高通量测序分析20株禽流感病毒全基因

发布时间：2017-09-06 03:43

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【摘要】：为探索使用高通量测序测定和分析禽流感病毒全基因的方法,使用Ion Torrent PGM测序仪对20株自华东地区分离的禽流感病毒进行全基因测序,分析该方法的优缺点,以及此20株病毒的基因组特性和进化特征。结果显示,应用Ion Torrent PGM测序仪能够测出全部20株病毒的全基因,确定其均为H9亚型h9.4.2.5分支的低致病性毒株,NA基因均为N2亚型,并分析了其6个内部基因分子演化关系。说明高通量测序可用于禽流感病毒全基因分析。
【作者单位】： 中国动物卫生与流行病学中心;
【关键词】： 高通量测序 禽流感 全基因 分子演化
【基金】：中国动物卫生与流行病学中心创新基金(2015IF-0004FF)
【分类号】：S852.65
【正文快照】： 禽流行性感冒病毒(avian influenza virus,AIV)简称禽流感病毒,属于正黏病毒科、甲型流感病毒属。甲型流感病毒粒子表面有血凝素(hemag-glutinin,HA)和神经氨酸酶(neuraminidase,NA)两种表面结构蛋白,根据HA和NA的抗原性差异可分别将其分为18种H亚型(H1~H18)和11种N亚型(N1~N1

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本文编号：802013