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AGT、MTHFR和VEGF基因多态性与新疆汉族和维吾尔族妊娠妇女子痫前期发病风险的相关性研究

发布时间:2020-09-03 12:45
   子痫前期(Preeclampsia,PE)是孕妇妊娠20周以后发生的伴有高血压、高蛋白尿以及其他器官功能受损的一种妊娠期综合症,是母胎疾病中导致母胎结局不良(致死、流产、胎膜早破等)的重要疾病;因此,PE的早期诊断和预防具有重大意义。目前对于子痫前期的临床诊断主要是根据子痫前期发病的高危因素、血清sFlt/PIGF值和临床表现等综合预测。大量研究结果表明子痫前期是多因素、多基因作用下的一种异质性疾病,随着人类基因组与疾病关联性研究的发现和发展,发现易感基因及基因多态性和子痫前期存在关联,因此,试图从基因水平寻找子痫前期风险相关分子标志物已经成为热点,旨在为子痫前期的早期诊断和预防提供参考。子痫前期受地域、民族、生活习惯的影响,不同地区、不同民族易感基因及多态位点与子痫前期相关性不同,易感基因多态性和子痫前期相关性的研究在中国新疆地区仍是空白,本研究选择新疆地区PE患者和健康对照480名,采用病例对照研究易感基因多态性与子痫前期相关性。通过病例对照研究,对新疆地区汉族、维吾尔族分别进行AGT、MTHFR、VEGF基因26个多态性位点与子痫前期关联分析;在汉族中:rs2274976(T/C)和rs3025035(T/C)位点的多态等位基因T和多态基因型TT/TC频率病例组显著高于对照组,rs2274976多态基因型在共显性、显性和超显性模型下可能增加子痫前期患病风险,rs3025035在超显性模型下显著差异;维族中,rs3737966(C/T)位点多态等位基因C和多态基因型CC/CT频率病例组显著高于对照组,多态基因型在显性和超显性模型下可能增加子痫前期风险,rs2274976位点的多态等位基因T和多态基因型CT可能增加PE的风险,多因素校正后仍具有差异,rs3025039(T/C)位点多态等位基因T和多态基因型TT/TC频率对照组显著高于病例组,但多因素校正下各个模型均无显著差异。为了研究多位点之间的交互作用和子痫前期的关系,构建单体型图谱发现,AGT各个位点在汉维两族均不存在连锁不平衡;维族中,MTHFR的rs4846048和rs3737966的单体型AT在病例组中的频率显著高于健康组,可能增加子痫前期风险;VEGF的rs2010963、rs3024987、rs2146323、rs3025006、rs3025020和30225021中单体型CCCTCT和GCACCC在病例组中的频率显著高于对照组,可能增加子痫前期前期风险。本研究丰富了易感基因和PE关系的研究数据,并且差异位点可能是PE的风险因子,可为PE的早期风险预测提供一定的理论指导。
【学位单位】:西北大学
【学位级别】:硕士
【学位年份】:2019
【中图分类】:R714.244
【部分图文】:

示意图,原理,示意图,荧光基团


3.5 小时后即可实现不同颜色荧光标记的可部分。 Taqman 探针荧光 PCR 原理是在 PCR 反应系统中加是 FAM 和 VIC 两种荧光素)标记的探针,它们可分别结合配对。正常情况下,由于探针 5′端荧光基团和 3淬灭。随着 PCR 的有效进行,与模板完全配对的探针切酶活性切割,致使探针 5′端上的荧光基团与 3′端的淬告荧光基团被激活,系统收集该荧光信号;而与模板不等位基因)不能被有效切割,发挥淬灭效应,故检测的变化即可实现 SNP 位点检测。原理图如图 1所示。

设计原理,芯片


图 2 26(Assays)×96(Sample)Openarray 芯片及设计原理图Fig 2 26(Assays)×96(Sample)Openarray chip and design schematic2.3.4 12K Flex Real Time PCR Taqman 探针法进行基因分型2.3.4.1导入文件的准备在 OpenArray Sample Tracker Software 中对 480 例样本按照编号进行编辑和确认样本顺序无误后,在 Sample Mapping 中以 Excel 格式导出实验样本在 96 384 孔板中对应位置表,用于前期人工的样本转移操作。导出 csv 文件“3plate”,用于后续反应体系到芯片的 loading,同时,导出 96-OpenArray plate.csv 直接在 QuantstudioTM12K Flex Software 上导入样本编号;在 Thermo Fisher 官网次实验研究定制的所有芯片的信息,文件格式均为“.spf”,用于芯片信息的载入。2.3.4.2反应体系的制备实验开始之前,用空气加湿器将实验房间内的空气湿度调至 40%左右,防

示意图,内部平面,示意图,仪器舱


der 上取下;(3)关上仪器舱门,仪器仪按照提示导入“384-well plate.csv”和“.spf”文件;器上卡紧,放好后,轻轻撕掉封封膜;(5)带有印记标签的放在左边;(6)将匹配的枪头态和仪器舱内枪头盒中的枪头匹配,灰色区域(7)将所有步骤都检查 遍,保证符合所有操)2min 完成 张芯片的 loading,loaing 完成后系的过度蒸发,在油封板过程中,缓慢推注射冲出,导致封板失败;(9)垂直手持芯片,用旋转直至塞子手柄自动脱落:(10)用喷有酒精毕后,将封好的 OpenArray芯片板放入 QuantSAccuFill 自动加样仪如图 3所示。

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