DOCK7、PCSK9和GALNT2基因单核苷酸多态性与血脂水平的关联研究

发布时间：2018-02-27 23:50

本文关键词：胞质分裂作用因子7(DOCK7) 前蛋白转化酶枯草溶菌素9(PCSK9) N-乙酰氨基半乳糖转移酶2(GALNT2) 基因单核苷酸多态性血脂水平胞质分裂作用因子7(DOCK7) 前蛋白转化酶枯草溶菌素9(PCSK9) N-乙酰氨基半乳糖转移酶2(GALN　出处：《广西医科大学》2017年博士论文　论文类型：学位论文

【摘要】：研究背景:动脉粥样硬化(atherosclerosis,AS)是危害人类健康最严重的疾病之一。在西方国家的死亡原因中,由AS引起的心脑血管病包括动脉粥样硬化性心血管疾病(ASCVD)占首位。对于部分心血管疾病风险高的患者,即使应用他汀类药物强化治疗降低低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)水平,使其达标,同时积极改善生活方式(戒烟及低盐低脂饮食等)并控制血压血糖达标,其发生心血管事件风险仍然高,即所谓心血管事件的“剩余风险”,原因可能与其他脂质代谢,如甘油三酯(TG)、高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)及脂蛋白a等相关联。近年来,人们一直致力于寻找及研发干预这些脂质代谢的相应措施,以期进一步降低心血管事件的发生,TG为冠心病(CHD)独立危险因素的价值提升。脂质代谢受遗传因素和环境因素如人口特征、膳食、生活方式(吸烟、饮酒、体力活动)、肥胖、高血压等影响。家族和双胞胎研究显示遗传多态性可以解释40-60%个体血脂水平差异。有研究表明,脂质代谢的遗传变异具有多效性和种族/民族特异性。因此,了解某一特定人群的血脂水平和血脂异常患病率,探讨某些环境和遗传因素对血脂水平和高脂血症患病率的影响,为该人群血脂异常及其并发症的防治提供理论依据。大规模的全基因组广泛关联研究(GWASs)显示在西方人群中几种基因(DOCK7、PCSK9和GALNT2)单核苷酸多态性与脂质代谢有关系,并且这种关联具有多效性。然而,在我国南方人群中DOCK7、PCSK9和GALNT2基因多态性与脂质代谢关联研究尚未见有报道。第一部分广西京族和汉族人群DOCK7、PCSK9和GALNT2基因单核苷酸多态性与血脂水平的关联研究目的:本研究旨在了解广西京族和汉族人群血脂水平分布情况;探讨DOCK7、PCSK9和GALNT2基因单核苷酸多态性(DOCK7 rs1168013GC,DOCK7 rs10889332 CT,PCSK9 rs615563 GA,PCSK9 rs7552841CT,PCSK9 rs11206517 TG,GALNT2 rs1997947 GA,GALNT2rs2760537 CT,GALNT2 rs4846913 CA,and GALNT2 rs11122316 GA SNPs)与血脂水平的关系。方法:在聚居于广西东兴市巫头、山心和万尾岛的京族和汉族居民中,按国际流行病学的调查方法,随机抽取祖宗三代均为京族的881位居民作为研究对象。进行病史、饮食、生活方式、社会经济状况、体力活动等资料采集和常规的体格检查,记录身高,体重,体重指数,腰围,血压值以及吸烟,饮酒等情况,抽血测定TC(血清总胆固醇),TG(甘油三酯),HDL-C(高密度脂蛋白胆固醇),LDL-C(低密度脂蛋白胆固醇),载脂蛋白(Apo)A1、ApoB、ApoA1/ApoB比值和血糖水平;用聚合酶链式反应和限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)等方法对DOCK7、PCSK9和GALNT2基因9个单核苷酸多态性位点进行检测,基因型结果用PCR产物直接测方法进行验证,分析它们与血脂水平的关系,并与当地988位祖宗三代均为汉族的居民作比较。结果:广西京族人群DOCK7 rs1168013、rs10889332,PCSK9rs615563、rs7552841、rs11206517和GALNT2 rs1997947、rs2760537、rs4846913、rs11122316 SNPs的基因型和等位基因频率与汉族人群比较差异有统计学意义(P0.05)。广西京族几个基因单核苷酸多态性与甘油三酯(TG,rs10889332,rs615563,rs7552841,rs1997947,rs2760537, rs4846913和rs11122316),高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C,rs1997947),低密度脂蛋白胆固醇(LDL,rs1168013和rs7552841),载脂蛋白A1(Apo A1,rs1997947),载脂蛋白B(Apo B,rs10889332和rs7552841),载脂蛋白A1/载脂蛋白B比值(Apo A1/Apo B,rs7552841)水平比较差异有统计学意义(P0.05/9,P值经Bonferroni校正)。汉族人群几个基因单核苷酸多态性与TG(rs10889332,rs615563,rs7552841,rs11206517,rs1997947,rs4846913和rs11122316),HDL-C(rs11206517和rs4846913),LDL-C(rs1168013),Apo A1(rs11206517和rs4846913),Apo B水平(rs7552841)和Apo A1/Apo B比值(rs4846913)比较差异也具有统计学意义(P0.05/9,P值经Bonferroni校正)。以上9个存在连锁不平衡,每一个位点都不是独立存在的,而是交互作用协同影响脂质代谢。最常见的单倍型是G-C-G-C-T-G-C-C-G(DOCK7 rs1168013 GC,DOCK7rs10889332 CT,PCSK9 rs615563 GA,PCSK9 rs7552841 CT,PCSK9rs11206517 TG,GALNT2 rs1997947 GA,GALNT2 rs2760537 CT,GALNT2 rs4846913 CA和GALNT2 rs11122316 GA SNPs顺位),为全单倍型频率10%以上。在两个群体中C-C-G-C-T-G-T-C-G,G-C-A-C-TG-C-C-G,G-C-G-C-T-A-C-C-A,G-C-G-C-T-G-C-C-A,G-C-G-C-T-G-TC-A单倍型的频率差异有统计学差异。单倍型可以解释比任何单个单核苷酸多态性更多的脂质代谢变异。两个群体之间脂质谱的差异可能部分归因于这些SNP和它们的单倍型。结论:广西京族人群DOCK7、PCSK9和GALNT2基因单核苷酸多态性与血脂水平的关联与当地汉族人群比较有显著差异。揭示DOCK7、PCSK9和GALNT2基因单核苷酸多态性与血脂水平关联可能具有民族特异性。第二部分DOCK7、PCSK9和GALNT2基因单核苷酸多态性与血脂水平的性别特异性关联研究目的:旨在了解广西京族人群和汉族人群DOCK7、PCSK9和GALNT2基因单核苷酸多态性(DOCK7 rs1168013 GC,DOCK7rs10889332 CT,PCSK9 rs615563 GA,PCSK9 rs7552841 CT,PCSK9rs11206517 TG,GALNT2 rs1997947 GA,GALNT2 rs2760537 CT,GALNT2 rs4846913 CA,and GALNT2 rs11122316 GA SNPs)与血脂水平的关联是否存在性别特异性。方法:研究对象为聚居于广西东兴市巫头、山心和万尾岛的992位男性和877位女性居民。进行病史、饮食、生活方式、社会经济状况、体力活动等资料采集和常规的体格检查,记录身高,体重,体重指数,腰围,血压值以及吸烟,饮酒等情况,抽血测定TC(血清总胆固醇),TG(甘油三酯),HDL-C(高密度脂蛋白胆固醇),LDL-C(低密度脂蛋白胆固醇),载脂蛋白(Apo)A1、Apo B、Apo A1/Apo B比值和血糖水平;用聚合酶链式反应和限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)等方法对DOCK7、PCSK9和GALNT2基因9个单核苷酸多态性位点进行检测,基因型结果用PCR产物直接测方法进行验证,在对民族进行校正后分析它们与血脂水平的关系。结果:男性血清HDL-C水平低于女性(P0.001)。男女性之间DOCK7 rs1169013,PCSK9 rs11206517,GALNT2 rs1997947,GALNT2rs48946913基因型频率和PCSK9 rs11206517,GALNT2 rs1997947,GALNT2 rs48946913等位基因频率比较差异有统计学意义(P0.001-0.05)。男性基因型间TC(PCSK9 rs615563和PCSK9 rs7552841),TG(DOCK7 rs10889332,PCSK9 rs615563,PCSK9 rs7552841,PCSK9rs11206517,GALNT2 rs1997947,GALNT2 rs2760537和GALNT2rs4846913),HDL-C(DOCK7 rs1168013和GALNT2 rs1997947),LDL-C(PCSK9 rs615563和PCSK9 rs7552841),Apo A1(PCSK9rs7552841,GALNT2 rs1997947和GALNT2 rs4846913),Apo B(PCSK9rs615563,PCSK9 rs7552841和PCSK9 rs11206517)水平和Apo A/Apo B(GALNT2 rs1997947和GALNT2 rs4846913)比值比较差异有统计学意义(P0.05/9,P值经Bonferroni校正)。女性基因型间TC(DOCK7rs10889332,PCSK9 rs7552841和GALNT2 rs2760537),TG(DOCK7rs10889332,PCSK9 rs615563,PCSK9 rs7552841,PCSK9 rs11206517,GALNT2 rs1997947,GALNT2 rs2760537和GALNT2 rs4846913),HDL-C(PCSK9 rs615563,PCSK9 rs11206517,GALNT2 rs1997947和GALNT2rs4846913),LDL-C(DOCK7 rs10889332和PCSK9 rs7552841),Apo A1(GALNT2 rs1997947和GALNT2 rs4846913),Apo B(DOCK7rs10889332和PCSK9 rs7552841)水平和Apo A/Apo B(PCSK9 rs7552841和GALNT2 rs4846913)比值比较差异有统计学意义(P0.05/9,P值经Bonferroni校正)。虽然男性与女性之间DOCK7、PCSK9和GALNT2基因单核苷酸多态性与血脂水平关联,但这种关系的趋势在男性女性之间显示出一致性,突变基因型携带者的血脂水平高于野生型基因型。结论:男性与女性之间DOCK7、PCSK9和GALNT2基因单核苷酸多态性与血脂水平的关系存在差异,揭示DOCK7、PCSK9和GALNT2基因单核苷酸多态性与血脂水平的关联具有性别特异性。第三部分DOCK7、PCSK9和GALNT2基因单核苷酸多态性与血脂异常的关联研究目的:本研究的目的在于探讨DOCK7、PCSK9和GALNT2基因单核苷酸多态性(DOCK7 rs1168013 GC,DOCK7 rs10889332 CT,PCSK9rs615563 GA,PCSK9 rs7552841 CT,PCSK9 rs11206517 TG,GALNT2rs1997947 GA,GALNT2 rs2760537 CT,GALNT2 rs4846913 CA,and GALNT2 rs11122316 GA SNPs)与血脂异常(高胆固醇血症HCH和高甘油三酯血症HTG)易感性的关联;探讨DOCK7、PCSK9和GALNT2基因单核苷酸多态性及其单倍型与血脂异常(高胆固醇血症HCH和高甘油三酯血症HTG)易感性的关联。探讨基因-基因交互作用对血脂异常(高总胆固醇血症HCH和高甘油三酯血症HTG)易感性的影响。方法:研究对象为999例高脂血症患者(TC5.17毫摩尔/升或者TG1.70毫摩尔/升;其中,TC5.17毫摩尔/升为高总胆固醇血症733例;TG1.70毫摩尔/升为高甘油三酯血症540例)和870非高脂血症者(TC≤5.17毫摩尔/升并且TG≤1.70毫摩尔/升)。进行病史、饮食、生活方式、社会经济状况、体力活动等资料采集和常规的体格检查,记录身高,体重,体重指数,腰围,血压值以及吸烟,饮酒等情况,抽血测定TC(血清总胆固醇),TG(甘油三酯),HDL-C(高密度脂蛋白胆固醇),LDL-C(低密度脂蛋白胆固醇),载脂蛋白(Apo)A1、ApoB、ApoA1/ApoB比值和血糖水平;用聚合酶链式反应和限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)等方法对DOCK7、PCSK9和GALNT2基因9个单核苷酸多态性位点进行检测,基因型结果用PCR产物直接测方法进行验证,在对民族、性别、年龄等进行校正后分析它们与血脂异常的关系。采用GMDR软件进行基因-基因交互模型构建,并且评估其准确性。结果:高总胆固醇血症(HCH)患者与非高总胆固醇血症者(nonHCH)之间DOCK7 rs1168013,DOCK7 rs10889332,PCSK9 rs615563,PCSK9 rs7552841,GALNT2 rs1997947,GALNT2 rs2760537和GALNT2rs4846913基因型频率以及DOCK7 rs10889332,PCSK9 rs615563,PCSK9 rs7552841,GALNT2 rs1997947,GALNT2 rs2760537和GALNT2rs4846913等位基因频率比较差异有统计学意义。(P0.05)高甘油三酯血症(HTG)患者与非高甘油三酯血症者(non-HTG)之间DOCK7rs10889332,PCSK9 rs615563,PCSK9 rs7552841,PCSK9 rs11206517,GALNT2 rs1997947,GALNT2 rs2760537,GALNT2 rs4846913和GALNT2rs11122316基因型频率以及DOCK7 rs10889332,PCSK9 rs615563,PCSK9 rs7552841,PCSK9 rs11206517,GALNT2 rs1997947,GALNT2rs2760537,GALNT2 rs4846913和GALNT2 rs11122316等位基因频率比较差异有统计学意义。(P0.05)9个位点彼此存在连锁不平衡,每一个位点都不是独立存在的,而是交互作用协同影响血脂异常易感性。单倍型C-C-G-C-T-G-C-C-G(以DOCK7 rs1168013 GC,rs10889332 CT,PCSK9 rs615563 GA,rs7552841 CT,rs11206517 TG,GALNT2 rs1997947 GA,rs2760537 CT,rs4846913 CA和rs11122316 GA SNPs顺位)与HCH和HTG的患病风险增加相关。单倍型C-C-G-C-TG-C-C-A和G-C-G-T-T-G-T-C-G与HCH和HTG的患病风险降低相关。单倍型G-C-G-C-T-G-C-C-A和G-C-G-C-T-G-T-C-G与HCH的患病风险增加相关。单倍型C-T-G-C-T-G-C-C-G,G-C-A-C-T-G-C-C-G和G-C-GC-T-G-C-C-A与HTG的患病风险增加相关。单倍型G-C-G-C-T-G-T-C-A和G-C-G-T-T-G-T-C-G与HTG患病风险降低相关。此外,还提示DOCK7,PCSK9和GALNT2 SNPs之间的可能存在基因-基因交互作用。二个单核苷酸多态性位点和三个单核苷酸多态性位点交互模型为预测HCH/HTG患病风险的最佳模型(P0.05)。结论:已报道在欧洲人群与脂质代谢显著相关的DOCK7、PCSK9和GALNT2基因,几个单核苷酸多态性在广西血脂异常和正常血脂水平人群中显示与血脂水平关联。我们还发现DOCK7、PCSK9和GALNT2基因之间的单核苷酸多态性位点交互作用对血脂水平产生影响。然而,仍需要更深入的分子细胞机制研究来阐明DOCK7、PCSK9和GALNT2基因单核苷酸多态性在脂质代谢途径的功能作用。
[Abstract]:......
【学位授予单位】：广西医科大学
【学位级别】：博士
【学位授予年份】：2017
【分类号】：R54

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