Smurf1调控PIP5K1C蛋白稳定性及相关生物学功能的研究
本文关键词:Smurf1调控PIP5K1C蛋白稳定性及相关生物学功能的研究,,由笔耕文化传播整理发布。
【摘要】:Smurfl属于HECT类的E3泛素连接酶,是NEDD4亚家族的成员,由HECT结构域、WW结构域及C2结构域组成。Smurfl参与调控多条信号途径,如BMP信号途径、Wnt信号途径以及MAPK信号途径等;该蛋白可以靶向调控多种底物,女Smads、RunX2、 RunX3、Tbx6、MEKK2、RhoA、Par6、Talin及STAT1等,从而参与调控细胞生长、成骨细胞分化、胚胎发育、细胞极性、细胞迁移及免疫反应等多种生物学功能PIP5K1C是生物体内非常重要的磷脂类激酶,能够催化PIP2的生成,并参与调控多种生物学功能,如细胞迁移、黏着斑的形成、胞吞作用等。人源的PIP5K1C有两个不同的剪切体:一个是分子量为87KD的剪切体,被命名为PIP5K1C-87;另一个是分子量为90KD的剪切体,被命名为PIP5K1C-90。PIP5K1C蛋白的生物学功能不仅受其相互作用蛋白的调控,而且还受该蛋白翻译后修饰的调控,如磷酸化、乙酰化;然而对其泛素化修饰,却鲜有报道。在本论文的研究中,我们发现PIP5K1C在肺癌组织中是异常高表达的,并证明了PIP5K1C受蛋白酶体降解途径的调控;而且我们进一步通过knockdown及过表达E3泛素连接酶的方法,找到了PIP5K1C的E3泛素连接酶Smurf1,该蛋白能够调控PIP5K1C的蛋白稳定性;而且通过体内免疫共沉淀实验、体外pull down实验,都能够检测到Smurf1与PIP5K1C的结合;我们进一步明确了Smurf1是通过增强PIP5K1C的泛素化水平,而调控PIP5K1C的蛋白稳定性的;并且我们找到了Smurf1促进PIP5K1C发生泛素化的关键性位点,即K255;而且在生物学功能上,我们证明了Smurf1能够抑制PIP5K1C介导的细胞增殖及其他相关生物学过程。进一步我们又对Smurf1降解PIP5K1C的调控机制,进行了初步的探索。综上所述,本文提出Smurf1-PIP5K1C途径在肺癌细胞中的调控作用,且Smurf1能够通过调控PIP5K1C的蛋白稳定性而影响PIP5K1C介导的生物学过程,为深入研究这两个蛋白的生物学功能,提供了一个新的思路。
【关键词】:smurf1 PIP5K1C 泛素化 降解
【学位授予单位】:华东师范大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2013
【分类号】:R363
【目录】:
- 摘要6-7
- ABSTRACT7-12
- 第一章 研究背景及文献综述12-21
- 第一节 泛素连接酶Smurf112-17
- 1. 泛素蛋白酶体途径概述12
- 2. HECT家族E3泛素连接酶12-14
- 3. 泛素连接酶Smurf114-17
- 3.1 Smurf1的发现及结构14
- 3.2 Smurf1的调控方式14-15
- 3.3 Smurf1的生物学功能15-17
- 第二节 磷脂激酶PIP5K1C17-21
- 1. 磷脂酰肌醇-4,-二磷酸(PIP2)17
- 2. I型磷脂酰肌醇4磷酸5激酶(PIP5K1)17-18
- 3. PIP5K1的调控方式18
- 4. PIP5K1C18-21
- 第二章 材料与方法21-38
- 第一节 实验材料21-27
- 1. 细胞株21
- 2. 质粒21
- 3. 主要试剂21-23
- 4. 主要抗体23
- 5. shRNA和siRNA序列23-25
- 6. 实验仪器和设备25-26
- 7. 实验耗材26-27
- 第二节 实验方法27-38
- 1. 实验所需质粒的构建27-29
- 2. 293T细胞株的体外培养、传代及铺板29-30
- 3. 细胞转染30
- 4. 蛋白质免疫印迹(Western Blot)30-31
- 5. 免疫共沉淀实验(Co-IP)31-32
- 6. Pull Down实验32
- 7. 免疫荧光技术32-33
- 8. 体内泛素化法(变性)实验33-34
- 9. 体外泛素化实验34
- 10. RT-PCR34-36
- 11. MTT比色法检测细胞增殖实验36
- 12. Pulse chase实验36-37
- 13. 流式细胞仪检测胞内Ca~(2+)含量37
- 14. 荧光素酶报告基因实验(Luciferase assay)37-38
- 第三章 结果与分析38-64
- 第一节 PIP5K1C在肺癌组织中高表达且能够促进肺癌细胞增殖38-39
- 第二节 Smurf1调控PIP5K1C的蛋白稳定性39-45
- 1. PIP5K1C蛋白水平受泛素蛋白酶体途径调控39-40
- 2. PIP5K1C的E3泛素连接酶的确定40-41
- 3. 外源Smurf1调控PIP5K1C的蛋白稳定性41-43
- 4. 内源Smurf1调控内源性PIP5K1C的蛋白稳定性43
- 5. Smurf1能够影响PIP5K1C的半衰期43-45
- 第三节 Smurf1与PIP5K1C的相互作用45-50
- 1. 外源性Smurf1与PIP5K1C相互作用45
- 2. 内源性Smurf1与PIP5K1C的相互作用45-46
- 3. Smurf1与PIP5K1C存在直接的相互作用46-47
- 4. Smurf1与PIP5K1C可以共定位47
- 5. Smurf1与PIP5K1C相互作用结构域的确定47-49
- 6. Smurf1的C2结构域对于调控PIP5K1C的蛋白稳定性的必要性49-50
- 第四节 Smurf1促使PIP5K1C发生泛素化50-53
- 1. 在体内Smurf1能够促进PIPSK1C的泛素化50
- 2. 内源Smurf1能够促进PIP5K1C的泛素化50-51
- 3. 在体外Smurf1能够促进PIP5K1C的泛素化51-53
- 第五节 Smurf1泛素化PIP5K1C位点的确定53-57
- 1. 泛素化位点的确定53-54
- 2. PIP5K1C上的K255是其被Smurf1泛素化的关键性位点54-55
- 3. PIP5K1C的K255位突变后,并不影响其与其他蛋白的结合55-57
- 第六节 Smurf1抑制P15K1C介导的细胞增殖57-58
- 第七节 Smurf1影响PIP5K1C介导的其他生物学过程58-60
- 1. Smurf1抑制PIP5K1C介导的胞内Ca~(2+)含量的增加58
- 2. Smurf1能够抑制PIP5K1C介导的β-catenin活性的增强58-60
- 第八节 Smurf1对PIP5K1C的降解的调控机制的初步探索60-64
- 1. Smurf1对PIP5K1C的降解受PKA磷酸化的调控60-61
- 2. Smurf1降解PIP5K1C受Cdh1的调控61-62
- 3. 关于Smurf1降解PIP5K1C调控机制的其他探索62-64
- 第四章 总结与讨论64-67
- 附录Ⅰ67-72
- 附录Ⅱ 科研成果72-73
- 参考文献73-78
- 致谢78
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 刘孟珉,张绍文,贺福初,陈竺;人EEN蛋白的结构预测和功能分析[J];中国生物化学与分子生物学报;1999年06期
2 周妍娇,李令媛,茹炳根;金属硫蛋白及其结构域突变体的紫外和圆二色光谱学研究[J];中国生物化学与分子生物学报;2000年04期
3 陈宏远;芮雯;马伟峰;蔡绍晖;;删除C末端结构域的基质细胞衍生因子-1重组内质网定位片段的真核表达载体构建及其活性作用[J];广西医科大学学报;2009年03期
4 孟博;李彬;;嗅素结构域基因家族在眼科领域的研究进展[J];眼科新进展;2012年08期
5 王晓文,范文红,范明;Copines蛋白家族的研究进展[J];国外医学(生理、病理科学与临床分册);2005年02期
6 刘永宾;高磊;李冬果;李霞;;共调控共互作蛋白结构域的特征研究[J];中国优生与遗传杂志;2010年03期
7 张浩;郭宁;;Erbin的分子结构及其生物学功能[J];细胞与分子免疫学杂志;2007年01期
8 罗明,肖月华,侯磊,罗小英,李德谋,裴炎;棉花LIM结构域基因(GhLIM1)的克隆和表达分析[J];遗传学报;2003年02期
9 李明才,冯作化,李东,张桂梅;三结构域重组纤连蛋白多肽在大肠杆菌中表达及其产物的纯化与鉴定[J];同济医科大学学报;1999年05期
10 秦咏梅,J.Kalervo HILTUNEN;过氧物酶体多功能酶2中固醇载体蛋白2结构域的功能[J];中国生物化学与分子生物学报;2002年05期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 孙婧;敬闰宇;吴镝;李梦龙;李益洲;;基于机器学习方法的结构域预测[A];第十一届全国计算(机)化学学术会议论文摘要集[C];2011年
2 孟刚;代方银;陈聪;鲁成;;WW结构域及相关蛋白在肿瘤发生中的作用[A];第十届家(柞)蚕遗传育种及良种繁育学术研讨会论文集[C];2013年
3 王长振;杨俊涛;周宇;丛建波;先宏;郭林超;唐丽;吴可;;LSECtin CRD结构域的运行性研究[A];第十一次中国生物物理学术大会暨第九届全国会员代表大会摘要集[C];2009年
4 李鹏云;丁怡;吴蓓丽;舒翠玲;沈倍奋;饶子和;;FKBP52 N端结构域的晶体结构[A];第九次全国生物物理大会学术会议论文摘要集[C];2002年
5 宋婀莉;田瑞;马素参;高友鹤;;PDZ结构域低丰度配体的筛选方法[A];中国蛋白质组学第三届学术大会论文摘要[C];2005年
6 应跃斌;宋见惠;陈枢青;;大肠杆菌T蛋白独立结构域的活性研究[A];浙江省生物化学与分子生物学学术交流会论文集[C];2005年
7 吕丹;张君;张毓;陈慰峰;;UNC5CL表达调控及诱导表达[A];第六届全国免疫学学术大会论文集[C];2008年
8 金美芳;丁向明;仇灏;吴士良;周迎会;;多肽:N-乙酰氨基半乳糖转移酶2原核与真核表达及其蓖麻蛋白样结构域同源建模[A];第八届全国复合糖生物化学与分子生物学学术会议论文摘要论文集[C];2004年
9 丰竹;张斌;刘谨;周严;周海军;彭小忠;袁建刚;强伯勤;;人ENCI的cDNA的克隆、表达与功能研究[A];中国生物化学与分子生物学会第八届会员代表大会暨全国学术会议论文摘要集[C];2001年
10 冯延琼;石亚伟;;以PDZ结构域为靶标的中药有机小分子配体筛选[A];第三届泛环渤海(七省二市)生物化学与分子生物学会——2012年学术交流会论文集[C];2012年
中国重要报纸全文数据库 前1条
1 记者 王春;我学者认知一个新的蛋白质结构域[N];科技日报;2004年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 黄小娟;剪切因子FBP21双WW结构域的溶液结构和生物学功能研究[D];中国科学技术大学;2009年
2 高诗娟;PDZ、SH2结构域结合特性的研究[D];中国协和医科大学;2006年
3 刘将新;LARG PDZ结构域在自由和复合物状态下结构与动力学的研究[D];中国科学技术大学;2008年
4 宋婀莉;高效研究多肽结合结构域结合特性新策略的建立及其应用[D];中国协和医科大学;2007年
5 王学军;乙型肝炎病毒侵染肝细胞相关表面蛋白结构域的鉴定[D];中国人民解放军军事医学科学院;2009年
6 王佳新;蛋白质结构域预测及唾液分泌蛋白质预测与应用研究[D];吉林大学;2013年
7 徐进新;SNX16和SNX11的结构生物学研究[D];中国科学技术大学;2012年
8 张小秦;泛素连接酶RNF168 RING结构域的结构和功能研究[D];中国科学技术大学;2014年
9 焦豫良;中国东海微生物来源新聚酮合酶基因簇/基因片段的筛选及其新酰基转移酶结构域的功能研究[D];第二军医大学;2008年
10 郭金虎;人类新基因识别与蛋白质结构域鉴定[D];复旦大学;2004年
本文关键词:Smurf1调控PIP5K1C蛋白稳定性及相关生物学功能的研究,由笔耕文化传播整理发布。
本文编号:350755
本文链接:https://www.wllwen.com/yixuelunwen/shiyanyixue/350755.html