摩拉水牛PRKAA2基因多态性与生长性状的关联分析

发布时间：2024-12-27 06:52

　　 试验旨在探讨PRKAA2基因在摩拉水牛群体中的遗传多态性及其与生长性状的关联性,进而得到显著相关的遗传标记,为摩拉水牛的分子标记辅助选择提供理论依据。利用DNA测序法等技术进行候选基因PRKAA2外显子4及部分内含子3单核苷酸多态性(SNPs)检测,并采用生物信息学方法结合统计软件分析PRKAA2基因与摩拉水牛生长性状的关联性。结果显示,摩拉水牛PRKAA2基因中共检测到4个SNPs位点:c.462 G>A、IVS3.557 T>C、IVS3.560 C>T和IVS3.565 G>A,均包含3种基因型,且符合Hardy-Weinberg平衡。4个SNPs位点在水牛群体中均为中度多态,可以构建3种单倍型,T-C-G-G为优势单倍型,其中IVS3.560 C>T与c.462 G>A位点之间存在完全连锁不平衡,关联分析结果显示,单倍型H2与摩拉水牛体斜长和腰角宽呈显著相关(P<0.05)。c.462 G>A位点与摩拉水牛体高、十字部高、尻长、坐骨端宽和腰角宽呈显著相关,其中GG和AA基因型个体的体高和十字部高均显著高于GA基因型个体,GG基因型...

【文章页数】：10 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 样品采集
    1.2 主要试剂
    1.3 DNA提取
    1.4 引物设计及合成
    1.5 PCR扩增及基因分型
    1.6 数据分析
2 结 果
    2.1 PRKAA2基因PCR扩增结果
    2.2 测序结果
    2.3 PRKAA2基因遗传学分析
        2.3.1 基因型频率、基因频率
        2.3.2 4个SNPs位点在摩拉群体中的遗传特性分析
    2.4 连锁不平衡和单倍型分析
        2.4.1 PRKAA2基因4个SNPs位点的连锁不平衡分析
        2.4.2 PRKAA2基因4个SNPs位点的单倍型种类及其频率的计算分析
    2.5 摩拉水牛PRKAA2基因单倍型与生长性状的关联分析
    2.6 摩拉水牛PRKAA2基因多态性与生长性状的关联分析
3 讨 论
4 结 论



本文编号：4021302