同源不同辐射抗拒NPC细胞间总甲基化水平及基因甲基化表达差异的探讨

发布时间：2017-12-27 11:16

本文关键词：同源不同辐射抗拒NPC细胞间总甲基化水平及基因甲基化表达差异的探讨　出处：《中国病理生理杂志》2015年07期 　论文类型：期刊论文

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【摘要】：目的:比较同源不同辐射抗拒能力的鼻咽癌细胞CNE2R/CNE2间总甲基化水平及其区域的差异。方法:采用赵存友博士改良的基于甲基化敏感酶全基因组甲基化法检测CNE2R/CNE2细胞全基因组甲基化水平;同时采用Me DIP-Seq测序法对CNE2R/CNE2细胞进行测序,分析比较DNA甲基化区域(主要包括6个基因功能元件即CDS、intron、downstream2k、upstream2k、3’UTR及5’UTR)的差异。结果:CNE2R细胞全基因组甲基化水平比CNE2细胞低约30%;在CNE2R和CNE2细胞中,虽然分布在6个基因功能元件上的峰值个数和峰值在各基因元件上的覆盖度均无明显差异,但2种细胞的6个基因功能元件上基因甲基化存在差异。结论:同源不同辐射抗拒能力的鼻咽癌细胞间总甲基化水平及基因甲基化存在差异,推测DNA甲基化的差异可能与鼻咽癌辐射抗拒相关。
[Abstract]:Objective: To compare the total methylation level and regional difference between CNE2R/CNE2 in nasopharyngeal carcinoma cells with different homologous radiation resistance. Methods: Dr. Zhao Cunyou improved methyl detection of CNE2R/CNE2 cell genomic DNA methylation levels of genomic DNA methylation sensitive enzyme method based on the sequence of CNE2R/CNE2 cells; at the same time using Me DIP-Seq sequencing method, a comparative analysis of DNA methylation (including 6 genes: CDS, intron, functional elements downstream2k, upstream2k, 3 'UTR and 5' UTR) difference. Results: the CNE2R cell genome methylation level about 30% lower than CNE2 cells; in CNE2R and CNE2 cells, while the peak number and peak distribution in the 6 gene functional elements covered in each element of the gene had no significant difference, but the 6 gene functional elements of 2 kinds of cells on gene methylation the existence of differences. Conclusion: there is difference in the total methylation level and gene methylation between nasopharyngeal carcinoma cells with different radiation resistance. It is speculated that the difference of DNA methylation may be related to radiative resistance of nasopharyngeal carcinoma.
【作者单位】：中山大学中山医学院;中山大学中山医学院病理生理学教研室;南方医科大学基础医学院医学遗传学教研室;
【基金】：国家自然科学基金资助项目(No.81071837;No.81372410) 广东省自然科学基金重点项目(No.92510089;No.01000005) 国家大学生创新训练计划项目(No.201310558074;No.201210558076) 广东省大学生创新训练项目(No.1055813171)
【分类号】：R739.63
【正文快照】： 目前放疗仍为鼻咽癌(nasopharyngeal carcino-ma,NPC)的首选疗法,但是放疗引发的辐射抗拒严重制约NPC病人5年生存率的提高[1],而NPC辐射抗拒机制至今尚未阐明。近年表观遗传调控特别是DNA甲基化因其作用位点广泛且调控结果可逆等特性而备受关注,已有研究报道DNA甲基化与肿瘤的

【参考文献】