牛冠状病毒陕西流行株N和HE基因序列分析及编码蛋白分子特征预测

发布时间：2024-02-22 20:56

　　为了解牛冠状病毒(Bovine coronavirus,BCoV)陕西流行株的N和HE基因的遗传变异情况及分子结构特征,便于以后制备检测抗原。利用GenBank收录的BCoV参考株的N和HE基因序列,设计合成特异性PCR引物,以陕西省某牛场BCoV阳性样本基因组为模板,分别对N和HE基因进行扩增、测序、序列分析及预测编码蛋白分子特征。结果表明,成功克隆了BCoV陕西流行株的N和HE全基因序列;核苷酸序列分析表明,陕西流行株N基因与国内外已报道的BCoV核苷酸同源性在98.38%～99.54%之间,HE基因核苷酸同源性在97.01%～98.09%之间。研究结果为BCoV陕西流行株分子生物学特性研究提供基础资料,为进一步研制BCoV抗体ELISA检测方法奠定基础。

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【部分图文】：

图1N和HE基因的PCR扩增

使用NCBIBLAST后发现,N基因测序结果与GenBank已收录的BCoV毒株(MK095166.1、MK095170.1、MK095173.1、MK095165.1、MK095162.1等)N基因相似性在98.38%～99.54%之间,证明BCoVN基因保守程度非常高。使....

图2N基因核苷酸序列系统进化树

HE基因测序结果与GenBank已收录的BCoV毒株(MK688459.1、MK903507.1、MH043953.1、AF230524.1、MK095147.1等)HE基因相似性在97.01%～98.09%之间,证明BCoVHE基因较保守。用DNAStar-MegAlign软....

图3HE基因核苷酸序列系统进化树

图2N基因核苷酸序列系统进化树2.3N、HE蛋白分子特征预测

本文编号：3907255