牦牛KAP1家族基因长度多态研究
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【摘要】:试验旨在研究牦牛角蛋白关联蛋白1(keratin associated protein 1,KAP1)家族基因长度多态与重复序列特点。研究对牦牛和黄牛KAP1家族基因进行测序,并与绵羊已知序列进行比较分析。结果发现,牛KAP1家族位于19号染色体,根据绵羊KAP1家族基因在染色体上的位置与相似性,重新命名了牛KAP1家族基因B2D、B2A、KAP1-1和B2C为KAP1-4、KAP1-1、KAP1-2、KAP1-3(按照染色体上的基因顺序)。KAP1家族基因之间在3′和5′端区域高度保守,中间有重复序列长度差异,其中牦牛KAP1-KAP4基因发现有30bp的长度多态。研究其蛋白序列发现5个氨基酸为基序的重复序列B(CCQTS)A1(CCQPT),以及一个新的重复序列C(SIQTS)。本研究结果说明重复序列是KAP1家族基因间和基因内的主要差异区域,这可能与其角蛋白结合螺旋数相关。
【作者单位】: 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所;内蒙古国际蒙医医院;西南大学;中山大学;
【关键词】: KAP家族基因 牦牛 长度多态 重复序列
【基金】:"十一五"国家科技支撑计划资助项目(2008BADB2B01) 中国农业科学院对CAAS-ILRI联合实验室的资助基金
【分类号】:S823
【正文快照】: 角蛋白关联蛋白(keratin-associated proteins,KAPs)主要是与角蛋白相结合并共同形成毛发的主干[1]。基于其蛋白序列的相似性KAPs被分为23个家族[2]。KAP蛋白根据氨基酸特点又被分为3类[3-4]:第一类为高甘氨酸酪氨酸蛋白(HGT),由KAP6-8、KAP18-22家族编码;第二类为高硫蛋白(HS
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