牛TRAF6基因的密码子使用偏好性分析

发布时间：2017-09-13 22:25

  本文关键词：牛TRAF6基因的密码子使用偏好性分析

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【摘要】：为揭示TRAF6基因的密码子使用特性及选择合适受体动物、最佳外源表达系统,运用CUSP、CHIPS和CodonW在线软件分析牛TRAF6基因的密码子偏好性,并与模式生物基因组以及其他物种TRAF6基因进行比较。结果表明:牛TRAF6基因大部分偏好使用以G/C结尾的密码子,其中偏好性较强的有CTG(RSCU≥2),并发现大部分物种的TRAF6基因表达水平较低,牛与家绵羊TRAF6基因密码子使用相似,牛TRAF6基因与小鼠基因组的密码子使用频率差异小于大肠埃希氏菌和酵母菌等2种模式生物基因组,故选择小鼠作为TRAF6基因的外源表达宿主。这一研究为TRAF6基因在动物遗传改良中合适受体动物、最佳外源表达系统的选择以及其表达水平的提高提供了一定的理论依据。
【作者单位】： 扬州大学动物科学与技术学院;
【关键词】： 牛 TRAF基因 密码子偏好性
【基金】：江苏省高校自然科学基金资助项目(13KJB230001)
【分类号】：S823.2
【正文快照】： 肿瘤坏死因子受体6(TRAF6)属于TRAFs家族基因,是肿瘤坏死因子超家族(TNF)、Toll样受体家族(TLRs)和白细胞介素1受体超家族(TIR)信号通路调控途径中关键接头分子[1]。相关研究发现,模式生物小鼠及人的TRAF6基因可调节不同的信号传导途径,其中包括免疫和炎症相关通路,因此在免疫

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本文编号：846271