幽门螺杆菌23srRNA基因突变与克拉霉素耐药性关系的研究

发布时间：2017-05-24 10:04

  本文关键词：幽门螺杆菌23srRNA基因突变与克拉霉素耐药性关系的研究，，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：目的通过对幽门螺杆菌(Helicobacter pylori, HP)23s rRNA基因突变位点分析,观察23s rRNA各突变点与克拉霉素耐药的关系。 方法分离培养HP、提取DNA、扩增其23s rRNA基因片段及测序；运用Clustal W软件进行序列比对找出突变点。选用GenBank中已全基因组测序的35株HP,根据其mutY、ppa、efp和urel4个管家基因建立Neighbour-joining树,根据进化树结果将35株HP分为欧非和东亚菌群；观察各突变点与菌群分布的关系。 结果与耐药有关的A2143G突变率为32.8%,T2182C突变率为90.6%但与耐药无关,其碱基分布具有菌群差异：东亚菌群以C碱基为主,欧非菌群以T为主(P0.05),其他可能与耐药有关的各位点分别为A2223G(6.25%)、T2190C(1.6%)、C2195T(1.6%)。 结论青岛地区HP克拉霉素耐药率为32.8%并表现为23s rRNA基因A2143G突变,而2182位点突变是由于菌群分布差异导致的与克拉霉素耐药无关。
【关键词】：幽门螺杆菌 克拉霉素 耐药 23s rRNA
【学位授予单位】：青岛大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2013
【分类号】：R378.2;Q75
【目录】：

• 中文摘要2-3
• Abstract3-5
• 引言5-6
• 第一章 材料和方法6-10
• 1.1 材料6
• 1.1.1 主要试剂6
• 1.1.2 主要仪器6
• 1.2 实验方法6-10
• 1.2.1 标本收集6
• 1.2.2 HP培养及鉴定6-7
• 1.2.3 HP基因组DNA的提取7-8
• 1.2.4 23s rRNA基因扩增及测序8
• 1.2.4.1 扩增目的片段8
• 1.2.4.2 凝胶电泳检测目的条带8
• 1.2.4.3 基因测序8
• 1.2.5 建立进化树8-9
• 1.2.6 序列分析9
• 1.2.7 统计分析9-10
• 第二章 实验结果10-16
• 2.1 PCR扩增产物及测序结果10-11
• 2.2 23s rRNA基因各突变位点及分布11-13
• 2.3 35株HP建立进化树及菌群分布13-14
• 2.4 突变位点与菌群分布的关系14-16
• 第三章 讨论16-18
• 第四章 结论18-19
• 参考文献19-22
• 综述22-35
• 参考文献30-35
• 攻读学位期间的研究成果35-36
• 致谢36-37

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本文编号：390431