PARP1、OGG1、XRCC1、XRCC2和XRCC3基因多态性与乳腺癌易感性的研究
发布时间:2022-01-23 20:03
乳腺癌是女性群体中发病率极高的恶性肿瘤,是多因素导致的复杂疾病,在乳腺癌发病机制的诸多理论中,遗传因素扮演了非常重要的角色。机体内的DNA修复系统对预防肿瘤的发生起着重要作用,DNA损伤修复基因的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)是导致个体修复能力差异的重要原因,而DNA损伤修复能力存在的个体差异进一步决定了肿瘤易感性。因此,针对DNA损伤修复基因展开其基因多态性与乳腺癌易感性的研究,探寻新的特异性分子标记对乳腺癌的早期诊断、治疗具有重要意义。本研究对5个DNA损伤修复基因PAPR1、OGG1、XRCC1、XRCC2、XRCC3进行SNPs基因分型,初步分析PAPR1、OGG1、XRCC1、XRCC2、XRCC3的SNP与乳腺癌临床病理参数之间的相关性,研究乳腺癌患者中PAPR1、OGG1、XRCC1、XRCC2、XRCC3的SNP位点不同基因型和单倍型与乳腺癌患病风险之间的相关性,并探究基因不同SNP位点互作与乳腺癌患病风险之间的相关性,为乳腺癌的早筛检测和预后评估提供参考依据。利用Meta分析方法选择出与乳腺癌易感性相关的5个...
【文章来源】:兰州大学甘肃省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:103 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
连锁不平衡热图
兰州大学硕士学位论文PARP1、OGG1、XRCC1、XRCC2和XRCC3基因多态性与乳腺癌易感性的研究66交互作用,其中rs1805408与rs3219110间交互作用较强,rs1805408和rs3219110位点之间的交互对乳腺癌发病风险可能具有重要影响。AC图3-2PARP1基因三个tagSNP之间的互作分析Figure3-2InteractionbetweenthreetagSNPsofPARP1A.图解模型;B.MDR饼图;C.MDR树形图3.5.1.2OGG1基因tagSNP之间的互作分析对OGG1两个多态性位点rs2072668、rs1052133进行交互作用分析,从MDR结果可以看出(表3-9),两个模型组合与乳腺癌易感性之间均不存在显著关联(P>0.05),因此,可推断OGG1基因这两个单核苷酸多态性位点之间不存在交互作用。B
兰州大学硕士学位论文PARP1、OGG1、XRCC1、XRCC2和XRCC3基因多态性与乳腺癌易感性的研究67AC图3-3XRCC1基因五个tagSNP之间的互作分析Figure3-3InteractionbetweenfivetagSNPsofXRCC1A.图解模型;B.MDR饼图;C.MDR树形图3.5.1.3XRCC1基因tagSNP之间的互作分析本研究中选取了XRCC1基因5个多态性位点rs25489、rs3213263、rs3213356、rs3213266和rs25487进行了MDR分析。从表3-9中可以看出,在SNP位点交互模型中,交叉验证一致性处于于5~10的区间,检验准确度值处于0.6364~0.6513区间。在5个组合中,XRCC1基因的rs3213263、rs3213356两位点模型为多态性位点之间相互作用的最佳模型,其具有最高的检验准确度(64.77%)以及最大的交叉验证一致性(Cross-validationconsistency=10),经统计分析发现rs3213263、rs1130409模型组合与乳腺癌易感性之间存在显著关联(P=0.0010),可推断出XRCC1的两个SNP位点之间可能存在着较强交互作用,并且该交互作用可能会升高乳腺癌的易感性。除此之外的其它模型,虽然也都有统计学意义(P=0.001),但是Cross-validationconsistency较低或预测误差较高,B
本文编号:3605063
【文章来源】:兰州大学甘肃省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:103 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
连锁不平衡热图
兰州大学硕士学位论文PARP1、OGG1、XRCC1、XRCC2和XRCC3基因多态性与乳腺癌易感性的研究66交互作用,其中rs1805408与rs3219110间交互作用较强,rs1805408和rs3219110位点之间的交互对乳腺癌发病风险可能具有重要影响。AC图3-2PARP1基因三个tagSNP之间的互作分析Figure3-2InteractionbetweenthreetagSNPsofPARP1A.图解模型;B.MDR饼图;C.MDR树形图3.5.1.2OGG1基因tagSNP之间的互作分析对OGG1两个多态性位点rs2072668、rs1052133进行交互作用分析,从MDR结果可以看出(表3-9),两个模型组合与乳腺癌易感性之间均不存在显著关联(P>0.05),因此,可推断OGG1基因这两个单核苷酸多态性位点之间不存在交互作用。B
兰州大学硕士学位论文PARP1、OGG1、XRCC1、XRCC2和XRCC3基因多态性与乳腺癌易感性的研究67AC图3-3XRCC1基因五个tagSNP之间的互作分析Figure3-3InteractionbetweenfivetagSNPsofXRCC1A.图解模型;B.MDR饼图;C.MDR树形图3.5.1.3XRCC1基因tagSNP之间的互作分析本研究中选取了XRCC1基因5个多态性位点rs25489、rs3213263、rs3213356、rs3213266和rs25487进行了MDR分析。从表3-9中可以看出,在SNP位点交互模型中,交叉验证一致性处于于5~10的区间,检验准确度值处于0.6364~0.6513区间。在5个组合中,XRCC1基因的rs3213263、rs3213356两位点模型为多态性位点之间相互作用的最佳模型,其具有最高的检验准确度(64.77%)以及最大的交叉验证一致性(Cross-validationconsistency=10),经统计分析发现rs3213263、rs1130409模型组合与乳腺癌易感性之间存在显著关联(P=0.0010),可推断出XRCC1的两个SNP位点之间可能存在着较强交互作用,并且该交互作用可能会升高乳腺癌的易感性。除此之外的其它模型,虽然也都有统计学意义(P=0.001),但是Cross-validationconsistency较低或预测误差较高,B
本文编号:3605063
本文链接:https://www.wllwen.com/yixuelunwen/waikelunwen/3605063.html
最近更新
教材专著