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病毒性肝炎基因芯片诊断技术研究和临床应用

发布时间:2021-02-07 20:52
  基因芯片,又称微型DNA阵列(microarry),是按特定的排列方式,将大量基因探针/基因片段固定在硅片、玻片和塑料片上,通过计算机处理,高效、大规模获取相关生物信息。目前,该技术已用于基因表达谱分析、新基因发现、基因突变、基因多态性分析、药物筛选和基因测序及疾病的诊断。 中国是肝炎大国,有近1.2亿乙肝病毒携带者,1500万丙型肝炎患者。目前,对于肝炎病毒的检测,主要是通过测定抗原、抗体(病毒蛋白质)来完成,在诊断上存在免疫滞后性。对肝炎病毒基因亚型分型和基因突变检测,多用核苷酸测序的方法,该方法试剂昂贵,操作复杂。 我们将基因芯片技术应用到肝炎病毒的诊断上,通过生物医学数据库(美国生物技术信息中心NCBI)对乙型和丙型肝炎病毒基因进行检索和筛选,应用分子生物学软件,进行序列分析、引物及探针设计,制成病毒性肝炎基因诊断芯片,并在临床实践中应用,可快速、敏感、经济地完成对病人血清及肝组织中肝炎病毒DNA、RNA的基因诊断、亚型分型和基因突变检测。目前已完成以下工作,并得出主要研究结论如下: 1.本科研通过生物信息方法从基因库中筛选出代表乙型、丙型病毒性肝炎的基因特征... 

【文章来源】:南京农业大学江苏省 211工程院校 教育部直属院校

【文章页数】:129 页

【学位级别】:博士

【部分图文】:

病毒性肝炎基因芯片诊断技术研究和临床应用


BLAST界面图

序列,查询界面,突变型,亚型


heDi铭nostieTeehniqueandCliniealApplieationofGeneehipofHepatitiSvirus·芯片制作对野生型序列以及突变型序列做多重序列比较,找出各序列相同的区域,即高度保守区。区域内设计引物,可以成功地扩增出各亚型和突变型的序列。另外,找出各亚型或各突变同的区域设计探针,就可以检测出待测序列属于何种亚型或突变型。

序列,多重序列,比较结果,区域设计


多重序列比较结果

【参考文献】:
期刊论文
[1]80例乙型、丙型病毒性肝炎血清、组织基因芯片检测分析[J]. 赵伟,刘伟,刘新钰,周镇先,张林,罗婵.  临床肝胆病杂志. 2002(01)
[2]慢乙肝患者血清及肝组织HBVDNA表达及基因芯片检测研究[J]. 赵伟,刘伟,张林,周镇先,刘新钰,刘全俊.  山东医药. 2002(01)
[3]基因芯片技术诊断乙型病毒性肝炎的初步研究[J]. 赵伟,刘伟,刘新钰,周镇先,张林.  江苏医药. 2001(06)
[4]基因表达谱芯片在胰腺癌相关基因筛选中的应用研究[J]. 金钢,胡先贵,应康,李瑶,唐榕,唐岩,景在平,谢毅,毛裕民.  第二军医大学学报. 2000(09)
[5]几种新型生物芯片的研究进展[J]. 徐炳森,邵健忠,mail.hz.zj.cn.  生物化学与生物物理进展. 2000(03)
[6]微芯片——生命科学领域的新工具[J]. 陈亚利,陆祖宏.  生物化学与生物物理进展. 1998(06)
[7]生物芯片的研究、发展和应用[J]. 陆祖宏.  电子科技导报. 1998(11)
[8]生物芯片的原理和制作方法[J]. 甘霖,陈亚利,陆祖宏.  传感技术学报. 1998(02)
[9]乙型肝炎病毒前S/S基因变异及临床意义[J]. 王国棠,田庚善.  中华内科杂志. 1994(04)



本文编号:3022810

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