贵州省猪流行性腹泻病毒ORF3、M基因克隆及序列分析

发布时间：2017-10-06 00:14

  本文关键词：贵州省猪流行性腹泻病毒ORF3、M基因克隆及序列分析

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【摘要】：为了解贵州省猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)毒株ORF3及M基因的遗传变异情况,试验于2014年4月-2015年3月从贵州省5个地区采集105份腹泻仔猪的粪便,应用RT-PCR方法进行PEDV检测,从中选择8份PEDV阳性样本,扩增其ORF3及M基因,测序并进行序列比对分析。结果显示,从采集的105份粪便样本中可检出75份PEDV阳性样本,阳性率为71.43%;8株PEDV贵州株ORF3及M基因序列均无碱基缺失或插入;ORF3基因核苷酸及推导的氨基酸同源性在95.1%~100.0%与95.1%~99.6%之间,M基因核苷酸及推导的氨基酸同源性在98.4%~100.0%与98.7%~100.0%之间;氨基酸系统进化树分析结果显示,2014~2015年贵州流行株与近年来中国毒株、韩国毒株及泰国毒株亲缘关系较近,与疫苗株Attenuated DR13及CV777株亲缘关系较远。提示目前贵州省仔猪腹泻病原主要是PEDV,且为PEDV强毒株。
【作者单位】： 贵州大学动物科学学院;贵州省生猪质量安全工程技术研究中心;贵州省动物疫病预防控制中心;贵州都匀市黔昌畜牧发展有限责任公司;花溪区农业局;
【关键词】： 猪流行性腹泻病毒 ORF基因 M基因 克隆 序列分析
【基金】：贵州省生猪质量安全工程技术研究中心建设项目“生猪健康养殖实验室建设与技术研发”(黔科合农C字[2011]4022号) 贵州省科学技术厅农业攻关项目“贵州省仔猪腹泻性疫病风险分析及综合防控技术研究”(黔科合NY[2015]3009-1号);“贵州省动物疫病防控与兽医公共卫生保障科技创新人才团队”(黔科合人才团队[2015]4016号) 贵州省动物疫病与兽医公共卫生重点实验室培育(黔科合计Z字[2011]4008号) 贵州省农业委员会科技计划项“贵州省2015年重大动物疫病省级定点监测”(2015-01号)
【分类号】：S852.651
【正文快照】： 猪流行性腹泻(porcine epidemic diarrhea,PED)是由尼多病毒目(Nidovirales)、冠状病毒科(Coronaviridae)的猪流行性腹泻病毒(porcine epi-demic diarrhea virus,PEDV)引起的猪肠道传染病,特征为腹泻、呕吐、脱水及仔猪的高致死率。PEDV全长28 033bp,有7个开放阅读框(ORF)[1],

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本文编号：979629