重的关联性分析
            2.7.4 ApoB 不同基因型与四个品种鸡的腹脂比率的关联性分析
    3 讨论
        3.1 基因多态性检测方法的研究
        3.2 apoA-Ⅰ基因和 apoB 基因的多态性研究
        3.3 apoA-Ⅰ基因和 apoB 基因不同基因型及遗传学研究
        3.4 apoA-Ⅰ基因和 apoB 基因与脂肪代谢的关联性研究
    4 小结
        4.1 本研究的主要成果
        4.2 本研究的创新点
参考文献
致谢
附录



本文编号：3815076