延边朝鲜族和汉族ARL15、TCF7L2和KCNJ11基因SNPs与2型糖尿病家系传递不平衡（TDT）分析

发布时间：2018-01-05 16:32

本文关键词：延边朝鲜族和汉族ARL15、TCF7L2和KCNJ11基因SNPs与2型糖尿病家系传递不平衡（TDT）分析　出处：《延边大学》2016年硕士论文　论文类型：学位论文

【摘要】：目的研究ADP-核糖基化样因子-15(ARL15)、转录因子7类似物2(TCF7L2),内向整流通道蛋白J亚单位11号成员基因CKCNJ11),三个基因单核苷酸多态性(SNPs)rs7903146、r26770、rs5219与延边朝鲜族和汉族人群2型糖尿病(T2DM)和合并大血管病变(MA)的相关性。方法收集延边地区T2DM家系113个(其中23个核心家系和90个散在家系)。采用连接酶检测反应(LDR)技术分析基因型；采用酶联免疫吸附法(ELISA)检测全部样本的血清ARL15、脂联素(PA)和胰岛素水平(INS)；利用全自动生化分析仪检测空腹血糖(FPG)、总胆固醇(TC)、甘油三酯(TG)、高密度脂蛋白(HDL-C)、低密度脂蛋白(LDL-C)；用彩色多普勒测定颈动脉内膜-中膜厚度(IMT)；应用Faleoner回归法计算延边地区朝鲜族和汉族T2DM的一级亲属遗传率、penrose法判断遗传方式、SNP Assistant version 1.0.11软件进行T2DM核心家系中传递不平衡(TDT)检验和等位基因频率和基因型频率；同时全部样本检测了身高、体重、腰围、臀围、血压,计算体重指数(BMI)和腰臀比(WHR)。结果1.遗传率估计结果：散在人群T2DM的总遗传率为51.2%,其中朝鲜族为41.6%,汉族为48.8%,汉族略高于朝鲜族,差异无统计学意义(p0.05)。核心家系的总遗传率为110.8%,朝鲜族(123.4%)显著高于汉族(106.7%)(70.046)；2.遗传方式分析结果：散在样本观察值男性和女性分别为2.936和3.11,均在多基因遗传期望值范围2.71和2.875,核心家系样本观察值男性和女性分别4.125和4.05,性别之间无显著性差异(p0.05),均在常染色体显性遗传期望值范围3.676和4.132；3.等位基因频率和基因型频率分布结果：携带rs26770多态的GG基因型在T2DM组及MA组频率显著高于NGT组,与NGT组之间的差异具有统计学意义(p1=0.032,p2=0.015),同时罹患T2DM风险增高7倍(OR=7,95%CI: 0.855-7.312),罹患MA风险增高8.448倍(OR=8.448,95%CI：1.037-8.808)。在T2DM组与MA组都表现为隐性模式；rs7903146和rs5219两位点的等位基因频率和基因型频率在T2DM组及MA组与NGT组无显著性差异(p0.05)；4.临床指标关联分析结果：携带rs7903146 CT基因型个体ARL15、WHR水平显著高于CC个体(p=0.05),INS水平显著低于CC个体。未见rs26770及rs5219两个SNP的各种等位基因及基因型与临床指标存在显著性差异(p＞0.05)；5.核心家系的TDT分析结果：在rs7903146、rs26770及rs5219三个位点等位基因传递给患病子女的两个不同等位基因概率均未偏离50%(均p＞0.05)；6.联合基因型分析结果：联合基因型GG-CT-CC在MA组频率显著大于NGT组(p=0.022,OR=1.897, 95%CI:0.931-1.012), AG-CT-CC在MA组频率显著性大于T2DM组(p=0.03, OR=3.319,95%CI:1.381-9.326)。结论1.散在的T2DM一级亲属遗传率为51.2%,具有多基因遗传特征；但在T2DM的核心家系遗传率为110.8%,遗传率非常高,呈常染色体显性遗传特征,发病与遗传高度相关。2.ARL 15基因rs26770位点的基因型GG是延边地区人群罹患T2DM及合并MA危险基因型,可增加T2DM患病风险位7倍,增加合并MA患病风险8.448倍,都呈隐性遗传模式。3 TCF7L2基因rs7903146位点的CT基因型通过上调ARL15水平,下调INS水平,增加WHR而促进罹患T2DM和合并MA风险。4 TCF7L2.ARL15.KCNJ11基因的(rs7903146、rs26770、rs5219)3个基因是延边地区朝鲜族和汉族罹患T2DM合并大MA易感的微效基因,联合基因型GG-CT-CC累加使T2DM合并MA风险提高1.897倍,而累加AG-CT-CC基因型个体可使T2DM患者并发MA风险增加3.319倍。
[Abstract]:Objective To study the correlation between the polymorphism of human body weight ( FPG ) , total cholesterol ( TC ) , triglyceride ( TG ) , high density lipoprotein ( HDL - C ) and low density lipoprotein ( LDL - C ) . There was no significant difference in allele frequencies and genotype frequencies between the two SNPs of rs7903146 , rs26770 and rs5219 ( p > 0.05 ) . Results : The frequencies of alleles and genotype frequencies of rs7903146 , rs26770 and rs5219 were significantly higher than those of CC individuals ( p > 0.05 ) ; 5 . The results of association analysis showed that the frequencies of genotype GG - CT - CC in MA group were significantly higher than those in group 2 ( p = 0 . 022 , OR = 1.8995 % CI : 0.931 - 1.012 ) , and that of AG - CT - CC was significantly higher than that in T2DM group ( p = 0.03 , OR = 3.319 , 95 % CI : 1.381 - 9.326 ) . Conclusion : 1 . The genetic rate of the first - degree relatives of T2DM is 51.2 % , and it has many genetic characteristics , but the genetic rate is 110.8 % in the core family of T2DM , and the genetic rate is very high .

【学位授予单位】：延边大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2016
【分类号】：R587.2;R543

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