基于rDNA-ITS序列对盅口属线虫的系统发育分析
发布时间:2024-01-29 19:31
圆线虫主要寄生在马属动物大肠内,以宿主肠组织、体液、消化液为食,往往消弱宿主免疫力,造成营养不良,贫血等症状。因此,为了控制圆线虫病的发生、蔓延、减少损失,圆线虫种类及系统发育分析的调查研究就显得尤为重要。到目前为止,国外众多学者对圆线虫的形态学、生活史、致病机理、疾病控制、流行病学、分子生物学及系统发育学方面的研究较多,而在国内,常见的仅有圆线虫形态学方面的报道,其他方面较少,甚至有些方面的研究还是空白。本论文首次对河南省驴体内寄生的3种盅口属线虫的形态和分子系统发育进行详细地研究。 本实验以我国河南省驴体内寄生的3种盅口属线虫(四刺盅口线虫、蝶状盅口线虫、碗形盅口线虫)为研究对象,在光学显微镜下对这三种线虫进行仔细的观察和测量,同时运用扫描电镜技术观察和描述每一种线虫的形态和结构,以期为盅口属线虫的分类鉴定提供新的依据,本实验所采的线虫与已有的文献记载相比,形态、结构基本一致。 盅口属3种线虫rDNA-ITS序列比对和系统发育分析结果显示:ITS(包括5.8S)序列总长度为838-842bp,变异位点61个,简约信息位点18个;其中ITS1长度范围为369-370bp,变异位点21...
【文章页数】:60 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
ABSTRACT
目录
1 引言
1.1 分子生物学标记技术在寄生线虫分类中的应用
1.1.1 rDNA-ITS 序列特征在寄生线虫分类鉴定及系统发育分析中的应用
1.1.2 PCR-RFLP 技术及其在寄生线虫分类中的应用
1.1.3 AFLP 技术及其在寄生线虫分类中的应用
1.1.4 RAPD 技术及其在寄生线虫分类中的应用
1.1.5 PCR-SSCP 技术及其在寄生线虫分类中的应用
1.1.6 DNA 序列测定与分析
1.1.7 构建系统发育树的常用方法
1.2 马属动物寄生圆线虫的研究概况
1.2.1 圆线虫的形态概述
1.2.2 圆线虫的分布和生活史
1.2.3 圆线虫的致病机理和诊断控制
1.3 本研究的内容和意义
2 材料与方法
2.1 材料
2.1.1 虫体样本
2.1.2 主要试剂与仪器
2.2 方法
2.2.1 形态学观察
2.2.2 系统发育分析
3 结果
3.1 形态学观察
3.1.1 四刺盅口线虫 Cyathostomum tetracanthum
3.1.2 碗形盅口线虫 Cyathostomum catinatum
3.1.3 蝶状盅口线虫 Cyathostomum pateratum
3.2 系统发育分析
3.2.1 PCR 扩增
3.2.2 ITS 序列分析
3.2.3 盅口属线虫和冠环属线虫与外群 ITS 序列的遗传距离
3.2.4 盅口属线虫和冠环属线虫的系统发育关系
4 讨论
参考文献
致谢
攻读学位期间发表的学术论文目录
本文编号:3888709
【文章页数】:60 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
ABSTRACT
目录
1 引言
1.1 分子生物学标记技术在寄生线虫分类中的应用
1.1.1 rDNA-ITS 序列特征在寄生线虫分类鉴定及系统发育分析中的应用
1.1.2 PCR-RFLP 技术及其在寄生线虫分类中的应用
1.1.3 AFLP 技术及其在寄生线虫分类中的应用
1.1.4 RAPD 技术及其在寄生线虫分类中的应用
1.1.5 PCR-SSCP 技术及其在寄生线虫分类中的应用
1.1.6 DNA 序列测定与分析
1.1.7 构建系统发育树的常用方法
1.2 马属动物寄生圆线虫的研究概况
1.2.1 圆线虫的形态概述
1.2.2 圆线虫的分布和生活史
1.2.3 圆线虫的致病机理和诊断控制
1.3 本研究的内容和意义
2 材料与方法
2.1 材料
2.1.1 虫体样本
2.1.2 主要试剂与仪器
2.2 方法
2.2.1 形态学观察
2.2.2 系统发育分析
3 结果
3.1 形态学观察
3.1.1 四刺盅口线虫 Cyathostomum tetracanthum
3.1.2 碗形盅口线虫 Cyathostomum catinatum
3.1.3 蝶状盅口线虫 Cyathostomum pateratum
3.2 系统发育分析
3.2.1 PCR 扩增
3.2.2 ITS 序列分析
3.2.3 盅口属线虫和冠环属线虫与外群 ITS 序列的遗传距离
3.2.4 盅口属线虫和冠环属线虫的系统发育关系
4 讨论
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致谢
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本文编号:3888709
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