三种肠道原虫在海南食蟹猴中的分布及人兽共患风险
发布时间：2023-07-24 21:26
隐孢子虫(Cryptosporidium spp.)、毕氏肠微孢子虫(Enterocyotozon bieneusi)以及十二指肠贾第虫(Giardia duodenalis,以下简称贾第虫)是三种常见的人兽共患寄生虫。这三种寄生虫除通过人-人和动物-人的直接途径感染人之外,也通过环境因素,如污染的饮用水、娱乐用水和灌溉用水等水源性传播,以及污染的菜蔬、渔产等食源性传播的方式感染人类。越来越多的研究发现,非人灵长类动物(NHPs)是这三种人兽共患病原的常见宿主,且感染非人灵长类动物的大多数基因型和亚型也存在于人类中,因此,非人灵长类动物是导致人类感染这些寄生虫的重要感染源之一。目前已有多个研究聚焦于动物园饲养的非人灵长类动物中,但少有研究探索这些病原体在集中养殖的灵长类动物中的遗传多样性和公共卫生意义。在本研究中,我们利用分子分型技术,对中国海南某商业食蟹猴(Macaca fascicularis)养殖厂的1452只非人灵长类动物,三种病原体的阳性率、虫种内部的基因型和亚型的遗传多样性进行研究,从而评估这些病原的人兽共患风险及其公共卫生意义。基于SSU rRNA位点的巢式PCR扩增,对...
【文章页数】：118 页
【学位级别】：博士
【文章目录】：
摘要
Abstract
第1章 文献综述
1.1 隐孢子虫、毕氏肠微孢子虫和贾第虫的简介
1.1.1 隐孢子虫的简介
1.1.2 毕氏肠微孢子虫的简介
1.1.3 贾第虫的简介
1.2 隐孢子虫、毕氏肠微孢子虫和贾第虫与公共卫生的关联
1.2.1 介水传播风险
1.2.2 其它传播途径
1.2.3 临床症状
1.2.4 防控手段
1.3 三种病原的检测、基因分型技术及亚型区分技术发展
1.3.1 PCR-RFLP技术
1.3.2 PCR-DNA结合测序技术
1.3.3 Real-time PCR技术
1.3.4 多位点序列分型技术(MLST)
1.4 隐孢子虫、毕氏肠微孢子虫和贾第虫在人群和动物中的分布
1.4.1 隐孢子虫在人群中的分布
1.4.2 隐孢子虫在非人灵长类动物及其它动物中的分布
1.4.3 毕氏肠微孢子虫在人群中的分布
1.4.4 毕氏肠微孢子虫在非人灵长类动物及其它动物中的分布
1.4.5 贾第虫在人群中的分布
1.4.6 贾第虫在非人灵长类动物及其它动物中的分布
1.5 本研究的主要内容和意义
第2章 隐孢子在海南食蟹猴中的分布
2.1 引言
2.2 实验材料
2.2.1 样本采集
2.2.2 实验仪器
2.2.3 实验所需试剂
2.3 实验方法
2.3.1 DNA提取
2.3.2 虫种/基因型鉴定
2.3.3 亚型鉴定
2.3.4 卵囊排泄量检测
2.3.5 统计学分析
2.4 实验结果
2.4.1 食蟹猴中隐孢子虫的感染率
2.4.2 隐孢子虫虫种分布
2.4.3 隐孢子虫的亚型分布
2.4.4 感染不同状态样品的隐孢子虫亚型分布情况
2.5 讨论
2.5.1 多个隐孢子虫虫种及亚型的分布
2.5.2 海南食蟹猴中隐孢子虫的公共卫生意义
2.6 本章小结
第3章 毕氏肠微孢子虫在海南食蟹猴中的分布
3.1 引言
3.2 实验材料
3.2.1 采集样本
3.2.2 实验仪器
3.2.3 实验试剂
3.3 实验方法
3.3.1 引物
3.3.2 反体系及程序
3.3.3 基于等位基因的群体遗传学分析
3.3.4 毕氏肠微孢子虫亚结构分析
3.4 实验结果
3.4.1 毕氏肠微孢子虫在海南食蟹猴中的感染率
3.4.2 毕氏肠微孢子虫基因型在不同状态样品中的分布
3.4.3 主要基因型的多位点基因分型结果
3.5 讨论
3.5.1 毕氏肠微孢子虫在海南食蟹猴中的分布
3.5.2 毕氏肠微孢子虫的三种主要基因型的多位点基因分型
3.5.3 海南食蟹猴中毕氏肠微孢子虫的公共卫生意义
3.6 本章小结
第4章 贾第虫在海南食蟹猴中的分布及其公共卫生学意义
4.1 引言
4.2 实验材料
4.2.1 样本采集
4.2.2 实验仪器
4.2.3 实验试剂
4.3 实验方法
4.4 实验结果
4.4.1 贾第虫感染率
4.4.2 贾第虫基因型及亚型在不同状态样品中的分布
4.4.3 Assemblage B的多位点基因分型
4.4.4 Assemblage B的系统发育分析
4.5 讨论
4.5.1 贾第虫在海南食蟹猴中的分布
4.5.2 海南食蟹猴中贾第虫的公共卫生意义
4.6 本章小结
第5章 三种肠道原虫在海南食蟹猴中的共感染情况
5.1 引言
5.2 实验材料
5.2.1 样本采集
5.2.2 实验仪器
5.2.3 实验试剂
5.3 实验方法
5.4 实验结果
5.4.1 三种肠道原虫共感染情况
5.4.2 三种肠道原虫在不同年龄段食蟹猴中的分布
5.4.3 三种肠道原虫在不同性别食蟹猴中的分布
5.4.4 三种肠道原虫在不同性别食蟹猴中的分布
5.5 讨论
5.6 本章小结
第6章 结论和展望
6.1 主要结论
6.2 论文创新点
6.3 展望
参考文献
攻读博士学位期间研究成果
致谢
本文编号：3836556
【文章页数】：118 页
【学位级别】：博士
【文章目录】：
摘要
Abstract
第1章 文献综述
1.1 隐孢子虫、毕氏肠微孢子虫和贾第虫的简介
1.1.1 隐孢子虫的简介
1.1.2 毕氏肠微孢子虫的简介
1.1.3 贾第虫的简介
1.2 隐孢子虫、毕氏肠微孢子虫和贾第虫与公共卫生的关联
1.2.1 介水传播风险
1.2.2 其它传播途径
1.2.3 临床症状
1.2.4 防控手段
1.3 三种病原的检测、基因分型技术及亚型区分技术发展
1.3.1 PCR-RFLP技术
1.3.2 PCR-DNA结合测序技术
1.3.3 Real-time PCR技术
1.3.4 多位点序列分型技术(MLST)
1.4 隐孢子虫、毕氏肠微孢子虫和贾第虫在人群和动物中的分布
1.4.1 隐孢子虫在人群中的分布
1.4.2 隐孢子虫在非人灵长类动物及其它动物中的分布
1.4.3 毕氏肠微孢子虫在人群中的分布
1.4.4 毕氏肠微孢子虫在非人灵长类动物及其它动物中的分布
1.4.5 贾第虫在人群中的分布
1.4.6 贾第虫在非人灵长类动物及其它动物中的分布
1.5 本研究的主要内容和意义
第2章 隐孢子在海南食蟹猴中的分布
2.1 引言
2.2 实验材料
2.2.1 样本采集
2.2.2 实验仪器
2.2.3 实验所需试剂
2.3 实验方法
2.3.1 DNA提取
2.3.2 虫种/基因型鉴定
2.3.3 亚型鉴定
2.3.4 卵囊排泄量检测
2.3.5 统计学分析
2.4 实验结果
2.4.1 食蟹猴中隐孢子虫的感染率
2.4.2 隐孢子虫虫种分布
2.4.3 隐孢子虫的亚型分布
2.4.4 感染不同状态样品的隐孢子虫亚型分布情况
2.5 讨论
2.5.1 多个隐孢子虫虫种及亚型的分布
2.5.2 海南食蟹猴中隐孢子虫的公共卫生意义
2.6 本章小结
第3章 毕氏肠微孢子虫在海南食蟹猴中的分布
3.1 引言
3.2 实验材料
3.2.1 采集样本
3.2.2 实验仪器
3.2.3 实验试剂
3.3 实验方法
3.3.1 引物
3.3.2 反体系及程序
3.3.3 基于等位基因的群体遗传学分析
3.3.4 毕氏肠微孢子虫亚结构分析
3.4 实验结果
3.4.1 毕氏肠微孢子虫在海南食蟹猴中的感染率
3.4.2 毕氏肠微孢子虫基因型在不同状态样品中的分布
3.4.3 主要基因型的多位点基因分型结果
3.5 讨论
3.5.1 毕氏肠微孢子虫在海南食蟹猴中的分布
3.5.2 毕氏肠微孢子虫的三种主要基因型的多位点基因分型
3.5.3 海南食蟹猴中毕氏肠微孢子虫的公共卫生意义
3.6 本章小结
第4章 贾第虫在海南食蟹猴中的分布及其公共卫生学意义
4.1 引言
4.2 实验材料
4.2.1 样本采集
4.2.2 实验仪器
4.2.3 实验试剂
4.3 实验方法
4.4 实验结果
4.4.1 贾第虫感染率
4.4.2 贾第虫基因型及亚型在不同状态样品中的分布
4.4.3 Assemblage B的多位点基因分型
4.4.4 Assemblage B的系统发育分析
4.5 讨论
4.5.1 贾第虫在海南食蟹猴中的分布
4.5.2 海南食蟹猴中贾第虫的公共卫生意义
4.6 本章小结
第5章 三种肠道原虫在海南食蟹猴中的共感染情况
5.1 引言
5.2 实验材料
5.2.1 样本采集
5.2.2 实验仪器
5.2.3 实验试剂
5.3 实验方法
5.4 实验结果
5.4.1 三种肠道原虫共感染情况
5.4.2 三种肠道原虫在不同年龄段食蟹猴中的分布
5.4.3 三种肠道原虫在不同性别食蟹猴中的分布
5.4.4 三种肠道原虫在不同性别食蟹猴中的分布
5.5 讨论
5.6 本章小结
第6章 结论和展望
6.1 主要结论
6.2 论文创新点
6.3 展望
参考文献
攻读博士学位期间研究成果
致谢
本文编号：3836556
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