结核分枝杆菌Rv3134c蛋白抗原表位的预测

发布时间：2017-06-02 15:20

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【摘要】：目的预测结核分枝杆菌Rv3134c的抗原表位,了解其免疫学特性。方法利用DNAStar软件包中Protean软件对Rv3134c氨基酸序列进行分析,采用包括二级结构、亲水性、抗原性、表面可能性、柔韧性等多参数预测其二级结构及T细胞和B细胞抗原表位,最后BLAST分析其与人类抗原表位的同源性。结果 Rv3134c蛋白具有丰富的二级结构和多处抗原指数较高的区段,含有较多潜在的B细胞抗原表位,可能位于1-7、30-37、65-81、89-100、111-120、138-148、184-195、209-216、233-238位氨基酸残基或其附近,这些区域基本上含有β转角结构,亲水性、表面可能性和柔韧性指数都较高。该蛋白潜在的T细胞抗原表位较少,可能位于62-76、89-97、185-195、203-213、219-231、248-255位氨基酸残基或其附近。BLAST分析结果显示,其与人类抗原表位的同源性很低。结论结核分枝杆菌Rv3134c是一个即含有较多B细胞抗原表位又含有较多T细胞抗原表位的蛋白抗原,实验结果为该蛋白抗原表位的进一步研究与合成肽疫苗奠定了基础。
【作者单位】： 解放军第309医院全军结核病研究所;全军结核病防治重点实验室 结核病诊疗新技术北京市重点实验室;解放军第309医院呼吸科;
【关键词】： 结核分枝杆菌 Rvc蛋白 抗原表位 二级结构 预测
【基金】：国家重大传染病防治科技重大专项基金资助项目(No.2012ZX10003008002) 军队医学科技“十二五”重点项目(No.BWS11J050) 北京市科技创新基地培育与发展工程专项项目(No.Z141107004414021)~~
【分类号】：R378.911
【正文快照】： (1.Army Tuberculosis Control and Prevention Key Laboratory/Beijing Key Laboratory of Tuberculosis New Diagnosisand Treatment Technology/Institute of Tuberculosis Research,Beijing100091,China;2.Department of Respiratory Medicine,the 309th Hospital of Chin

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