DVT患者外周血差异表达circRNA的筛选验证及互作网络分析

发布时间：2021-11-09 23:09

　　[目的]深静脉血栓形成（DVT）是骨科大手术后较常见的并发症,尤其是髋膝关节置换术后,由于患者腿部静脉血流瘀滞、内皮损伤以及凝血级联异常激活,没有抗凝治疗的情况下,DVT发病率明显提高。针对DVT分子生物学水平的调控机制,国内外进行了许多研究,发现一些微小RNA（miRNA）与DVT发生发展相关,但其调控网络需进一步发掘完善。随着对非编码RNA（ncRNA）深入研究,发现环状RNA（circRNA）在血栓性疾病领域具有较强的创新意义,为临床诊疗提供了新的研究方向。本项研究通过circRNA芯片技术检测DVT患者与对照组外周血中circRNA的表达,筛选出差异表达的circRNA。采用实时定量逆转录聚合酶链反应（qRT-PCR）选定circRNA对芯片结果进行验证。通过生物信息学（Bioin-formatics）手段,包含基因本体（GO）分析和基因与基因组百科全书（KEGG）通路分析预测差异表达circRNA的功能。为候选circRNA构建circRNA-miRNA-mRNA预测网络,丰富miRNA数据。为寻找特异性强、灵敏度高的分子标志物 以预测DVT发生、监测DVT进程、评估病情及预... 

【文章来源】：昆明医科大学云南省

【文章页数】：61 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图１?ｃｉｒｃＲＮＡ生物发生模型??Ｊｅｃｋ等也认为外显子型ｃｉｒｃＲＮＡ形成的机制有套索驱动的环化和内含子配??对驱动的环化［１９］

１８?｜?，?＞?１?１?，?，???１６?－??￡??１４?－??受??？書?１２?－??Ｑ??＂§?１０?－??．Ｎ??＂ｔｏ??ｇ?８??Ｍ?ｆ?ｌ?ｉ?Ｉ?Ｈ??４?Ａ?Ｂ?Ｎ１?Ｎ３?Ｎ４?Ｃ??ｓａｍｐｌｅｓ??图３?ＤＶＴ组与对照组差异表达ｃｉｒｃＲＮＡ箱形图??对筛查的ｃｉｒｃＲＮＡ进行层次聚类分析，绘制差异表达ｃｉｒｃＲＮＡ的分层聚类??图（图４），以显示６个样本（即３个ＤＶＴ患者和３个对照志愿者）中可区分的??ｃｉｒｃＲＮＡ表达谱。红色表示相对高表达，绿色表示相对低表达。表达程度相近的??样品更易聚类，据此分析不同样品之间的关系。??Ｃｏｌｏｒ?Ｋｅｙ??ａｎｄ?Ｈｉｓｔｏｇｒａｍ??ｉｍｍ?Ｉ??６?７?８?９?ｊ??ｊ??Ｖａｌｕｅ??ｊ??—…??５３１?＾?５＝＊?＾?＾??￥?８?在?｜?｜?｜??〇?＜?ｍ?〇?ｏ?ｏ??ｃｏ＂?＾??图４?ＤＶＴ组与对照组差异表达ｃｉｒｃＲＮＡ分层聚类图??２２??

图３?ＤＶＴ组与对照组差异表达ｃｉｒｃＲＮＡ箱形图??

【参考文献】：
期刊论文
[1]深静脉血栓形成炎症信号通路研究进展[J]. 顾燕妮,谢春毅.  中国免疫学杂志. 2020(01)
[2]创伤后深静脉血栓形成中的黏着斑激酶信号通路[J]. 莫建文,胡海澜,白波,李颖,张姝江,陈艺,邓晋京.  中国组织工程研究与临床康复. 2011(15)



本文编号：3486080