我国部分地区PRRS分子流行病学及病毒遗传变异研究

发布时间：2017-09-16 15:06

  本文关键词：我国部分地区PRRS分子流行病学及病毒遗传变异研究

  更多相关文章： 猪繁殖与呼吸综合征 分子流行病学 JL580 基因重组

【摘要】：猪繁殖与呼吸综合征(porcine reproductive and respiratory syndrome,PRRS)是一种广泛流行且严重影响养猪业健康发展的猪的繁殖与呼吸障碍性传染病。猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRS virus,PRRSV)是单股、正链RNA病毒。在自然界和免疫压力下,PRRSV不断变异,不断出现新的病毒株,给PRRS的防治带来了巨大的挑战和严峻的考验。为了解2013~2014年我国PRRS分子流行病学及病毒遗传变异情况,本研究对我国部分地区(以东北地区为主)401份样品进行了RT-PCR检测,并对51份阳性样品的GP5和部分NSP2基因进行了遗传进化及序列比对分析。结果表明:所检测的样品中PRRSV阳性率为20.2%,GP5和NSP2遗传进化分析表明51个病毒株均为北美洲型毒株,且以HP-PRRSV为主,经典株与变异株共存。其中JL580毒株的GP5和NSP2不同于国内的经典和高致病性毒株,与美国NADC30毒株属于同一个新的亚群。GP5氨基酸序列分析表明,大多数毒株在氨基酸高变区、中和抗原表位和诱导表位发生了一定的变异。NSP2部分氨基酸序列分析表明,与CH-1a相比大多数PRRS病毒株的NSP2在基因高变区缺失30个氨基酸,1株缺失34个氨基酸,1株缺失20个氨基酸。GP5和NSP2遗传进化及氨基酸序列分析结果表明我国PRRSV表现为更为复杂的遗传多样性。鉴于JL580株的特殊性,本研究对该病毒进行了全基因组序列的测定与分析。结果表明:JL580株是一个自然重组毒株,由美国NADC30毒株与国内高致病性毒株重组而成,且不同于中国现流行的其它毒株,属于一个新的亚群。同源性分析表明,JL580与中国经典毒株CH-1a的核苷酸同源性是84.9%,与HP-PRRSV代表株JXA1、HuN4、TJ的核苷酸同源性分别是84.8%、84.9%、85%。对基因组的进一步分析表明,JL580病毒株GP5蛋白与CH-1a、VR-2332、HuN4相比,信号肽和跨膜区的氨基酸发生了显著变异,且NSP2存在3处共131个氨基酸的缺失,与HP-PRRSV的30个氨基酸的缺失有明显的不同。仔猪致病性分析表明JL580毒株对仔猪具有较高的致病性。我们的研究表明NADC30类毒株已经在我国部分省份出现,这给当前的预防和治疗措施带来了一定的难度。因此我们有必要更新监测数据和疫苗策略,以防止疾病的继续蔓延。本研究将为PRRS流行病学调查研究提供必要的实验数据,为制定切实有效的预防和治疗措施提供科学依据。
【关键词】：猪繁殖与呼吸综合征 分子流行病学 JL580 基因重组
【学位授予单位】：吉林农业大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2016
【分类号】：S852.65
【目录】：

• 摘要3-4
• Abstract4-8
• 前言8-9
• 第一篇 文献综述9-16
• 第一章 猪繁殖与呼吸综合征概述9-16
• 1.1 病原及病毒特性9-10
• 1.2 基因组结构特征10
• 1.3 主要的结构蛋白和非结构蛋白10-12
• 1.4 生态学特征12
• 1.5 PRRSV致病机理12-13
• 1.6 临床症状及病理组织变化13
• 1.7 PRRSV遗传变异13-14
• 1.8 PRRSV疫苗研发的科学制约14-15
• 1.9 预防和治疗15-16
• 第二篇 研究内容16-46
• 第一章 我国部分地区PRRS流行病学16-31
• 1.1 材料和方法16-21
• 1.2 结果21-29
• 1.3 讨论29-30
• 1.4 小结30-31
• 第二章 特异性毒株JL580的分离鉴定、遗传变异及致病性分析31-46
• 2.1 材料和方法31-35
• 2.2 结果35-44
• 2.3 讨论44
• 2.4 小结44-46
• 结论46-47
• 参考文献47-53
• 附录53-54
• 作者简介54-55
• 致谢55

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本文编号：863761