贵州白山羊L-FABP和H-FABP基因表达、多态性与生长性状的遗传效应研究

发布时间：2017-07-08 13:01

  本文关键词：贵州白山羊L-FABP和H-FABP基因表达、多态性与生长性状的遗传效应研究

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【摘要】：为研究贵州白山羊L-FABP和H-FABP基因表达及多态性与生长性状的关联性,以期得到能够影响贵州白山羊各群体生长性状显著效应的分子遗传标记。本试验利用DNA混合池、PCR产物直接测序和PCR-SSCP技术方法检测L-FABP和H-FABP基因单核苷酸多态性,利用SPSS 18.0软件中一般线性模型对不同基因型与生长性状指标进行相关性分析;同时利用在线软件对L-FABP和H-FABP基因RNA结构和蛋白各级结构进行生物信息学分析,利用实时荧光定量PCR法分析贵州白山羊L-FABP和H-FABP基因在不同组织中mRNA表达规律。研究结果如下:1.多态位点检测结果表明,贵州白山羊L-FABP基因内含子2处存在C4557T和A4575G两个突变位点,H-FABP基因外显子3和外显子5处存在G4713C和C8228T两个同义突变位点。2.遗传效应分析结果表明,L-FABP基因C4557T和A4575位点多态座位有利于提高贵州白山羊体重、体高、体斜长和管围,其中CCGG有利于提高贵州白山羊成年母羊的体高和体斜长;TTGG有利于提高贵州白山羊周岁母羊的体重和管围。H-FABP基因C8228T位点基因型CC有利于提高周岁羊全群部分生长性状指标。3.生物信息学表明,山羊H-FABP基因两个突变位点可使RNA二级结构发生改变,对蛋白质的各级结构均无影响,且两蛋白理化性质均稳定,且含有的氨基酸残基大多数都是亲水性的不含跨膜结构域和信号肽,也不属于膜蛋白或分泌蛋白,被定位于真核生物细胞质中。4.qRT-PCR检测结果表明,在成年贵州白山羊9个组织中,L-FABP基因在肝和十二指肠表达量较高,心和股二头肌表达量最低;H-FABP基因在心和股二头肌表达较高,肝表达量最低,两基因之间可能存在拮抗作用。
【关键词】：贵州白山羊 L-FABP基因 H-FABP基因 生长性状 实时荧光定量PCR
【学位授予单位】：贵州大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2016
【分类号】：S827
【目录】：

• 摘要9-10
• Abstract10-12
• 第一章 文献综述12-27
• 1.1 前言12-13
• 1.2 贵州白山羊品种介绍13-14
• 1.3 PPAR信号通路14-16
• 1.4 FABP发现与命名16
• 1.5 L-FABP候选基因研究概述16-21
• 1.5.1 L-FABP基因结构与功能16-18
• 1.5.2 L-FABP与疾病研究18-20
• 1.5.3 L-FABP基因与畜禽生长研究20-21
• 1.6 H-FABP候选基因研究概述21-26
• 1.6.1H-FABP基因结构与功能21-22
• 1.6.2 H-FABP与疾病研究22-24
• 1.6.3 H-FABP基因与畜禽生长研究24-26
• 1.7 研究目的及意义26-27
• 第二章 贵州白山羊L-FABP和H-FABP基因多态性及其与生长性状遗传效应研究27-62
• 2.1 试验材料27-30
• 2.1.1 试验样本27
• 2.1.2 试验主要仪器27-28
• 2.1.3 试验主要试剂及溶液28-30
• 2.2 试验方法30-38
• 2.2.1 贵州白山羊生长性状指标测定30
• 2.2.2 试验羊血液基因组DNA的提取及检测30-31
• 2.2.3 PCR反应31-34
• 2.2.4 SNPs筛选及验证34-36
• 2.2.5 数据统计分析36-38
• 2.3 结果与分析38-57
• 2.3.1 基因组DNA提取结果38-39
• 2.3.2 PCR扩增结果39-41
• 2.3.3 DNA池PCR产物测序结果41-42
• 2.3.4 PCR-SSCP检测多态性42-44
• 2.3.5 SNPs位点测序验证44-47
• 2.3.6 SNPs位点群体遗传结构分析47-51
• 2.3.7 试验群体生长性状遗传效应分析51-57
• 2.4 讨论57-61
• 2.4.1 L-FABP和H-FABP基因多态性检测及其多态性技术探讨57-59
• 2.4.2 L-FABP和H-FABP基因在山羊群体中的遗传结构分析59-60
• 2.4.3 L-FABP和H-FABP基因多态性与山羊生长性状遗传效应分析60-61
• 2.5 小结61-62
• 第三章 山羊L-FABP和H-FABP基因生物信息学分析62-83
• 3.1 材料与方法62-64
• 3.1.1 材料62
• 3.1.2 山羊L-FABP和H-FABP蛋白一级序列分析62-63
• 3.1.3 山羊L-FABP和H-FABP基因RNA二级结构分析63
• 3.1.4 山羊L-FABP和H-FABP蛋白二级结构分析63-64
• 3.1.5 山羊L-FABP和H-FABP蛋白三级结构分析64
• 3.2 结果与分析64-80
• 3.2.1 山羊L-FABP和H-FABP蛋白一级序列分析64-70
• 3.2.2 山羊L-FABP和H-FABP基因RNA二级结构分析70
• 3.2.3 山羊L-FABP和H-FABP蛋白二级结构分析70-79
• 3.2.4 山羊L-FABP和H-FABP蛋白三级结构分析79-80
• 3.3 讨论80-82
• 3.3.1 山羊L-FABP和H-FABP蛋白一级结构分析80-81
• 3.3.2 山羊L-FABP和H-FABP基因RNA二级结构分析81
• 3.3.3 山羊L-FABP和H-FABP蛋白二级和三级结构分析81-82
• 3.4 小结82-83
• 第四章 贵州白山羊L-FABP和H-FABP基因表达调控分析83-93
• 4.1 材料与方法83-84
• 4.1.1 试验样品83
• 4.1.2 试验主要仪器83-84
• 4.1.3 试验主要试剂84
• 4.2 试验方法84-86
• 4.2.1 总RNA提取84-85
• 4.2.2 总RNA的检测及反转录85
• 4.2.3 引物设计85-86
• 4.2.4 Real-time PCR反应86
• 4.2.5 数据分析86
• 4.3 试验结果与分析86-90
• 4.3.1 总RNA的提取及完整性检测86-87
• 4.3.2 PCR扩增结果87-88
• 4.3.3 Real-time PCR扩增曲线和熔解曲线88-89
• 4.3.4 L-FABP和H-FABP基因在贵州白山羊不同组织中表达规律89-90
• 4.4 讨论90-92
• 4.4.1 L-FABP和H-FABP基因在贵州白山羊不同组织中表达分析90-91
• 4.4.2 Quantitative Real-time PCR实验总结91-92
• 4.5 小结92-93
• 第五章 结论93-95
• 5.1 主要结论93
• 5.2 研究创新点93
• 5.3 进一步需要开展的工作93-95
• 参考文献95-104
• 致谢104-106
• 附录106-109

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本文编号：534617