2014-2015年我国部分地区候鸟禽流感病毒的鉴定及序列分析

发布时间：2017-08-08 19:26

  本文关键词：2014-2015年我国部分地区候鸟禽流感病毒的鉴定及序列分析

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【摘要】：禽流感病毒属于正黏病毒科,流感病毒属,为单股、负链、分节段RNA病毒。作为A型禽流感病毒的自然宿主,候鸟通过迁徙为病毒的传播、感染以及变异重排提供有利条件。因此,开展候鸟禽流感监测,不仅对阐明禽流感病毒在其自然宿主中的流行病学情况具有重要意义,还能为家禽和人禽流感的监测与预警工作提供重要参考依据。为了解禽流感病毒(AIV)的遗传进化关系和相关生物学特性,本研究室自2014年起,先后从我国吉林省、河南省、河北省、湖南省、青海省、内蒙古等中国部分地区采集多种候鸟的拭子、粪便等7447份样品中分离出H4N6、H5N1、H5N6、H5N8、H6N5、H9N2、H9N7、H13N6、H13N8亚型流感病毒37株,本研究选择其中公共卫生意义重大的H5N1亚型4株、H5N6亚型2株、H10N7亚型1株并对分离到的这7株AIVs进行了一系列分析研究,包括全基因组序列测定、遗传进化分析以及重排与变异分析。4株H5N1亚型AIVs遗传进化分析表明,均属于2.3.2.1C谱系,形成独立的分支且彼此具有很高亲缘关系。序列分析表明,4株AIVs的HA蛋白的裂解位点(R-R-R-K/-/R-G)符合高致病性禽流感的分子生物学特征;HA蛋白大部分受体结合位点均比较保守,但个别位点发生了变异,可能会导致AIVs分离株的宿主感染谱进一步增大。4株AIVs NA蛋白具有3个潜在的糖基化位点且茎部均缺失20个氨基酸。4株H5N1亚型AIVs分离株均发生了NA基因I314V、M2基因V27A的突变,因此从分子水平推测这些毒株可能会对神经氨酸酶抑制剂和M2离子通道抑制剂产生一定的耐药性。NS氨基酸序列第80-84位缺失5个氨基酸,提示病毒具有抗干扰素活性。H5N6亚型AIVs分离株遗传进化分析表明该毒株为近年来新变异的2.3.4.4谱系。其中,H5N6亚型AIV长沙分离株(A/Peacock/Hunan/HN-1/2015)为H5N8和H5N6重排毒株。2株H5N6亚型AIVs分离株HA蛋白的裂解位点(R-R-R-K/-/R-G)符合高致病性禽流感病毒特征;长沙株病毒HA蛋白受体结合位点发生了K205N、Q208K变异,且该毒株HA蛋白糖基化位点在209(NPT)发生了缺失。2株AIVs NA氨基酸序列在13-19位多7个氨基酸,NA氨基酸茎部56-74位缺失19个氨基酸。常德分离株NS氨基酸序列于79-84位发生6个氨基酸的缺失变异,而长沙分离株未发生缺失变异。在耐药性方面,两株病毒的NA基因均发生了V116A、I117V、I314V变异,提示病毒对神经氨酸酶抑制剂均产生了一定耐药性。2株AIVs M2相关位点均未发生相关变异,表明M2离子通道抑制剂仍然对该亚型产生有效的抑制作用。H10N7亚型AIV分离株遗传进化分析表明该分离株属于欧亚谱系,且与多种亚型流感病毒株相应基因节段相似性很高,表明该分离株可能为一株多源重组流感病毒。序列分析表明其HA蛋白裂解位点(NVPEL-QGR/G)符合低致病禽流感病毒株的特征,且具有226Q、228G位点表明其更容易结合a-2,3受体,具有禽样受体结合特性。存在6个潜在的糖基化位点,没有发生缺失或突变。本研究表明,候鸟中发现的H5N1、H5N6和H10N7表现出明显重排与变异,提示加强候鸟禽流感的监测对禽流感综合防控具有重要意义。
【关键词】：禽流感病毒 候鸟 遗传进化 序列分析
【学位授予单位】：吉林农业大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2016
【分类号】：S852.65
【目录】：

• 摘要3-5
• Abstract5-7
• 英文缩写词表7-9
• 前言9-10
• 第一篇 文献综述10-16
• 1.1 候鸟迁徙与禽流感病毒传播的关系10-11
• 1.2 禽流感的流行情况11-13
• 1.3 禽流感病毒致病力和传播能力相关分子基础13-15
• 1.4 禽流感病毒耐药性相关分子基础15-16
• 第二篇 研究内容16-82
• 第一章 H5N1亚型AIV鉴定及基因序列分析16-45
• 1.1 材料与方法16-17
• 1.2 实验方法17-23
• 1.3 结果23-42
• 1.4 讨论42-45
• 第二章 H5N6亚型AIV鉴定及基因序列分析45-68
• 2.1 材料与方法45
• 2.2 实验方法45-46
• 2.3 结果46-66
• 2.4 讨论66-68
• 第三章 H10N7亚型AIV鉴定及基因序列分析68-82
• 3.1 材料与方法68
• 3.2 实验方法68-69
• 3.3 结果69-80
• 3.4 讨论80-82
• 结论82-83
• 参考文献83-88
• 作者简介88-89
• 致谢89

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本文编号：641684