羟酰-CoA脱氢酶HADH和非受体酪氨酸激酶SRC在卵巢癌中的表达及意义

发布时间：2020-03-20 05:33

【摘要】：背景及目的我国癌症统计数据表明,近年来国内卵巢癌的发病和死亡均居女性恶性肿瘤前十位。卵巢癌的死亡率逐年增高,这与其在早期临床症状不明显有关。目前关于卵巢癌的研究重点是如何早期发现和诊断,而生物标志物是预测疾病风险和进展的关键一环,可以提高卵巢癌的诊断精度,利于早期诊断。故而本文首先通过基因芯片研究筛选到了与卵巢癌有相关性的关键基因羟酰-CoA脱氢酶HADH和非受体酪氨酸激酶SRC,然后通过组织学实验检测这两个基因在卵巢癌患者肿瘤组织和相应正常组织之间的差异,分析其表达含量和卵巢癌预后之间的关系,探讨其作为卵巢癌预后和治疗的分子标志物的可能。方法利用生物信息学方法确定差异基因。从GEO(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo)数据库下载并整理卵巢癌基因芯片数据。通过对差异表达基因进行数据分析,获得差异基因。进行基因本体论(Gene Ontology)分析和信号通路分析(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)。最后利用Cytoscape对所有差异基因的编码蛋白构建蛋白相互作用网络(PPI)。收集2013年6月至2015年6月青州市人民医院妇科72例卵巢癌患者的肿瘤组织和相对应的正常组织(距肿瘤边缘=5cm)。使用Real-time PCR法检测卵巢癌患者肿瘤组织与对应正常组织中HADH和SRC的表达含量,结合患者的临床信息,以SPSS19.0分析它们表达含量与卵巢癌患者临床病理特征之间的关系。使用ROC曲线法,评价HADH和SRC的诊断价值,明确其针对卵巢癌患者的诊断临界点,并探讨用ROC曲线法确定可疑值范围。通过随访(截止时间为2017.12.31),分析HADH和SRC表达水平与患者生存预后之间的关系。结果经过筛选与整理,将卵巢癌基因芯片GSE105437数据纳入研究。筛选差异基因的限定条件为:p≤0.05,logFC≥2。卵巢癌基因芯片中共筛选出差异基因196个,其中上调基因149个,下调基因47个。生物信息学分析在这些差异基因中进行。对所有差异基因进行基因本体论富集分析,结果显示差异基因富集B细胞增殖调节、细胞生长因子调节、化学致癌作用等因素与卵巢癌的发病相关。对这些差异基因功能的关系构建网络。用Cytoscape分析差异基因蛋白之间的作用网络,得分前五位的基因有ALDH6A1、HADH、FYN、SRC和TNF,这些基因是可能与卵巢癌高度相关的关键基因。HADH和SRC分别在卵巢癌肿瘤组织中的表达明显高于相应的正常组织,其表达量的差异性具有统计学意义(P0.01)。HADH和SRC均与患者的年龄、肿瘤大小、病理类型无明显关系(P0.05),而与患者淋巴结转移情况和TNM分期等有相关性(P0.05)。PFS曲线分析显示:与相应的低表达组相比,HADH和SRC高表达组的3年无进展生存率明显下降,具有统计学意义(P0.05)。HADH和SRC的ROC曲线下面积分别为0.753和0.841,并有统计学意义(P0.05),说明这两个基因可能有较高的诊断价值。结论HADH和SRC在卵巢癌肿瘤组织中的表达高于相应正常组织;HADH和SRC高表达的卵巢癌往往分期晚,且预后不良;HADH和SRC与卵巢癌的发生发展存在相关性,有可能成为卵巢癌早期诊断和治疗的分子标志物。
【图文】：

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【学位授予单位】：青岛大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2018
【分类号】：R737.31

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