毛皮动物阿留申病毒TaqMan qPCR检测方法的建立及其分子流行病学调查
发布时间:2025-04-18 06:01
阿留申病毒归类为细小病毒科(Parvoviridae)阿留申病毒属(Amdovirus)的成员,目前有6个病毒种,包括水貂阿留申病毒(Aleutian mink disease virus,AMDV)、灰狐阿留申病毒(Gray fox amdoparvovirus,GFAV)、貉蓝狐阿留申病毒(Raccoon dog and arctic fox amdoparvovirus,RFAV)、臭鼬阿留申病毒(Skunk amdoparvovirus,SKAV)、赤狐粪阿留申病毒(Red fox fecal amdovirus,RFFAV)和小熊猫阿留申病毒(red panda amdoparvovirus,RpAPV)。为建立通用于多种阿留申病毒的检测和定量方法,本研究以6种阿留申病毒的VP2基因为参考序列,在其保守区设计特异性引物和探针,采用直接碱裂解法获得病毒DNA,建立TaqMan qPCR方法。结果表明,AMDV、RFAV检测极限分别为4.06×10~1 copies/μl、2.93×10~1 copies/μl,变异系数小于2%。在74份临床样品中,TaqMan qPCR检测阳性率...
【文章页数】:69 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
本文编号:4040647
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图1-1VP2和NS1蛋白复制相关位点区段分析
aspase-7在RFAV、RpFAV和RFFAV的活化受阻而不能启动裂解作用,导致子代病毒生成量增加,感染进程加快,易感且耐受力低的动物出现病症。而417DLLD↓G421在AMDV中具有高度保守性以保证AMDV在宿主动物体内呈自限性复制。但在其它新种阿留申病毒中,该位点可能并....
图1-2VP2和NS1蛋白致病性位点、抗原区比对分析
中国农业科学院硕士学位论文第一章绪论9细胞表面的FcRIIA结合促使病毒侵入细胞,FcRIIA受体可能是阿留申病毒抗体复合物的受体。小鼠单核细胞、人单核细胞、B细胞、嗜碱性粒细胞以及网状内皮系统细胞表面都有FcRII受体,这些细胞也可能是阿留申病毒感染的靶细胞(DWORAKeta....
图3-2阿留申病毒VP2基因核苷酸同源性比较
中国农业科学院硕士学位论文第三章毛皮兽阿留申病毒分子流行病学调查27总体上,阿留申病毒种间NS1蛋白差异性大,VP2蛋白较保守。本实验室克隆获得DA-RD7、DA-RD15、ZJ-L3、ZJ-L5、HB-Y4、HB-Y5的VP2蛋白之间氨基酸、核苷酸相似性分别为95.7%<sup....
图3-3阿留申病毒VP2蛋白氨基酸同源性比较
中国农业科学院硕士学位论文第三章毛皮兽阿留申病毒分子流行病学调查27总体上,阿留申病毒种间NS1蛋白差异性大,VP2蛋白较保守。本实验室克隆获得DA-RD7、DA-RD15、ZJ-L3、ZJ-L5、HB-Y4、HB-Y5的VP2蛋白之间氨基酸、核苷酸相似性分别为95.7%<sup....
本文编号:4040647
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