长春市鼠类携带汉坦病毒的基因型分析

发布时间：2017-05-27 09:03

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【摘要】：目的了解长春市鼠类动物所携带的汉坦病毒基因型别。方法采集长春市地区鼠肺样品,应用免疫荧光法检测鼠肺中汉坦病毒抗原,提取阳性样本中病毒RNA,利用RT-PCR法扩增S基因片段,并测序,利用DNAman软件和Mega 6.0软件进行序列分析。结果在长春地区共捕获褐家鼠100只,检测到阳性样本3份,阳性率为3.0%。通过测序获得3株病毒的S基因片段序列,经同源性分析比较发现各序列间核苷酸同源性为100%,与其他汉城病毒(SEOV)核苷酸同源性在95.4%~100%之间,3株病毒全部为SEOV。系统发生树分析表明,3株病毒在同一组内,属于S3亚型。结论研究表明长春市褐家鼠中携带的汉坦病毒为SEOV型,S3亚型。
【作者单位】： 长春市疾病预防控制中心病毒检验科;吉林省疾病预防控制中心;
【关键词】： 汉坦病毒 反转录-聚合酶链反应 基因分型 汉城病毒
【分类号】：R373.3
【正文快照】： 肾综合征出血热(HFRS)是由汉坦病毒(Hantavirus,HV)感染引起的一种自然疫源性疾病[1]。HV属于布尼亚病毒科(Bunyavidae)汉坦病毒属的成员,基因组均由3个片段(L、M、S)构成,属于负链单股分节段的RNA,到目前为止,HV至少有23种不同的基因型,非正式命名的基因型有28种[2-3]。在这

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本文编号：399417