一株新正黏病毒(龙川病毒)的鉴定及分子特征研究

发布时间：2021-10-13 01:25

　　2013年在广东省开展了虫媒病毒分布及其分子特征的研究,在广东省龙川县采集的致倦库蚊中分离到一株病毒,该病毒可以引起C6/36细胞的病理性效应。为了对该病毒进行鉴定,并对其分子特征进行研究,将病毒培养物用氯化铯进行梯度离心,负染电镜观察病毒的形态,提取并单引物等温扩增（SPIA）病毒RNA,利用IonTorrent平台进行深度测序,获得的序列用CLCGenomic Wokbench9.0软件进行拼接,本地BLAST进行分类比对。用MEGA软件登录GenBank,下载正黏病毒科代表株序列并绘制进化树,同时用ClustalW2软件与新毒株进行氨基酸同源性比对和编码框序列的分析。电镜观察结果显示该病毒呈球形,直径大小约100nm;深度测序共获得6个完整开放阅读框（open reading fragment,ORF）的节段序列,5个节段（PB1、PB2、PA、NA、HA）的氨基酸序列与正黏病毒科的Quaranjavirus属病毒同源关系在26.38%～67.23%之间,其中PB1的同源性最高,PB2的同源性最低,未发现与其它病毒有同源关系。本研究在中国首次从蚊虫中分离并鉴定了一株新的虫媒病毒,... 

【文章来源】：新发与再发传染病研究论坛论文集广东省预防医学会医学病毒学专业委员会会议论文集

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本文编号：3433689