猪沙波病毒CH430株全基因组测序及VP1 S区原核表达

发布时间：2024-05-18 01:45

　　沙波病毒(Sapovirus, SaV)又名札幌病毒、札如病毒,是一种重要的肠道病原体,能够引起人和动物非细菌性急性胃肠炎,主要以粪便-口腔途径传播。它能够感染人和猪、牛、狗、蝙蝠与貂等多种动物,宿主谱宽。猪沙波病毒(porcine Sapovirus,PoSaV)分布广泛,在发达国家和发展中国家的猪群中普遍存在,主要导致仔猪腹泻,甚至在一些无症状猪群中也可检出PoSaV,因此研究PoSaV的基因组特征和遗传变异对于预防该病及食品卫生具有重要作用。 本研究中我们设计了10组特异性引物,应用one-step RT-PCR方法以西北分离株PoSaVCH430病毒RNA为模板进行扩增,获得了PoSaV CH430株全基因组序列,这是中国西北地区首株被全基因组测序的PoSaV。除去30个碱基的poly(A)尾,PoSaV CH430株基因组RNA长7342nt,包括5’-UTR、2个ORFs和3’-UTR=PoSaV CH430株序列以三核苷酸GTG开始,在基因组和亚基因组的5’端(GTGA/TTCGTGATGGC/AT/G)存在有保守序列Kozak元件(下划线标注序列)。5’-UTR有9个碱...

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【部分图文】：

图1.1杯状病毒负染电镜图片A和B为猪沙波病毒；C为诺瓦克病毒：白色标准线为50nmFig.1.1TheElectronmicrographpicturesofCaliciviruses.PorcineSapoviruswasshowedinAandB,Norwalk

NoV)(Kapikianetal.,1972)?电镜下病毒粒子呈圆形，表面粗糙，内径约为27nm,外径为32nm，如图1.1C。免疫电镜技术作为一种病毒鉴定的标准方法，成功鉴定了多种肠道病毒，也为SaV的发现提供了实验条件。1977年10月，日本札幌市一幼儿园爆发急性感....

图2.1CH430株全基因组PCR扩増

图2.1CH430株全基因组PCR扩増。Ml:500bpDNA分子质量标准；M2:5000bpDNA分子；1-10:基因组増10个片段Fig.2.1PCRamplificationofthefull-lengthgenomeofCH430.Ml:DL500....

图2.2S1-S〗0重组质粒的鉴定

图2.2S1-S〗0重组质粒的鉴定。M:5000bpDNA分子质量标准；Ml:500DNA分子质量标准；丨：S1片段重组质粒PCR鉴定；2-10:S2-S10片段酶切产物Fig.2.2IdentificationrecombinantplasmidofSIt....

图2.7根据沙波病毒属成员VPl氨基酸序列构建的进化树

用生物学软件MEGA5.0邻接法与最大相似性法构建进化树，因为结果相同，所以只显示利用邻接法构建的进化树（图2.7)。IAAB60927-Sapporo'i >goAAQ17061-Mcii4IGIHumanS3 ICAA60262-Manchesterj....

本文编号：3976271