基于RNA-Seq筛选禽致病性大肠杆菌损伤雏鸡小肠差异表达基因

发布时间：2017-08-26 16:31

  本文关键词：基于RNA-Seq筛选禽致病性大肠杆菌损伤雏鸡小肠差异表达基因

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【摘要】：为筛选禽致病性大肠杆菌(APEC)感染雏鸡后其小肠损伤的差异表达基因,本研究利用APEC菌株经腿部肌肉途径接种两周龄雏鸡,对照组鸡以相同的途径注射相同体积的生理盐水,选取病变严重的肠道与对照组肠道,利用高通量RNA-Seq技术筛选出雏鸡小肠受APEC损伤后的差异表达基因,对其进行生物信息学GO功能分类和KEGG信号通路分析,并利用荧光定量PCR验证部分差异表达基因。结果显示差异变化在2倍以上的基因共有131个,其中74个上调表达,57个下调表达。GO功能分类结果显示,这些基因主要涉及到蛋白结合、免疫反应、转运活动等功能。KEGG分析表明这些差异表达基因参与PPAR、新陈代谢、细胞因子受体相互作用、Jak-STAT、RIG-I-样受体、吞噬体等信号通路。本研究为进一步研究APEC的致病作用及宿主抗病机制奠定了基础。
【作者单位】： 安徽农业大学动物科技学院;
【关键词】： 禽致病性大肠杆菌 雏鸡小肠 转录组测序 差异表达基因
【基金】：国家自然科学基金项目(31372402) 安徽省自然科学基金(1508085SQC206)
【分类号】：S858.31
【正文快照】： RNA-Seq技术是指针对转录产物RNA的测序技术,重点在对翻译蛋白的m RNA进行测序研究。有研究利用RNA-Seq获得感染真菌的利马豆的全基因组信息,发现宿主与病原在分子方面的相互作用机制[1]。Xiang等通过RNA-Seq技术分析了海鲈鱼受哈维氏弧菌攻击前后的差异表达基因[2]。RNA-Seq

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本文编号：742388