基于高通量测序的肉牛垫料养殖床中细菌群落分析

发布时间：2017-08-23 23:16

  本文关键词：基于高通量测序的肉牛垫料养殖床中细菌群落分析

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【摘要】：利用Roche 454GSFLX+高通量测序平台分析了肉牛垫料养殖床中的细菌群落结构,结果显示,从发酵床样品中共获得17 772条有效序列,其中优质序列有13 301条,在97%相似水平上聚为1 603个OTU分类单元;目水平上,细菌优势种群集中在芽孢杆菌目(21.70%)、红螺菌目(18.20%)、乳杆菌目(14.90%)、梭菌目(14.10%)、黄杆菌目(10.50%)、伯克氏菌目(5.50%)、黄单胞菌目(3.00%)、放线菌目(2.10%)和根瘤菌目(1.80%);属水平上,细菌的优势种群主要集中于醋酸杆菌属(15.17%)、金黄杆菌属(9.50%)、乳杆菌属(6.90%)、芽孢杆菌属(6.30%)、乳球菌属(6.0%)、高温放线菌属(3.50%)、类芽孢杆菌属(2.40%)、梭菌目(2.10%)、伯克氏菌属(2.10%)和葡萄糖醋杆菌属(1.80%)。
【作者单位】： 上海市农业科学院生态环境研究所;上海东保农业科技有限公司;
【关键词】： 垫料养殖 肉牛 细菌种群结构 高通量测序
【基金】：崇明区科技攻关项目(编号:CK2014-11)
【分类号】：S823
【正文快照】： 图2肉牛发酵床中主要细菌优势种群分布(目水平)有关研究表明,一头泌乳牛日平均排泄粪便32.1 kg、尿20.2 kg,按此计算,一家千头奶牛场的年均粪便产生量为11 717 t、尿7 373 t左右,由此对周边环境造成了巨大压力。目前,上海地区奶牛场配套的粪尿处理设施主要为沼气发酵,但其本身，

本文编号：727856