不同体重鹅肝脏转录组的功能分析

发布时间：2024-04-08 04:30

　　旨在探讨肝调节营养物质吸收转化影响鹅平均日增重的分子机制。本研究依据平均日增重将70日龄的四川白鹅进行分组(高:H;中:M;低:L),然后采用RNA-Seq技术分析各组肝RNA表达,筛选出差异表达基因,并对其进行功能富集及聚类关联分析。结果显示,H、M和L组的平均日增重差异显著(P<0.05),分别为(52.24±0.41)、(44.44±0.42)和(37.80±0.47) g·d^-1。从测序数据分别鉴定出14 632、14 651和14 819个表达基因,其中有13 776个基因共表达。Top 100的基因表达量占所有基因表达量的65.38%～70.37%,其中,有85个共表达基因,17个特异性表达基因。鉴定出435个差异表达基因,主要富集于细胞凋亡、蛋白重折叠、胰岛素分泌、营养反应、细胞增长、氨基酸转运、cAMP信号通路等生物学过程。聚类构建的5个差异表达基因模块与平均日增重和脂质代谢指标显著相关(|r|≥0.75,P<0.05)。总体而言,本研究鉴定了体重相关的潜在候选基因和代谢通路,初步探讨了肝调节营养物质吸收转化影响鹅体重的分子机制,以使人...

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【部分图文】：

图1基因表达分析

不同组之间表达的基因数量基本一致(H组为13390～13690个;M组为13445～13776个;L组为13321～14184个)。剔除平均FPKM值为零的基因后,H、M和L组分别有14632、14651和14819个表达基因,其中有13776个共表达基因。关....

图2差异表达基因分析

为了准确反映组间基因表达的差异,需剔除掉13776个共表达基因中FPKM值为零的基因,得到11920个基因用于差异分析,分别鉴定出了199(HvsM)、175(HvsL)和187(MvsL)个差异表达基因(图2A)。层级聚类分析显示,差异基因可以根据不同体重组分为....

图3差异表达基因模块分析

由于分析单个基因表达量提取的生物学信息有限,故为了从全基因组表达数据中提取出更多的生物学信息,在此构建了差异表达基因模块,并与表型性状进行了关联分析。如图3A所示,由435个差异表达基因构建出5个基因模块,并且单个基因模块内部的基因之间具有较强相关性,而不同模块之间显示较低的相关....

本文编号：3948492