基于宏基因组学解析瘤胃微生物调节荷斯坦奶牛乳蛋白含量的研究

发布时间：2023-05-20 06:40

　　本试验旨在研究相同饲粮结构及饲养环境下,基于宏基因组学解析乳蛋白含量与瘤胃微生物之间的潜在关系。以荷斯坦奶牛为研究对象,选择乳蛋白含量长期偏高(>3.7%)、长期偏低(3.0%～3.3%)的奶牛各3头,采集瘤胃内容物,通过宏基因组学方法分析二者之间的潜在调节作用。结果表明:拟杆菌门(Bacteroidetes)、拟杆菌纲(Bacteroidia)、普雷沃氏菌属(Prevotella)、普雷沃氏菌科(Prevotellaceae)、拟杆菌目(Bacteroidales)、栖瘤胃普雷沃氏菌(Prevotella ruminicola)相对含量在2组间呈现显著差异(P<0.05),其中Prevotella ruminicola为主要差异微生物,并首次发现三角酵母属(Trigonopsis)可能对调节乳蛋白含量具有一定作用。在乳蛋白含量长期偏高的奶牛瘤胃内,与乳蛋白前体物生成过程相关的氨基酸代谢和其他氨基酸代谢功能基因的相对丰度显著升高(P<0.05),与蛋白质降解及氨基酸代谢过程密切相关的COG0542、COG0612、COG1404、COG1506、 COG2755、 C...

【文章页数】：13 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 试验设计
    1.2 样品采集与处理
        1.2.1 牛乳样品的采集与处理
        1.2.2 瘤胃内容物样品的采集与处理
    1.3 宏基因组DNA提取及建库测序
        1.3.1 DNA提取
        1.3.2 文库构建与测序
        1.3.3 上机测序
    1.4 宏基因组数据预处理
        1.4.1 数据过滤与去除宿主污染
        1.4.2 序列组装
    1.5 微生物多样性与功能分析
    1.6 统计分析
2 结果与分析
    2.1 不同乳蛋白含量奶牛相关参数
    2.2 不同乳蛋白含量奶牛瘤胃微生物组成结构
    2.3 高乳蛋白含量奶牛瘤胃内特征性微生物
    2.4 不同乳蛋白含量奶牛瘤胃微生物基因功能差异
        2.4.1 与蛋白质生理代谢相关的功能基因富集情况
        2.4.2 与蛋白质生理代谢相关的差异基因
3 讨论
    3.1 不同乳蛋白含量奶牛瘤胃微生物组成结构的差异
    3.2 不同乳蛋白含量奶牛瘤胃微生物基因功能的差异
4 结论



本文编号：3820739