基于MassARRAY的人多瘤病毒高通量检测方法的建立与应用

发布时间：2017-05-11 23:00

  本文关键词：基于MassARRAY的人多瘤病毒高通量检测方法的建立与应用，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：人多瘤病毒(human polyomaviruses, HPyVs)是一种在人体里广泛存在的病毒。早期的人多瘤病毒家族只有BK多瘤病毒(BK polyomavirus, BKPyV)和JC多瘤病毒(JC polyomavirus, JCPyV)两个成员,因其可在免疫功能不全的个体分别造成多瘤病毒肾炎和进行性多灶性白质脑病而被人们所关注。过去七年里,10种新型人多瘤病毒陆续被发现,其中除可引发默克细胞癌的默克细胞多瘤病毒(Merkel cell polyomavirus, MCPyV)及可引发Trichodysplasia spinulosa的TS多瘤病毒(Trichodysplasia spinulosa-associated polyomavirus, TSPyV)外,其余病毒的病原学角色均尚不明确。人多瘤病毒频繁在人粪便和胃肠道组织中被检出,特别是人多瘤病毒中最新的三个成员MW多瘤病毒(Malawi polyomavirus, MWPyV),STL多瘤病毒(Saint Louis polyomavirus, STLPyV)和人多瘤病毒12型(Human polyomavirus12, HPyV12)最初均被发现于粪便或消化系统器官组织中,这使得人多瘤病毒与人体胃肠道疾病,尤其是腹泻的关系引起人们关注。 本研究应用美国西格诺公司的基质辅助激光解析串联飞行时间质谱仪(MALDI-TOFMS)检测平台(MassARRAY),建立了一种基于多重PCR的高通量检测方法,可同时检测全部12种已知的人多瘤病毒。本实验运用该方法进行病例-对照研究,筛查了包含211份婴幼儿腹泻病人样本和208份正常婴幼儿样本在内的总计419份粪便样本。本研究在样本中筛查到五种人多瘤病毒：KI多瘤病毒(KI polyomavirus, KIPyV), WU多瘤病毒(WU Polyomavirus, WUPyV), MCPyV, MWPyV和STLPyV。结果显示人多瘤病毒在病例组和对照组中的检出率差异没有显著性；两组中MWPyV的病毒载量差异没有显著性(p0.05)；研究结果不支持人多瘤病毒作为腹泻相关病原体的猜测。此外,本研究获得了16条人多瘤病毒的全基因组序列,其中KIPyV,MCPyV, MWPyV和STLPyV的全基因组序列均为国内首次报道。本研究为深入开展人多瘤病毒的病原学研究和基因组进化提供了依据。
【关键词】：人多瘤病毒 腹泻 基质辅助激光解析电离飞行时间质谱 MassARRAY
【学位授予单位】：北京协和医学院
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2014
【分类号】：R373
【目录】：

• 目录3-4
• 摘要4-5
• Abstract5-6
• 前言6-9
• 材料与方法9-24
• 1. 样本9
• 2. 仪器9-10
• 3. 耗材10-11
• 4. 试剂与试剂盒11
• 5. 试剂配置11
• 6. 方法11-24
• 结果24-46
• 1. 基于MassARRAY的人多瘤病毒检测方法的特异性与敏感度验证24-26
• 2. 十二种人多瘤病毒与婴幼儿腹泻的相关性研究26-46
• 讨论46-50
• 文献综述50-61
• 1. 新型人多瘤病毒发现史概述50-56
• 2. 新人多瘤病毒与相关疾病研究进展56-61
• 参考文献61-68
• 硕士期间发表文章68-69
• 致谢69-71

【共引文献】

中国期刊全文数据库 前4条

1 蔡少平;刘泽;徐东平;;外周血单核细胞中HBV cccDNA检测的意义及进展[J];临床肝胆病杂志;2014年08期

2 程敬伟;王贺;徐英春;;基质辅助激光解吸附电离飞行时间质谱在临床病毒学中的应用[J];临床检验杂志;2014年09期

3 李蕊;刘学恩;庄辉;;石蜡包埋肝组织乙型肝炎病毒共价闭合环状DNA的检测及临床意义研究进展[J];中国病毒病杂志;2014年01期

4 韦开才;;重症手足口病合并神经源性肺水肿的诊治进展[J];中国当代医药;2014年03期

中国硕士学位论文全文数据库 前3条

1 林钟劝;滚环扩增快速检测HBV替诺福韦耐药突变位点研究[D];第三军医大学;2013年

2 张庆;深圳市手足口病的流行病学特征及其重症发生的危险因素研究[D];华中科技大学;2012年

3 孔雯骅;武汉地区人偏肺病毒的分子流行病学研究[D];华中科技大学;2013年

  本文关键词：基于MassARRAY的人多瘤病毒高通量检测方法的建立与应用，由笔耕文化传播整理发布。

，

本文编号：358217