蛋鸡蛋品质性状候选基因的DNA分子标记研究

发布时间：2017-09-30 00:00

  本文关键词：蛋鸡蛋品质性状候选基因的DNA分子标记研究

  更多相关文章： 蛋鸡 候选基因 多态性 蛋品质性状

【摘要】：目的:蛋品质性状是重要的生产性状,如何提高蛋品质性状已成为当前重要的研究热点。本研究在DNA分子水平上寻找与蛋品质性状密切相关的分子标记,找到调控蛋品质性状的优势基因型,在此研究基础上,进一步在商品代中验证。方法:本研究采用PCR-SSCP技术,检测海兰褐蛋鸡蛋品质性状相关的基因(TRPV6、Cabp-D28k、CA、OC116、OCX32、OCX36和OVA)的单核苷酸多态性,对其遗传结构和多样性进行了分析,并将检测到的SNP位点与所选群体进行了关联分析,以检测七个基因的SNP位点对蛋品质性状的遗传效应,初步找到调控蛋品质性状的有利基因型,并进一步在商品代中验证,鉴定优势基因型。结果:(1)采用PCR-SSCP方法对蛋鸡进行TRPV6、Cabp-D28k、CA、OC116、OCX32、OCX36和OVA多态性分析,在TRPV6第14外显子、Cabp-D28k第3外显子、CA第5内含子、OC116第1、5外显子、第2内含子,OCX32第2、4、6外显子,OCX36第3、4、5、6、7外显子,第4、7、8、12内含子,OVA第4内含子、第5外显子上发现了多态性位点。(2)钙离子转运基因多态位点与蛋品质性状进行关联分析得到,TRPV6第14外显子G27314A突变位点AA型的蛋黄颜色与AG和GG型相比差异极显著(P0.01);Cabp-D28k第3外显子A5115G突变位点AG型的蛋壳强度极显著高于AA和GG型(P0.01);CA第5内含子G14306A突变位点AA型的蛋黄颜色较AG型差异极显著;(3)基质蛋白基因多态位点与蛋品质性状进行关联分析得到,OC116第1外显子G132G和G208A突变位点形成的AA型的蛋壳厚度、蛋壳强度与AB和AC型比较差异极显著(P0.01);第5外显子G2456G和G2512G突变位点形成的AA型蛋壳强度极显著高于AB和BB型(P0.01);OCX32第2外显子G4259T和G4276C突变位点形成的各基因型之间蛋壳强度差异极显著(P0.01);第4外显子G6049G和G6051A突变位点形成的BD型蛋重极显著高于其他基因型(P0.01);第6外显子G7018A和G7116G突变位点形成的各基因型之间蛋黄重比较差异极显著(P0.01);OCX36第3外显子G992A和G1075T突变位点形成的AA型的蛋壳厚度极显著高于AB、BB型(P0.01);第4外显子G1267C和G1276C突变位点形成的各基因型的哈氏单位相比差异极显著(P0.01);第5外显子G2472A突变位点形成的各基因型之间蛋重、蛋白重、蛋黄重、蛋壳重比较分析,结果差异均为极显著(P0.01);第6外显子G2843A和G2893G突变位点形成的BB型的蛋黄颜色极显著高于其他三种基因型(P0.01);第7外显子G3287G和G3339G形成突变位点的AA型哈氏单位、蛋白高度与其他基因型相比差异极显著(P0.01);第12内含子G5118C突变位点CC型哈氏单位、蛋白高度和其它基因型比较均差异极显著(P0.01);OVA第5外显子G4296C和G4323AA形成的AA型的哈氏单位、蛋白高度与BC和BB型比较,差异达到极显著(P0.01)。(4)CABP-D28K和OCX32基因标记辅助选择效应分析得到,海兰褐父母代CABP-D28K AA型公鸡个体具有较好的遗传加性效应;OCX32 AA型公鸡个体遗传效应值可以稳定遗传。结论:TRPV6、Cabp-D28k、CA、OC-116、OCX32、OCX-36、OVA七个基因均找到有望作为调控蛋品质性状的分子标记。在商品代中进一步验证了父母代CABP-D28K AG型公鸡个体遗传效应和OCX32 AA型公鸡个体遗传效应。为今后利用分子标记辅助选择技术来进一步提高蛋鸡蛋品质性状提供参考依据。
【关键词】：蛋鸡 候选基因 多态性 蛋品质性状
【学位授予单位】：石河子大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2016
【分类号】：S831
【目录】：

• 摘要6-8
• Abstract8-13
• 缩略词表13-14
• 引言14-15
• 第一章 文献综述15-26
• 1 蛋壳的构成及形成过程15-16
• 2 蛋壳钙化有关的钙转运通路及基质蛋白16-21
• 2.1 蛋壳钙化有关的钙转运通路蛋白17-19
• 2.2 基质蛋白19-21
• 3 蛋鸡蛋品质性状的研究21-22
• 3.1 蛋壳强度、厚度和百分比21
• 3.2 蛋壳颜色21
• 3.3 蛋重及其内容物21-22
• 4 SNP检测的主要研究方法22-25
• 4.1 聚合酶链反应-限制性片段长度多态性（PCR-RLFP)23
• 4.2 聚合酶链反应-单链构象多态性分析(PCR-SSCP)23
• 4.3 序列特异性引物PCR (SSP-PCR)23-24
• 4.4 微卫星标记24
• 4.5 基因芯片法24
• 4.6 随机扩增多态性DNA技术(RAPD)24-25
• 5 研究目的和意义25-26
• 第二章 蛋鸡父母代、子代的蛋品质性状测定26-32
• 1 材料与方法26-27
• 1.1 实验材料26-27
• 1.2 蛋品质性状测定27
• 1.3 数据处理与分析27
• 2 结果与分析27-30
• 2.1 父母代、子代蛋品质性状比较27-28
• 2.2 父母代和子代部分蛋品质性状的变化趋势分析28-30
• 3 讨论30-32
• 3.1 蛋品质性状30
• 3.2 父母代和子代蛋壳强度等性状的变化趋势分析30-32
• 第三章 蛋品质性状部分候选基因多态性检测32-84
• 1 材料与方法32-44
• 1.1 实验材料32-40
• 1.2 主要的实验方法与步骤40-43
• 1.3 数据处理及分析43-44
• 2 结果与分析44-81
• 2.1 基因组DNA提取及检测44-45
• 2.2 基因外显子区PCR产物扩增片段的检测45-58
• 2.3 TRPV6基因多态性的检测58-59
• 2.4 CaBP-D28k基因多态性的检测59-61
• 2.5 CA基因多态性的检测61-62
• 2.6 OC116基因多态性的检测62-66
• 2.7 OCX32基因多态性的检测66-70
• 2.8 OCX36基因多态性的检测70-79
• 2.9 OVA基因多态性的检测79-81
• 3 讨论81-84
• 3.1 关于SSCP分析81
• 3.2 钙转运通路相关候选基因多态性分析81-82
• 3.3 基质蛋白候选基因的多态性分析82-84
• 第四章 候选基因多态性与蛋鸡蛋品质性状的关联分析84-100
• 1 材料与方法84-85
• 1.1 实验材料84
• 1.2 实验方法84
• 1.3 数据处理与统计分析84-85
• 2 结果与分析85-97
• 2.1 TRPV6多态性与蛋品质性状的关联分析85
• 2.2 CABP-D28K多态性与蛋品质性状的关联分析85-86
• 2.3 CA多态性与蛋品质性状的关联分析86-87
• 2.4 OC116多态性与蛋品质性状的关联分析87-89
• 2.5 OCX32多态性与蛋品质性状的关联分析89-91
• 2.6 OCX36多态性与蛋品质性状的关联分析91-96
• 2.7 OVA多态性与蛋品质性状的关联分析96-97
• 3 讨论97-100
• 3.1 钙转运通路相关候选基因多态性与蛋品质性状关联分析97-98
• 3.2 基质蛋白候选基因的多态性与蛋品质性状关联分析98-100
• 第五章 CABP-D28K和OCX32基因标记辅助选择效应分析100-105
• 1 材料与方法100
• 1.1 实验材料100
• 1.2 实验方法100
• 1.3 数据处理与统计分析100
• 2 结果与分析100-102
• 3 讨论102-103
• 3.1 CABP-D28K标记辅助选择效应分析102-103
• 3.2 OCX32标记辅助选择效应分析103
• 4 结论103-105
• 全文总结105-106
• 创新点106-107
• 参考文献107-117
• 致谢117-118
• 作者简介118-119
• 附件119

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本文编号：944944