5株水禽细小病毒基因组的克隆与遗传进化分析

发布时间：2023-10-30 18:23

　　鹅细小病毒病是主要引起雏鹅和雏番鸭发生高致死性的病毒病。本病主要以消化道,尤其是肠道的卡他性和纤维素性炎症为主要特征；番鸭细小病毒又称“三周病”,是由于该病主要侵害三周龄以内的雏番鸭。二者早先属于细小病毒属成员,在国际病毒分类委员会第八次分类报告中将二者分类于依赖病毒属。本病以以腹泻、喘气、软脚为主要症状的细小病毒病。这两种病都具有较高的发病率和死亡率,严重危害着水禽业的发展。对付这两种疾病没有什么特异性的治疗方法,多以接种疫苗来预防该病；诊断方法也多以血清学诊断或者分子生物学诊断为主。自首次发现以来,经过国内外多年的研究,虽然可以较好的控制本病的发生,但该病依旧危害着水禽业。为了更好的控制该病的发生,我们就要仔细的研究其分子水平上的特性,首要的就是其基因水平上的特性。鹅细小病毒基因组由5106个核苷酸构成,而番鸭细小病毒基因组有5132个核苷酸。他们的编码区均由左右两个开放阅读框组成,左侧阅读框编码的蛋白为非结构蛋白,包括NS1和NS2两种；右侧阅读框编码结构蛋白为结构蛋白,包括VP1、VP2和VP3三种。其中NS1蛋白主要参与病毒对细胞的毒性作用、病毒复制以及基因表达,NS2则能促...

【文章页数】：48 页

【学位级别】：硕士

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摘要
Abstract
1 引言
    1.1 病毒生物学特性
        1.1.1 GPV与MDPV的分类特征
        1.1.2 形态和理化特性
        1.1.3 宿主范围与培养特性
    1.2 细小病毒成员之间的关系
        1.2.1 GPV与MDPV之间的关系
        1.2.2 与其他成员的关系
    1.3 分子生物学特性
        1.3.1 编码区
        1.3.2 倒置末端重复序列
        1.3.3 基因组的复制
        1.3.4 基因编码非结构蛋白与结构蛋白
    1.4 流行病学
        1.4.1 鹅细小病毒
        1.4.2 番鸭细小病毒
    1.5 症状与病理变化
        1.5.1 GPV主要症状
        1.5.2 GPV病理变化
        1.5.3 MDPV主要症状
        1.5.4 MDPV病理变化
    1.6 诊断
    1.7 防治措施
    1.8 研究的目的与意义
2 材料与方法
    2.1 材料
        2.1.1 病毒、细胞和载体
        2.1.2 分子生物学试剂及常用生化试剂
        2.1.3 引物设计软件
        2.1.4 序列分析软件
        2.1.5 主要仪器
    2.2 试验方法
        2.2.1 感受态细胞制备
        2.2.2 接种病毒
        2.2.3 病毒基因组DNA提取
        2.2.4 基因扩增引物的设计
        2.2.5 PCR 扩增
        2.2.6 PCR产物的胶回收纯化
        2.2.7 pMDlS-T载体克隆质粒的构建及鉴定
3 试验结果
    3.1 PCR扩增结果
    3.2 序列分析
        3.2.1 GPV与MDPV的同源性
        3.2.2 与其他成员的同源性
    3.3 水禽细小病毒5个毒株NS和VP区的糖基化位点特征
    3.4 进化分析
4 讨论
5 结论
致谢
参考文献
攻读硕士学位期间发表的学术论文



本文编号：3858959