雌激素代谢相关基因位点及其单倍型与中国汉族女性初潮年龄的群体关联分析

发布时间：2017-04-24 12:03

  本文关键词：雌激素代谢相关基因位点及其单倍型与中国汉族女性初潮年龄的群体关联分析，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：【目的】 通过对欧美人群中多次证实与初潮年龄相关的雌激素合成与代谢相关的基因如细胞色素P450家族19A1（cytochrome P450, family19, subfamily A, polypeptide1，CYP19A1），雌激素受体1（estrogen receptor1，ESR1）,雌激素受体2（estrogenreceptor2，ESR2）及孕酮受体（progesterone receptor，PGR）共4个基因及其多态性位点的基因分型，了解上海及其周边地区无亲缘关系的汉族女性初潮年龄的频率分布及其初潮年龄早晚的变异关系。 【资料与方法】 通过对2011年12月至2012年5月来我院体检上海及其周边地区2000多例健康成年女性面对面问卷形式搜集基本信息资料，包括年龄、民族、身高、体重、既往病史等，对所有研究对象记录其初潮年龄、生育、哺乳、避孕药的应用等，并提取外周血基因组DNA。利用国际人类基因组计划数据库（Hapmap），设定连锁不平衡系数r20.8，最小等位基因频率(MAF)0.05，选取CYP19A1、ESR1、ESR2、PGR共4个基因的24个SNP位点（rs12148604、rs2255192、rs4646、rs2470144、rs6493496、rs2470176、rs700519、rs28757184、rs8029807、rs1062577、rs3798577、rs9340799、rs2234693、rs2228480、rs3778082、rs3798758、rs928554、rs1255998、 rs8018687、rs4986938、rs1256049、rs484389、rs518162、rs1042838），使用SNP scan分型技术鉴定1791例标本的24个SNP分型。并对全部病例资料进行运用群体关联分析方法如卡方检验、逐步回归分析、线性回归分析、ANOVA法等方法分析该4个基因及其多态性位点与女性初潮年龄的关系，并通过PLINK分析软件计算各位点间的连锁不平衡关系及其单倍型块与初潮年龄早晚差异的关系。 【结果】 本研究人群中，除rs1062577和rs3798758外，其余22个等位基因和基因型分布符合Hardy-Weinberg定律。采用单因素方差（ANOVA）分析：rs6493496与初潮年龄早晚的差异P值接近0.05（p=0.056），可能是初潮年龄变异的易感位点，rs3798577可见年龄分层（P=0.042），rs518162可见身高分层（P=0.047）；而线性回归分析显示：rs6493496与初潮年龄早晚的差异有统计学意义（p=0.01038），其余23个等位基因型和单倍型分析未发现与初潮年龄早晚变异间存在相关性。 【结论】 1.本研究首次分析了CYP19A1、ESR1、ESR2、PGR这四个基因SNPs及其单倍型与上海及其周边地区无亲缘关系的女性初潮年龄早晚变异的关系； 2.本研究发现CYP19A1基因的rs6493496位点可能是该地区女性初潮年龄早晚变异的易感位点，其余的基因位点及其单倍型可能不是该地区女性初潮年龄变异的易感位点。
【关键词】：初潮年龄 中国汉族女性 雌激素代谢相关基因 单核苷酸多态性 单倍型块
【学位授予单位】：苏州大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2013
【分类号】：R394.3
【目录】：

• 中文摘要4-6
• Abstract6-9
• 前言9-15
• 第一部分 资料和方法15-23
• 1. 研究对象15
• 2. DNA 的抽提15-17
• 3. 技术路线17
• 4. 基因型检测17-22
• 5. 统计学处理22-23
• 第二部分 结果23-36
• 1. 研究对象的人口学特征23
• 2. 不同基因型女性初潮年龄早晚的单因素方差分析23-28
• 3. 各基因型与初潮年龄早晚的线性回归分析28-30
• 4. 连锁不平衡（LD）和单倍分型的计算30-35
• 5. 各基因单倍型与初潮年龄的相关分析35-36
• 第三部分 讨论36-41
• 1. CYP19A1 基因的多态位点与初潮年龄的关系36-37
• 2. ESR1 基因的多态位点与初潮年龄的关系37
• 3. ESR2 基因的多态位点与初潮年龄的关系37-38
• 4. PGR 基因的多态位点与初潮年龄的关系38-41
• 第四部分 结论41-42
• 第五部分 参考文献42-45
• 综述45-56
• 参考文献53-56
• 致谢56-57
• 缩略词表57-58
• 攻读学位期间本人发表的论文58-59
• 附录 妇科体检调查表59-60

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本文编号：324148