MyoG、GH和CKM基因多态性及其与藏羊生长发育性状的关联性分析

发布时间：2017-06-29 06:09

  本文关键词：MyoG、GH和CKM基因多态性及其与藏羊生长发育性状的关联性分析，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：本试验以贵南县黑藏羊(GN),祁连县高原型藏羊(QL),河南县欧拉型藏羊羊(HN)共632只羊血液为研究对象,采用PCR-SSCP分子标记方法结合DNA测序对MyoG、GH和CKM基因的多态性及其与藏羊生长发育性状的相关性进行分析,目的在于探索MyoG、GH和CKM基因对藏羊生长发育的影响,筛选出了对藏羊生长发育有重要影响的功能基因和分子标记,以期为藏羊的育种提供重要的理论依据。MyoG基因在3个藏羊群体中检测到2个突变位点,分别为g.109AC(第1外显子)和g.1403AC(第1内含子);GH基因在所研究群体中检测到3个突变位点,分别为g.498GC(第2外显子)、g.616GA(第2内含子)和g.624GA(第2内含子);CKM基因在所研究群体中检测到2个突变位点,分别为g.8068CG(第6内含子)和g.8322AG(第7内含子);各位点的突变情况及不同基因型与生长性状的相关分析结果如下所示:1.藏羊MyoG基因多态性与生长性状的关联分析藏羊MyoG基因g.109AC位点检测到CC、CA、AA三种基因型,该突变引起MyoG基因37号位谷氨酸(GAG)→丙氨酸(GCG)的错义突变;该突变位点在3个群体中为中度多态;相关性表明在HN群体中CC基因型的体重、体高和体长显著高于AA基因型个体(P0.05),QL群体中CC基因型体重显著高于AA基因型(P0.05),GN群体中CC基因型个体的体高和体长显著低于AA基因型(P0.05)。g.1403AC位点检测到AA、AC和CC三种基因型,相关性表明HN群体中AA基因型的体重和体高显著高于CC基因型个体(P0.05),QL群体中AA基因型的体重和体长显著高于CC基因型(P0.05)。2.GH基因多态性与生长性状的关联分析g.498GC位点存在GG、GC和CC 3种基因型,为87号位脯氨酸到脯氨酸的同义突变,GG和G分别为优势基因型和优势等位基因,该位点3个地方群体的藏羊均偏离哈代-温伯格平衡状态,中度多态水平;相关性表明HN群体中GG基因型体重和体长极显著高于CC基因型(P0.01),QL群体中GG基因型的体重、体高、体长和胸围极显著高于CC基因型(P0.01),GN群体中GG基因型的体重和体长显著高于CC基因型(P0.05)。g.616GA存在GG、GA和AA 3种基因型,GG和G分别为优势基因型和优势等位基因,中度多态水平。相关性表明HN群体中AA基因型的体重和体长显著高于GG型(P0.05),体高和胸围极显著高于GG型(P0.01);QL群体中AA基因型体长极显著高于GG型(P0.01);GN群体中AA基因型体重显著高于GG型(P0.05)。g.624GA位点存在GG、GA和AA 3种基因型,GG和G分别为优势基因型和优势等位基因,位点间遗传纯合度表现为祁连县高原型藏羊群体河南县欧拉羊群体贵南县黑藏羊群体,中度多态水平。该位点的各个基因型在3个群体中对体重、体高、体长和胸围4个生长性状无显著性影响(P0.05)。3.CKM基因多态性与生长性状的关联分析g.8068CG位点存在CC、CG和GG 3种基因型,GG和G分别为优势基因型和优势等位基因,为中度多态,在3个地方的藏羊群体均处于哈代-温伯格不平衡状态;相关性表明HN群体中CC基因型体重显著高于GG型(P0.05),体高极显著高于GG型(P0.01),QL群体中CC基因型的体重、体高和胸围显著高于GG型(P0.05),GN群体中CC基因型体重和体长极显著高于GG型(P0.01)。g.8322AG位点存在AA、AG和GG 3种基因型,AA和A分别为优势基因型和优势等位基因,为中度多态,在3个地方的藏羊群体均处于哈代-温伯格不平衡状态,该突变位点对藏羊生长性状没有显著影响。
【关键词】：藏羊 MyoG基因 GH基因 CKM基因 多态性 生长性状
【学位授予单位】：青海师范大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2016
【分类号】：S826
【目录】：

• 中文摘要3-5
• Abstract5-9
• 第一章 文献综述9-21
• 前言9-10
• 1.1 三个藏羊类型简介10-12
• 1.1.1 高原型藏羊简介10-11
• 1.1.2 欧拉型藏羊简介11
• 1.1.3 黑藏羊简介11-12
• 1.2 MyoG、GH和CKM基因研究进展12-16
• 1.2.1 MyoG基因12-13
• 1.2.2 GH基因13-15
• 1.2.3 CKM基因15-16
• 1.3 分子标记技术在家畜育种中的应用及其研究进展16-21
• 1.3.1 分子标记在家畜育种中的应用16-17
• 1.3.2 SNP检测技术17
• 1.3.3 直接测序17
• 1.3.4 限制性酶切片段长度多态性17-18
• 1.3.5 单链构象多态性18-19
• 1.3.6 变性高压液相色谱检测19-20
• 1.3.7 温度梯度凝胶电泳20
• 1.3.8 DNA芯片20-21
• 第二章 MyoG基因SNP检测及与藏羊生长发育的关联性分析21-39
• 2.1 材料与方法21-30
• 2.1.1 试验材料21-23
• 2.1.2 试验方法23-28
• 2.1.3 统计分析28-30
• 2.2 结果与分析30-36
• 2.2.1 藏羊血液基因组DNA的提取效果30
• 2.2.2 藏羊MyoG基因的PCR扩增结果30-31
• 2.2.3 藏羊MyoG基因SSCP检测结果31-32
• 2.2.4 藏羊MyoG基因DNA测序结果32-33
• 2.2.5 MyoG基因第1外显子多态性及与生长性状的相关性分析33-34
• 2.2.6 MyoG基因第1内含子多态性及与生长性状的相关性分析34-36
• 2.3 讨论36-38
• 2.4 小结38-39
• 第三章 GH基因SNP检测及与藏羊生长发育的关联性分析39-51
• 3.1 材料与方法39-40
• 3.1.1 试验材料39
• 3.1.2 试验方法39-40
• 3.1.3 统计分析40
• 3.2 结果与分析40-48
• 3.2.1 GH基因生物信息学分析40-42
• 3.2.2 藏羊GH基因的PCR扩增结果42-43
• 3.2.3 藏羊GH基因测序及突变位点基因型分析43-44
• 3.2.4 藏羊GH基因突变位点遗传多态性分析44-46
• 3.2.5 g.498G>C突变位点与藏羊体尺性状的相关性分析46-47
• 3.2.6 g.616G>A突变位点与藏羊体尺性状的相关性分析47
• 3.2.7 g.624G>A突变位点与藏羊体尺性状的相关性分析47-48
• 3.3 讨论48-50
• 3.4 小结50-51
• 第四章 CKM基因SNP检测及与藏羊生长发育的关联性分析51-60
• 4.1 材料与方法51-52
• 4.1.1 试验材料51
• 4.1.2 试验方法51-52
• 4.1.3 统计分析52
• 4.2 结果与分析52-58
• 4.2.1 CKM基因生物信息学分析52-54
• 4.2.2 藏羊CKM基因的PCR扩增结果54-55
• 4.2.3 藏羊CKM基因测序分型及多态信息分析55-57
• 4.2.4 g.8068C>G突变位点与藏羊体尺性状的相关性分析57
• 4.2.5 g.8322A>G突变位点与藏羊体尺性状的相关性分析57-58
• 4.3 讨论58-59
• 4.4 小结59-60
• 第五章 结论60-61
• 参考文献61-67
• 攻读硕士学位期间发表的论文67-68
• 致谢68

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本文编号：496821