高龄合并妊娠期糖尿病孕妇肠道菌群的分布特点研究
【学位授予单位】:南方医科大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2019
【分类号】:R714.256
【图文】:
并间接反映所检测样本中物种的丰富程度,当曲线趋向平坦时,提逡逑示更多的数据量只会产生少量新的物种,测序数据量渐进合理。以组为单位绘逡逑制Chaol邋(图1-1)和Observed邋OTUs邋(图1-2)两种曲线,序列数目2000左右逡逑出现拐点,X椉硬庑蛏疃龋咔饔谄交海锏狡教ㄆ冢毙蛄惺铮保矗埃埃疤蹂义鲜本锏阶畲蟛庑蛏疃取F教ㄆ诘某鱿痔崾炯绦黾有蛄惺仓荒芊⑾稚倭烤义先骸K得髁阶檠静庑蛏疃瘸浞帧⒑侠恚哺蔷蠖嗍镂镏郑觳庋峰义衔镏址岣怀潭茸阋月愫笮难绣常绦黾硬庑蚴浚桓谋淠壳凹觳饨峁e义稀鲥澹牵模湾义希咤澹睿铮睿牵模湾义希保担埃板澹义希靛义希义希渝澹保埃埃板危卞錘逡逑00邋2000逦4000逦6000逦8000逦10000逦12000逦14000逡逑Sequences邋Per邋Sample逡逑图1-1邋Chaol稀释曲线逡逑Figurel-1邋Chaol邋rarefaction邋measure逡逑13逡逑
87个科,230个属。发现GDM组与non-GDM在门水平的菌群组成逡逑差异不大,门水平相对丰度排在前三位均为:厚壁菌门、拟杆菌门、变形菌门,逡逑它们构成超过95%邋(95.4%邋vs97.2%)的序列(表1-6、图1-3)。厚壁菌门、拟杆逡逑菌门、变形菌门,它们构成超过95%邋(95.4%邋vs97.2%)的序列。但相当于逡逑non-GDM,邋GDM组中厚壁菌门比例更低(50.4%邋vs邋60.6%),拟杆菌门(36.1%逡逑vs邋32.3%)、变形菌门(8.9%邋vs邋4.3%)比例更高。逡逑表1-6邋GDM组与non-GDM组菌群门水平相对丰度组成情况逡逑Table邋\-6邋Relative邋abundance邋of邋main邋bacterial邋taxon邋on邋phylum邋level逡逑GDM%邋non-GDM%逡逑Firmicutes逦50.4逦60.6逡逑Bacteroidetes逦36.1逦32.3逡逑Proteobacteria逦8.9逦4.3逡逑Actinobac邋teria逦1.4逦1.1逡逑Verrucomicrobia逦1.4逦1.1逡逑others逦1.8逦0.6逡逑14逡逑
f3逦?.?■0??.>??0■.■§xjam>y?mi.>??i.O?m?'.*?>**ii?i.>io?jj逡逑图1-4邋GDM与non-GDM组菌群属水平堆积图展示逡逑Figure邋1-4邋Stacked邋bar邋of邋bacteria邋on邋genus邋level逡逑3.2.3邋GDM组与non-GDM肠道菌群a多样性分析逡逑a多样性主要反映样本的物种多样性,所用指标包括Chaol指数、observed逡逑species、Shannon指数和PD指数等。由于a多样性分析所得数据并不满足正逡逑态分布,因而采用K个相关样品秩和检验(Friedman秩和检验)。逡逑其中Chaol指数是根据Chaol算法来估计样本中所含OTU数目
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