禽流感病毒传播过程研究

发布时间：2017-09-08 02:37

  本文关键词：禽流感病毒传播过程研究

  更多相关文章： 人源禽流感病毒 禽源禽流感病毒 H7N9 可视化分析 进化与传播规律分析

【摘要】：近年来,禽流感的传播对我国养禽业的发展造成毁灭性的打击,每年都会导致数以百万计的家禽死亡或批量宰杀,经济损失巨大。2013年春季我国出现的新型H7N9禽流感病毒可以感染人类,严重威胁人类健康。对禽流感进行详细的研究分析,制定科学有效的禽流感预防和控制策略,已经成为当务之急。本文第一部分提出了一种基于蛋白质物理化学属性的序列特征提取方法,并将该方法应用于流感病毒的传播规律分析中。本文第二部分运用地理信息系统和生物信息学的技术,以1988-2015年间禽源H7N9流感病毒和2013-2015年人源H7N9流感病毒HA基因序列为研究对象,分析了禽源和人源H7N9流感病毒的进化与传播规律。研究结果有助于人们制定有效的防控措施来控制疫情的传播,减少生命和财产损失。主要工作如下:(1)提出了基于特征融合的序列特征提取方法。本文通过研究流感病毒蛋白质的物理化学属性和生物信息学技术,提出了基于特征融合的序列特征提取方法。并且验证了该方法对禽流感病毒分类的有效性,将该方法应用在流感病毒的传播规律分析中。(2)提出了基于Arc GIS平台的禽流感传播可视化分析方法。可视化分析方法包括两个部分内容。一是在地图上动态演示流感病毒的传播过程。通过使用病毒发生地经纬度的数据,将病毒精确映射到地图背景上。同时将病毒的详细信息按日期制作图层,制作组间动画动态演示病毒的传播过程。二是对流感病毒的空间分布进行相关性分析和热点分析,确定疫情高发区。(3)分析研究了禽源和人源H7N9流感病毒的传播和进化规律。本文在Arc GIS平台上实现了禽源和人源H7N9流感的传播过程的演示及环境因素的分析,分析H7N9禽流感的传播规律。同时对人源禽流感的空间分布进行热点分析,确定疫情高发城市。通过构建遗传系统发育树分析禽源和人源的传播源头,描绘了禽源和人源H7N9禽流感的进化传播模式。分析了禽源H7N9和人源H7N9在中国进化与传播的相互关系,探索了禽到人的感染模式。
【关键词】：人源禽流感病毒 禽源禽流感病毒 H7N9 可视化分析 进化与传播规律分析
【学位授予单位】：石家庄铁道大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2016
【分类号】：S855.3
【目录】：

• 摘要3-4
• Abstract4-8
• 第一章 绪论8-13
• 1.1 课题研究背景8
• 1.2 课题研究的目的及意义8-9
• 1.3 人源H7N9禽流感研究现状9-11
• 1.3.1 临床表现9-10
• 1.3.2 流行病学研究10
• 1.3.3 病原学研究10-11
• 1.4 论文的研究内容和研究方法11
• 1.5 论文结构安排11-13
• 第二章 地理信息系统和生物信息学在流行病学研究中的应用13-18
• 2.1 蛋白质结构简介13-14
• 2.2 地理信息系统与流行病学研究14-15
• 2.2.1 概述14
• 2.2.2 在流行病学中的应用14-15
• 2.2.3 Arc GIS简介15
• 2.3 生物信息学与流行病学研究15-17
• 2.3.1 生物信息学概况15-16
• 2.3.2 生物信息学在禽流感病毒研究中的应用16-17
• 2.4 本章小结17-18
• 第三章 基于特征融合的序列特征提取方法18-29
• 3.1 概述18
• 3.2 蛋白质序特征提取方法简介18-19
• 3.2.1 常用的蛋白质序特征提取方法18-19
• 3.2.2 氨基酸的物化特性简介19
• 3.2.3 特征融合的概念19
• 3.3 基于多种理化属性融合的蛋白质序特征提取方法19-25
• 3.3.1 基于氨基酸物化属性的氨基酸序列的图形表示19-22
• 3.3.2 基于多种物化属性的特征向量的构建和分析22-24
• 3.3.3 蛋白质序列的相似性分析24-25
• 3.4 禽流感病毒分类的有效性分析25-27
• 3.5 本章小结27-29
• 第四章 基于ARCGIS平台的禽流感传播可视化分析方法29-45
• 4.1 概述29
• 4.2 禽流感传播过程可视化的演示方法29-38
• 4.2.1 病毒信息提取和预处理29-33
• 4.2.2 H7N9禽流感疫情传播的可视化33-36
• 4.2.3 禽流感菌株变异情况在地图上的动态演示方案36-38
• 4.3 禽流感病毒传播过程的可视化演示38-42
• 4.3.1 Arc GIS 平台上的禽流感传播过程模拟的实现38-39
• 4.3.2 禽源禽流感传播传播过程模拟39-41
• 4.3.3 人源禽流感传播传播过程模拟41-42
• 4.4 空间聚类分析和环境因素分析42-44
• 4.4.1 基于Arc GIS的空间聚类分析42-44
• 4.4.2 环境因素与H7N9禽流感空间传播规律分析44
• 4.5 本章小结44-45
• 第五章 禽源和人源H7N9流感病毒的进化与传播过程分析45-67
• 5.1 概述45
• 5.2 禽源H7N9流感病毒的传播进化模式45-53
• 5.2.1 基于Arc GIS平台禽源H7N9的进化与传播规律分析46-51
• 5.2.2 禽源H7N9流感病毒的进化特征分析51-53
• 5.3 人源H7N9流感病毒的传播进化模式53-63
• 5.3.1 基于Arc GIS平台人源H7N9的进化与传播规律分析53-61
• 5.3.2 人源H7N9流感病毒的进化特征分析（2013-2015）61-63
• 5.4 禽源H7N9和人源H7N9在中国进化与传播的相互关系63-66
• 5.5 本章小结66-67
• 第六章 结论与展望67-69
• 6.1 结论67
• 6.2 展望67-69
• 参考文献69-73
• 致谢73-74
• 个人简历、在学期间的研究成果及发表的学术论文74

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