4株霍乱弧菌非产毒株溶源性噬菌体pre-CTXΦ的基因组结构分析

发布时间：2021-11-07 00:47

　　霍乱弧菌溶源性噬菌体CTXΦ携带霍乱毒素基因ctxAB,通过其结构基因gⅢ编码产生的PⅢ蛋白识别霍乱弧菌毒素共调菌毛（toxin co-regulated pilus, TCP）的主要结构亚单位TcpA,从而感染具有TCP的霍乱弧菌,使之成为产毒菌株。CTXΦ还有不携带ctxAB的前体pre-CTXΦ,根据CTXΦ基因组中调控基因rstR序列型不同,可分成不同的型别。在不同霍乱弧菌菌株的基因组中,已发现CTXΦ/pre-CTXΦ基因组及其亚型的多种组合排列方式。研究该噬菌体家族的基因组多样性,能够分析其进化及在霍乱弧菌产毒株形成中的作用。本研究发现了4株O1和O139群霍乱弧菌非产毒株具有pre-CTXΦ基因组及多样的rstR序列型,进一步对pre-CTXΦ在4株菌株中的基因组特征进行了分析。利用第3代基因测序法（短读长测序技术和单分子长读长测序技术）,获得了4株菌株的基因组序列。利用长读长测序和拼接分析,精确地获得了具有长片段重复序列结构的pre-CTXΦ基因组排列,明确了4株测序菌株中多样的pre-CTXΦ基因组排列。在非产毒株基因组菌株VC3193中发现了携带古典型pre-CTX... 

【文章来源】：微生物与感染. 2019,14(04)

【文章页数】：9 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 菌株和染色体DNA提取
    1.2 基因组框架图测定
    1.3 基因组完成图测定
    1.4 pre-CTXΦ基因组序列的获取
    1.5 tcpA和gⅢ进化树的构建及比较
2 结果
    2.1 基因组测序及与产毒流行株的进化关系
    2.2 4株非产毒菌株染色体上的pre-CTXΦ基因组结构
    2.3 非产毒株pre-CTXΦ的受体识别蛋白PⅢ及所在菌株的感染受体TcpA序列的多样性
3 讨论


【参考文献】：
期刊论文
[1]霍乱弧菌JS9803株CTXEI Torφ和nct-CTXnewO139φ基因组克隆、测序及序列分析[J]. 芮勇宇,阚飙,高守一,刘延清,祁国明.  热带医学杂志. 2006(08)
[2]O139群霍乱弧菌染色体中整合两种CTXΦ前噬菌体基因组的多样性[J]. 陈爱平,阚飙,陈拱立,陈亢川,刘延清.  中华微生物学和免疫学杂志. 2002(03)
[3]霍乱弧菌中存在不含霍乱毒素基因的噬菌体CTXΦ基因组[J]. 阚飙,祁国明,刘延清,刘彩莲,高守一.  中华微生物学和免疫学杂志. 1999(03)



本文编号：3480837