鸭胸肌肉色性状全基因组关联分析

发布时间：2023-11-12 19:23

　　试验旨在利用全基因组关联分析(GWAS)定位影响鸭胸肌肉色性状的候选基因及分子标记,探究肉色性状的遗传基础。本研究中,共测定了555只北京鸭×野鸭F2代资源群体的3种胸肌肉色性状(包括红度a^*、黄度b^*、亮度L^*)。利用北京鸭×野鸭F2代资源群体胸肌肉色性状数据并结合全基因组重测序数据进行全基因组关联分析,检测影响胸肌肉色性状的相关基因及可能的因果变异位点。结果显示,肌肉亮度L^*、红度a^*、黄度b^*均属于低遗传力性状,遗传力分别为0.23、0.12、0.13,且肌肉黄度b^*变异系数较大(26.18%)。通过相关性分析可知,肌肉黄度与红度存在较强正表型相关(r=0.52),肌纤维直径与肌肉黄度存在弱负相关性(r=-0.16)。利用混合线性模型进行GWAS,发现了1个SNP与肌肉黄度b^*潜在显著关联(-log₁₀P=8.28)。对最高效应SNP进行连锁不平衡检验,发现42个SNPs与最高点SNP...

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【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 试验动物及表型采集
    1.2 DNA、RNA提取及质控
        1.2.1 DNA提取及质控
        1.2.2 RNA提取及质控
    1.3 统计分析
        1.3.1 相关性分析和基因表达热图
        1.3.2 遗传力计算
        1.3.3 GWAS分析
        1.3.4 表达量分析
2 结 果
    2.1 表型值统计及遗传力计算
    2.2 相关性分析
    2.3 GWAS分析
    2.4 候选基因分析
3 讨 论
4 结 论



本文编号：3863788