利用标记辅助最佳线性无偏差预测法选择高产仔数大白母猪的研究

发布时间：2017-06-08 12:16

  本文关键词：利用标记辅助最佳线性无偏差预测法选择高产仔数大白母猪的研究，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：产仔数是母猪繁殖重要的组成性状,提高母猪产仔数能够显著地提高生产效率和经济效益。然而猪的繁殖性状遗传力低,受环境因素影响较大,并且为限性性状,从而导致了传统选择效果不大。随着分子生物学以及生物信息学等新兴学科的发展与成熟,采用标记辅助选择能成功地解决这一难题。我们首先检测了武汉西湖州大白猪群(472头)4个控制猪繁殖性状候选主效基因雌激素受体基因(ESR)、促卵泡素β亚基基因(FSHβ)、钙粘蛋白类似物基因(CTNNAL1)、mi R-27a基因的基因型。结果表明:在大白猪群中4个位点上存在不同程度的多态性。我们同时对4个候选基因在猪群中的遗传效应进行了分析。结果如下:1.ESR、mi R-27a、FSHβ位点A等位基因的频率分别是0.58、0.80、0.16;CTNNAL1位点G等位基因的频率是0.67。2.通过四个候选基因与大白猪繁殖性状的关联分析发现:ESR基因BB基因型的头胎总产仔数比AA基因型高0.72头/胎(P0.05)。FSHβ基因头胎总产仔数BB基因型比AA基因型高1.81头/胎(P0.05);BB基因型总胎次总产仔数比AA基因型高1.25头/胎(P0.05),加性效应为0.48头/胎(P0.05);总胎次产活仔数AB、BB基因型分别比AA基因型高1.36头/胎(P0.05)、1.49头/胎(P0.05),且加性效应为0.65头/胎(P0.05)。CTNNAL1基因经产总产仔数CG基因型比GG基因型高0.55头/胎(P0.05),显性效应为0.27头/胎(P0.05);总胎次总产仔数CG基因型显著比GG基因型高0.50头/胎(P0.05);总胎次产活仔数GG基因型比CC基因型高0.55头/胎(P0.05),加性效应为0.18头/胎(P0.05)。mi R-27a基因对大白猪的产仔数性状没有显著性影响。3.通过四个候选基因两两合并基因型与繁殖性状的关联分析发现:ESR、FSHβ两个基因的最优基因型是AABB;ESR、CTNNAL1两个基因的最优基因型是AACG;ESR、mi R-27a两个基因的最优基因型是AAAA;FSHβ、CTNNAL1两个基因的最优基因型是BBCG;FSHβ、mi R-27a两个基因的最优基因型是BBAA;CTNNAL1、mi R-27a两个基因的最优基因型是CGAA。4.通过对四个候选基因估计育种值与繁殖性状的关联分析发现:ESR基因中B等位基因为有利等位基因,有利于头胎产活仔数估计育种值、经产总产仔数估计育种值增加和头胎死胎数估计育种值、头胎木乃伊数估计育种值、总胎次出生窝重估计育种值减少;FSHβ基因中B等位基因为有利等位基因,有利于头胎总产仔数估计育种值、经产产活仔数估计育种值、总胎次断奶仔猪数估计育种值的增加和经产木乃伊数估计育种值减少;CTNNAL1基因中G等位基因为有利等位基因,有利于头胎总产仔数估计育种值、经产产活仔数估计育种值、总胎次出生窝重估计育种值的增加和头胎死胎数估计育种值减少;mi R-27a基因中A等位基因为有利等位基因,有利于经产总产仔数估计育种值、总胎次总产仔数估计育种值、出生窝重估计育种值增加和头胎死胎数估计育种值、经产木乃伊数估计育种值减少。
【关键词】：猪 MBLUP ESR基因 FSHβ基因 CTNNAL1基因 mi R-27a基因 估计育种值
【学位授予单位】：华中农业大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2016
【分类号】：S828
【目录】：

• 摘要8-10
• Abstract10-12
• 第一章 文献综述12-24
• 1 引言12-13
• 2 关于猪繁殖性状的遗传改良方法13-16
• 2.1 利用杂交手段进行繁殖性状的改良13
• 2.2 通过常规选择改良猪的繁殖性状13-14
• 2.3 利用标记辅助选择改良猪繁殖性状14-16
• 2.3.1 寻找主效基因或QTL的方法14-15
• 2.3.2 影响标记辅助选择效率的因素15-16
• 2.3.3 标记辅助选择的应用16
• 3 标记辅助最佳线性无偏差预测法16-17
• 4 候选基因17-19
• 4.1 关于ESR基因17
• 4.2 关于FSHβ 基因17-18
• 4.3 关于mi R-27a基因18
• 4.4 关于CTNNAL1基因18-19
• 5 估计育种值研究进展19-23
• 5.1 育种值的概念19-20
• 5.2 育种值估计的方法20-21
• 5.3 准确估计育种值的意义21-22
• 5.4 育种值估计不足和今后的发展趋势22-23
• 6 选题的目的与意义23-24
• 第二章 材料与方法24-36
• 1. 实验材料24-26
• 1.1 实验样品24
• 1.2 主要仪器和设备24-25
• 1.3 主要试剂与试剂盒25
• 1.4 常用试剂及配制25-26
• 2 试验方法26-36
• 2.1 猪基因组DNA的提取26-28
• 2.1.1 猪血液提取基因组DNA26-27
• 2.1.2 猪毛发提取基因组DNA27-28
• 2.2 候选基因引物的设计与合成28
• 2.3 候选基因片段序列扩增28-29
• 2.4 候选基因的PCR-RFLP酶切分型29
• 2.5 数据的处理29-36
• 2.5.1 基因型遗传效应分析29-30
• 2.5.2 育种值的估计30-36
• 2.5.2.1 育种值估计的材料30
• 2.5.2.2 育种值估计统计分析模型30-32
• 2.5.2.3 育种值估计的统计计算方法32-35
• 2.5.2.4 估计育种值与基因型的的关联分析35-36
• 第三章 结果与分析36-56
• 1 候选基因片段的PCR扩增结果36-37
• 2 候选基因位点的PCR-RFLPs37-38
• 3 候选基因位点多态性分布38-40
• 4 候选基因位点在试验群体中遗传效应的分析40-45
• 4.1 ESR基因位点40-41
• 4.2 FSHβ 基因位点41-43
• 4.3 CTNNAL1基因位点43-44
• 4.4 mi R-27a基因位点44-45
• 5 双标记组合对繁殖性状的影响45-50
• 5.1 ESR、FSHβ 两个位点合并基因型对繁殖性状的影响45-46
• 5.2 ESR、CTNNAL1两个位点合并基因型对繁殖性状的影响46-47
• 5.3 ESR、mi R-27a两个位点合并基因型对繁殖性状的影响47-48
• 5.4 FSHβ、CTNNAL1两个位点合并基因型对繁殖性状的影响48-49
• 5.5 FSHβ、mi R-27a两个位点合并基因型对繁殖性状的影响49-50
• 5.6 CTNNAL1、mi R-27a两个位点合并基因型对繁殖性状的影响50
• 6 四个候选基因繁殖性状育种值的估计50-56
• 6.1 ESR基因繁殖性状的估计育种值50-52
• 6.2 FSHβ 基因繁殖性状的估计育种值52-53
• 6.3 CTNNAL1基因繁殖性状的估计育种值53-54
• 6.4 mi R-27a基因繁殖性状的估计育种值54-56
• 第四章 讨论56-63
• 1 关于4个标记的遗传效应分析56-61
• 1.1 单个标记的遗传效应56-60
• 1.1.1 ESR在试验群体中的遗传效应56-57
• 1.1.2 FSHβ 在试验群体中的遗传效应57-58
• 1.1.3 CTNNAL1在试验群体中的遗传效应58-59
• 1.1.4 mi R-27a在试验群体中的遗传效应59-60
• 1.2 两个标记的遗传效应60-61
• 1.2.1 ESR分别和FSHβ、CTNNAL1、mi R-27a基因合并基因型的遗传效应60-61
• 1.2.2 FSHβ 分别和CTNNAL1、mi R-27a基因合并基因型的遗传效应61
• 1.2.3 CTNNAL1和mi R-27a基因合并基因型的遗传效应61
• 2 四个候选标记的繁殖性状估计育种值分析61-63
• 2.1 ESR基因繁殖性状估计育种值分析61-62
• 2.2 FSHβ 基因繁殖性状估计育种值分析62
• 2.3 CTNNAL1基因繁殖性状估计育种值分析62
• 2.4 mi R-27a基因繁殖性状估计育种值分析62-63
• 第五章 小结63-64
• 第六章 本研究的创新之处64-65
• 参考文献65-71
• 硕士期间已发表论文71-72
• 致谢72

【参考文献】

中国期刊全文数据库 前6条

1 鲁绍雄;胡晓湘;连林生;吴常信;严达伟;李宁;任文辉;赵中保;;撒坝猪ESR和FSH-β基因多态性及其与产仔数的关联分析[J];云南农业大学学报;2009年03期

2 张笑实;吴潇;王起山;赵洪波;徐光华;毕波;潘玉春;;ESR基因PvuⅡ多态性在高产大白猪系育种中的应用[J];上海交通大学学报(农业科学版);2008年06期

3 施启顺;柳小春;刘志伟;李小平;李永辉;唐凡;;5个与猪产仔数相关基因的效应分析[J];遗传;2006年06期

4 吴为人,周元昌,李维明;数量性状基因型选择与基因型值选择潜力的比较[J];科学通报;2002年18期

5 陈克飞,黄路生,李宁,张勤,张建生,孙士铨,罗明,吴常信;猪FSHβ及ESR合并基因型对猪产仔数性状的影响[J];科学通报;2000年18期

6 赵要风,李宁,肖璐,曹更生,陈怡真,张顺,陈永福,吴常信,张建生,孙士铨,徐学清;猪FSHβ亚基基因结构区逆转座子插入突变及其与猪产仔数关系的研究[J];中国科学C辑:生命科学;1999年01期

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本文编号：432504