合作猪SLA-DQA第2、4外显子多态性分析

发布时间：2024-12-08 22:23

　　合作猪是一种生长较慢的小型猪种，放牧性能很强，具有不易疲劳、不惧暴晒和风雪等特殊性能。为研究合作猪SLA-DQA基因外显子2和4遗传多态性及变异特征，确定其等位基因数、核苷酸多态位点、氨基酸多态位点及各个等位基因之间的遗传关系，分析其进化意义，选用PCR-SSCP对439只合作猪SLA-DQA基因外显子2和4的多态性进行了检测，测序测定了各等位基因序列，构建了同源树以便进一步明确合作猪SLA-DQA基因外显子2和4的各等位基因之间以及与平原猪种、国外猪种的遗传关系。结果显示，在合作猪SLA-DQA外显子2中发现了7个新等位基因，共18个核苷酸多态位点，10个氨基酸多态位点；合作猪SLA-DQA外显子4中发现了4个新等位基因，共6个核苷酸多态位点，4个氨基酸多态位点，说明合作猪SLA-DQA外显子2和4具有较丰富的多态性，群体内可能蕴藏着更加丰富的遗传资源。通过SLA-DQA基因构建的同源树表明，合作猪SLA-DQA基因外显子2和4最初可能由一个等位基因突变分化成一大类基因；合作猪SLA-DQA外显子2和4序列与各个猪种的的SLA-DQA外显子2和4序列具有较高的同源性，预示着这些猪种的S...

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图3-2DQA基因第2外显子扩增产物电泳图

目的条带清晰，分别得到341bp和252bp的片段，片段长度大小一致(见图3-1，图3-2)。

图3-3DQA基因第2外显子SSCP电泳图谱

变性聚丙烯酰胺凝胶在合适的温度下恒定电压进行电色之后对电泳的结果进行观察（见图3-3、图3-4）。

本文编号：4015099